為同時(shí)獲得空間表達(dá)和組織學(xué)背景信息，該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進(jìn)行組織學(xué)染色和成像，然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進(jìn)行表達(dá)定量。由于FFPE樣本通常存在RNA高度降解的問(wèn)題，針對(duì)FFPE樣本的Visium空間基因表達(dá)解決方案無(wú)法像新鮮凍存組織樣本一樣利用完整mRNA具有的poly（dA）序列進(jìn)行mRNA捕獲。該方案采用針對(duì)編碼基因的成對(duì)RNA模板連接探針（RTL）與mRNA雜交。左側(cè)探針（LHS）具有部分Read 2序列，右側(cè)探針（RHS）具有合成的poly(A)序列。左右探針與mRNA雜交后彼此連接，而mRNA被RNase降解。組織透化后，被連接的成對(duì)探針與芯片上包含空間Barcode、UMI和poly(dT）序列的引物序列捕獲，并且空間Barcode和UMI序列被延伸到成對(duì)探針序列上。攜帶空間Barcode的探針序列用于進(jìn)行測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序。測(cè)序序列上的空間Barcode用于將測(cè)序序列定位到組織切片圖像上，UMI用于基因表達(dá)定量。烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測(cè)序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。溫州BD空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
相比于常規(guī)的測(cè)序手段，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序有幾個(gè)明顯的優(yōu)勢(shì)：1.將轉(zhuǎn)錄組信息與空間信息對(duì)應(yīng)，體現(xiàn)組織內(nèi)部的異質(zhì)性：每個(gè)區(qū)域獨(dú)特的條形碼使測(cè)序結(jié)果與空間位置形成一一對(duì)應(yīng)關(guān)系。雖然暫時(shí)還無(wú)法精細(xì)到單細(xì)胞層面，但是這樣的區(qū)域劃分也已經(jīng)足以展現(xiàn)出組織內(nèi)部不同區(qū)域間的轉(zhuǎn)錄組差異。2.不影響對(duì)全組織進(jìn)行分析：芯片上捕獲的全轉(zhuǎn)錄組在同一個(gè)反應(yīng)中完成測(cè)序，能有效降低多次重復(fù)實(shí)驗(yàn)中的誤差。測(cè)序結(jié)果如果不按照條形碼歸類，則直接體現(xiàn)的是切片全組織的轉(zhuǎn)錄組情況，無(wú)需再做單獨(dú)檢測(cè)。3.為進(jìn)一步的研究提供指導(dǎo)意見(jiàn)：常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，對(duì)后續(xù)實(shí)驗(yàn)的指導(dǎo)仍然停留在全組織層面。而空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序則可以標(biāo)識(shí)出更有價(jià)值的研究區(qū)域，引導(dǎo)研究者將組織進(jìn)一步細(xì)分。寧波高通量測(cè)序空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化烈冰科技已建立了基于空間轉(zhuǎn)錄組的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)多平臺(tái)。
烈冰與國(guó)內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作，服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu)，1000+客戶和5000+重要科研項(xiàng)目，助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國(guó)際學(xué)術(shù)期刊（不完全統(tǒng)計(jì)），在單細(xì)胞領(lǐng)域，烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇，總IF＞300+，IF＞10+以上文章占比65%以上，包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國(guó)際主流學(xué)術(shù)期刊，已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制，免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。
10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)通過(guò)將組織切片的高通量mRNA分析和形態(tài)學(xué)背景整合，使基因表達(dá)譜可以被定位回它們的原始空間位置。傳統(tǒng)的空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)局限于冰凍組織切片。10x Genomics推出全新的針對(duì)FFPE樣本的Visium空間基因表達(dá)解決方案，該技術(shù)打破從FFPE組織樣本中獲取空間全部轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)信息的壁壘，能夠從FFPE樣本中獲取高靈敏度、高特異性的相關(guān)基因的表達(dá)信息，在形態(tài)學(xué)背景下實(shí)現(xiàn)真正的探索發(fā)現(xiàn)，進(jìn)一步擴(kuò)展空間生物學(xué)的可能性?？臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是高通量測(cè)序下的又一重大技術(shù)突破。
基因測(cè)序是基因檢測(cè)的方法之一，其又叫基因譜測(cè)序，是國(guó)際上公認(rèn)的一種基因檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變，一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸序列進(jìn)行測(cè)定，被稱為下一代測(cè)序技術(shù)(nextgenerationsequencing)，足見(jiàn)其劃時(shí)代的改變，同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測(cè)序(deepsequencing)?；驕y(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用，可以說(shuō)，基因測(cè)序技術(shù)將是下一個(gè)改變世界的技術(shù)。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000，開啟更大通量測(cè)序新紀(jì)元。無(wú)錫烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)
高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次翻天覆地的改變，一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸序列進(jìn)行測(cè)定。溫州BD空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
高通量測(cè)序技術(shù)（High-throughputsequencing）又稱“下一代”測(cè)序技術(shù)（“Next-generation”sequencing），以能一次并行對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定和一般讀長(zhǎng)較短等為標(biāo)志。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變，一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定，因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測(cè)序技術(shù)(nextgenerationsequencing)足見(jiàn)其劃時(shí)代的改變，同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測(cè)序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，已助力Nature，immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。溫州BD空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家有著雄厚實(shí)力背景、信譽(yù)可靠、勵(lì)精圖治、展望未來(lái)、有夢(mèng)想有目標(biāo)，有組織有體系的公司，堅(jiān)持于帶領(lǐng)員工在未來(lái)的道路上大放光明，攜手共畫藍(lán)圖，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠(chéng)的客戶粉絲源，也收獲了良好的用戶口碑，為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ)，也希望未來(lái)公司能成為*****，努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻(xiàn)出自己的一份力量，我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強(qiáng)不息，斗志昂揚(yáng)的的企業(yè)精神將**上海烈冰生物醫(yī)藥科技供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌，共創(chuàng)佳績(jī)，一直以來(lái)，公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠(chéng)實(shí)守信的方針，員工精誠(chéng)努力，協(xié)同奮取，以品質(zhì)、服務(wù)來(lái)贏得市場(chǎng)，我們一直在路上！