解決空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析中由于超大數(shù)據(jù)量、超高的質(zhì)控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難,做到快速可定制化完成空間轉(zhuǎn)錄組分析;擁有行業(yè)先進的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的數(shù)字切片掃描儀,可以同時實現(xiàn)明場與熒光場下冷凍切片的快速掃描成像;Z-Stack多層聚焦掃描及Extended Focus 景深擴展多層融合掃描模式,進一步提升分辨率和清晰度,保證切片高分辨的數(shù)字圖像信息精細采集;能夠滿足針對分析結(jié)果中感興趣基因的RNA-FISH驗證以及組織切片的免疫組化的高清成像,獲取表達與定位信息。烈冰斥巨資引進Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀元。廈門烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務
空間轉(zhuǎn)錄組測序是在組織原位檢測全轉(zhuǎn)錄組基因表達的?種技術,可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達情況,同時能夠得到?的基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。與傳統(tǒng)的全基因轉(zhuǎn)錄組或單細胞轉(zhuǎn)錄組測序相?,空間轉(zhuǎn)錄組測序漿病理影像(H&E染?)與測序數(shù)據(jù)映射在?起,進?可以分析組織切內(nèi)部空間結(jié)構的細胞異質(zhì)性。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術丟失了細胞在原組織中至關重要的空間位置信息,而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息??臻g轉(zhuǎn)錄組技術能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學、神經(jīng)生物學、免疫生物學等領域的研究利器。杭州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組測序服務烈冰開展了空間轉(zhuǎn)錄組、單細胞多組學以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案。
高通量測序技術(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測序技術(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務經(jīng)驗,已助力Nature,immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。
冰凍切片的空間轉(zhuǎn)錄組測序在RNA捕獲、文庫構建方面,需要將組織切片貼合在帶有mRNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上,通過甲醛固定、H&E染色得到組織切片的形態(tài)結(jié)構。再進行透化處理,使細胞中的mRNA釋放,并結(jié)合到芯片相鄰的捕獲探針上。將捕獲的mRNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA并構建測序文庫進行上機測序,從而獲取基因表達信息??傮w來說,空間轉(zhuǎn)錄組的實驗流程包括:組織凍存-OCT包埋-冷凍切片-固定染色-組織透化-cDNA合成及建庫-上機測序,而需要客戶進行樣本準備的步驟相對簡單:組織凍存與OCT包埋。烈冰測序服務已助力300余篇國際主流期刊研究文章發(fā)表。
其實,空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了,目前已經(jīng)發(fā)表的空間轉(zhuǎn)錄組技術有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。但是這些方法存在操作復雜、檢測精度不準確、基因和細胞檢測量的限制等問題。10xGenomics公司升級spatialTranscriptomic后推出的Visium空間基因表達解決方案是一款商業(yè)化的高精度、高通量空間轉(zhuǎn)錄組測序方案。烈冰科技自2020年起,國內(nèi)率先搭建空間轉(zhuǎn)錄組測序服務平臺,聯(lián)合上線單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序、AbSeq、單細胞TCR-Seq、單細胞ATAC-Seq(ARCHR測序)、空間轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)品結(jié)合scRNA-Seq服務,多組學聯(lián)合助力科研人員探索時空等多維度、多角度的動態(tài)變化的生物學信息。烈冰生物為您提供貼心的單細胞研究完整解決方案!助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學信息;助力生命健康醫(yī)療大時代!杭州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組平臺
十二年測序經(jīng)驗,烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組領域的佼佼者。廈門烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務
烈冰配置了LEICA CM1950冷凍切片機,搭配切片經(jīng)驗豐富的實驗團隊,可以提供一致性更高、實驗操作更精細的冷凍切片準備方案,保持密切高效的溝通,設計更適合的實驗方案,確保每一個實驗細節(jié)有效進行;烈冰升級配置尼康相差顯微鏡和CCD成像系統(tǒng),更高清分辨率解析組織切片原始圖像信息,10X,20X,40X,60X更多物鏡選擇,為不同大小的樣本提供更清晰的圖像,更精細的圖像信息采集、拼接策略,為樣本內(nèi)微小區(qū)域的組織學提供更清晰的影像;廈門烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務
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