溫州scRNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-09-02

細(xì)胞是構(gòu)成生命的基礎(chǔ)單元,迅速發(fā)展的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)為在單細(xì)胞層面研究細(xì)胞功能及其背后的基因調(diào)控機(jī)制提供了重要的技術(shù)手段,單細(xì)胞測(cè)序可用于檢測(cè)多種不同的組學(xué)種類,包括轉(zhuǎn)錄組、染色質(zhì)開放組、DNA甲基化組、組蛋白修飾組等等,對(duì)不同組學(xué)技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析有助于更地刻畫細(xì)胞內(nèi)的基因調(diào)控狀態(tài)、揭示調(diào)控機(jī)制。然而,與傳統(tǒng)的bulk數(shù)據(jù)相比,單細(xì)胞數(shù)據(jù)具有規(guī)模大、噪聲高、異構(gòu)性強(qiáng)等特點(diǎn),如何通過開發(fā)新的計(jì)算方法實(shí)現(xiàn)對(duì)這些寶貴數(shù)據(jù)的有效利用已成為當(dāng)今生物信息學(xué)領(lǐng)域關(guān)注的重點(diǎn)與熱點(diǎn)。隨著單細(xì)胞多組學(xué)的不斷進(jìn)步, 研究者將有機(jī)會(huì)在單細(xì)胞分辨率下進(jìn)一步理解個(gè)體發(fā)育以及疾病發(fā)展機(jī)制。溫州scRNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持

高通量測(cè)序技術(shù)(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測(cè)序技術(shù)(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對(duì)幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定和一般讀長(zhǎng)較短等為標(biāo)志。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變,一次對(duì)幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定,因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測(cè)序技術(shù)(nextgenerationsequencing)足見其劃時(shí)代的改變,同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測(cè)序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn),已助力Nature,immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。高通量測(cè)序單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持單細(xì)胞多學(xué)可包括基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、影像組學(xué)。

所謂的高通量測(cè)序技術(shù),又名大規(guī)模平行測(cè)序,是將DNA(或者cDNA)隨機(jī)片段化、加接頭,制備測(cè)序文庫(kù),通過對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào)并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法相比,高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有強(qiáng)大的優(yōu)勢(shì),又快(兩天)又多(數(shù)百萬克?。蔀槟壳敖M學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測(cè)序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃,實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對(duì)接渠道,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。

分子檢測(cè)型單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)中也有一些集中于探究單細(xì)胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關(guān)聯(lián)。功能研究型單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù),結(jié)合了強(qiáng)大的CRISPR基因編輯技術(shù),從而可以深度挖掘基因表達(dá)調(diào)控與細(xì)胞功能以及命運(yùn)決定之間的因果關(guān)系。在未來,為了更系統(tǒng)地研究多層組學(xué)之間的互動(dòng)關(guān)系對(duì)細(xì)胞命運(yùn)的影響,一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)的策略會(huì)繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結(jié)合其他多個(gè)組學(xué)的三組學(xué)甚至四組學(xué)方向發(fā)展.另一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)會(huì)轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測(cè)序分析和功能驗(yàn)證同時(shí)進(jìn)行的方法,這種探究因果關(guān)系的策略對(duì)于揭示發(fā)育和疾病發(fā)展中的關(guān)鍵因子和分子網(wǎng)絡(luò)模塊十分重要。烈冰生物首批引進(jìn) Chromium X 平臺(tái),開啟百萬級(jí)通量單細(xì)胞測(cè)序新時(shí)代。

單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢(shì):1. 構(gòu)建蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù),大幅度提高蛋白質(zhì)鑒定數(shù)量;2. 不同層面表達(dá)水平分析,構(gòu)建表達(dá)“全景圖”;3. 多組學(xué)交叉驗(yàn)證:深層次挖掘其中調(diào)控機(jī)制;4. 對(duì)基因突變信息在蛋白水平上進(jìn)行驗(yàn)證;5.精細(xì)醫(yī)療:實(shí)現(xiàn)genomics到protegenomics的轉(zhuǎn)變。生物領(lǐng)域各個(gè)研究方面,1. 農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機(jī)制,生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,育種保護(hù)研究等;2. 畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,致病機(jī)理研究等;3. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷:生物標(biāo)志物,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型等;4. 生物醫(yī)藥:藥物作用機(jī)理,藥效評(píng)價(jià),藥物開發(fā)等;5. 微生物領(lǐng)域:致病機(jī)理,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等;6. 海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;7. 生物能源、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危定風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估研究等;8.食品營(yíng)養(yǎng):食品儲(chǔ)藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測(cè)等。單細(xì)胞組學(xué)通過一系列測(cè)序技術(shù)實(shí)現(xiàn)高分辨檢測(cè)單個(gè)細(xì)胞水平表達(dá)譜,以解析細(xì)胞異質(zhì)性及其功能表型。深圳上海烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序價(jià)格

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烈冰生物生信分析團(tuán)隊(duì)緊追國(guó)際前沿、整合添加多項(xiàng)國(guó)際期刊認(rèn)可的空轉(zhuǎn)分析工具,構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程;精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器,可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞測(cè)序分析結(jié)果,詳細(xì)深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Rawdata(原始數(shù)據(jù))到Spot-Gene的具有定位信息的表達(dá)矩陣的過程后,就進(jìn)入了空轉(zhuǎn)的第二步,去進(jìn)行Spot的Cluster的過程,熟悉單細(xì)胞測(cè)序的研究者知道,Cluster在單細(xì)胞測(cè)序中往往表示為細(xì)胞的類型,也就是說能聚在一起采用算法分為一個(gè)群體細(xì)胞是一個(gè)Celltype(當(dāng)然分情況也會(huì)有不同)。而在空轉(zhuǎn)中,也正是由于前面提到了細(xì)胞的非單一性,導(dǎo)致了這里的分群并不是單純的同一細(xì)胞類型,而應(yīng)該認(rèn)為是具有相同細(xì)胞組成的點(diǎn)陣區(qū)域,或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。溫州scRNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持

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