云生物開發(fā)了擁有自主知識產(chǎn)權(quán)的項目管理系統(tǒng),該系統(tǒng)是一款針對**科研項目進行實時**及狀態(tài)反饋的系統(tǒng)軟件。該系統(tǒng)實時**項目進展各個環(huán)節(jié)、提高科研工作者和服務(wù)商間的溝通效率、規(guī)范項目進度監(jiān)管,***掌控項目的服務(wù)周期,讓云生物客戶更好的享受服務(wù)!本系統(tǒng)軟件目前預(yù)設(shè)了項目展示、項目流程、用戶管理、個人設(shè)置、系統(tǒng)設(shè)置功能模塊。項目展示模塊集成了項目創(chuàng)建,項目分配,物流商安排,服務(wù)商收樣,項目報告上傳、審核、下載、確認,項目資料(圖像文字音視頻等)上傳、下載 ,離線消息對話,項目周期修正、重新取樣,物流商服務(wù)商評價,項目刪除等操作。小基因組測序的好處有很多。甘肅系統(tǒng)進化小基因組測序要多少錢
標準分析:1.測序數(shù)據(jù)概況
(1) 原始測序數(shù)據(jù)說明
(2) 測序數(shù)據(jù)質(zhì)控及統(tǒng)計
(3) 三代測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計
2.基因組組裝
3. 基因組組分分析
(1) 編碼基因分析
(2) ORFs掃描及跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測
(3) 非編碼RNA分析
4. 基因功能注釋
基因組圈圖
高級分析:
比較基因組分析
1.SNP檢測與注釋
2.Indel檢測與注釋
3.SV檢測
4.基因組共線性分析
5.線粒體與葉綠體基因組片段交流分析
6.共有和特有基因分析
7.系統(tǒng)進化分析、選擇壓力分析
定制化生信分析
1.密碼子偏好性分析
2.長重復(fù)序列Long repeat分析
3.簡單重復(fù)序列SSR分析
4.基因表達量及表達差異分析(可由客戶提供RNAseq) 上海植物葉綠體基因組小基因組測序要多少錢您知道云生物的小基因組測序系列都有哪些嗎?
eggNOG全稱為evolutionarygenealogyofgenes:Non-supervisedOrthologousGroups,是一個蛋白聚類數(shù)據(jù)庫,帶有功能描述和功能類別說明,由EMBL(歐洲分子生物實驗室)維護。包含1,133個物種、共721,801個直系同源組、共41個不同水平的直系同源組分類,整合了5,214,234個蛋白序列。分別更新了4,873個COG數(shù)據(jù)庫信息和4,850個KOG數(shù)據(jù)庫信息。GO全稱為GeneOntology,一套國際標準化的基因功能描述的分類系統(tǒng)。GO其分為三大類:1)細胞組分(CellularComponent):用于描述亞細胞結(jié)構(gòu)、位置和大分子復(fù)合物,如核仁、端粒和識別起始的復(fù)合物等;2)分子功能(MolecularFunction):用于描述基因、基因產(chǎn)物個體的功能,如與碳水化合物結(jié)合或ATP水解酶活性等;3)生物過程(BiologicalProcess):用來描述基因編碼的產(chǎn)物所參與的生物過程,如有絲分裂或嘌呤代謝等。Swiss-Prot,是2002年由UniProtconsortium建立的基因數(shù)據(jù)庫,其特點在注釋結(jié)果經(jīng)過實驗驗證,可靠性較高,可用作其他數(shù)據(jù)的參考。
葉綠體基因組 | “**”遺傳資源開發(fā)新模式:陸地表面分布著由許多植物組成的各種植物群落,它與氣候、土壤、地形、動物界及水狀況等自然環(huán)境要素密切相關(guān)。近年來,植物葉綠體基因組SSR(gSSR)遺傳資源標記的開發(fā)檢測到了更高水平的多態(tài)性而引起更多關(guān)注,為更***地了解東亞人口、分歧歷史以及氣候變化的影響提供了理想的模型。選取虎耳草科近源的2種獨草根屬(Oresitrophe)和1種槭葉草屬(Mukdenia)植物為研究對象,測序并獲取葉綠體基因組。
小基因組測序的優(yōu)點有很多。
云生物專注于生物醫(yī)藥科研平臺服務(wù)及基因檢測定制,包括測序、芯片、數(shù)據(jù)庫建設(shè)、軟件開發(fā)以及其他科研解決方案和民用型基因檢測產(chǎn)品。云生物擁有多個經(jīng)驗豐富、可提供一對一個性化定制分析服務(wù)的實驗室平臺,包括基因調(diào)控(ATAC-seq、CHIP-seq、Hi-C測序)、分子生物(數(shù)字PCR、熒光定量PCR、焦磷酸測序、PGM)、核酸測序(基因組、轉(zhuǎn)錄組、多樣性)、芯片檢測(基因芯片、蛋白芯片、組織芯片、PCR芯片)、蛋白代謝(蛋白組、代謝組、脂質(zhì)組)、形態(tài)影像(免疫組化)、蛋白定量(定量Wes檢測)、細胞生物(細胞生物學(xué)、ips、CRISPR/Cas9、細胞株構(gòu)建)、生物信息(在線系統(tǒng)、軟件開發(fā)、相關(guān)數(shù)據(jù)庫)和轉(zhuǎn)化應(yīng)用(Microbe Trakr)等等。想要做小基因組測序?您要先了解小基因組測序的特點。天津動植物線粒體基因組小基因組測序售后服務(wù)
小基因組測序DNA質(zhì)檢需要多久?甘肅系統(tǒng)進化小基因組測序要多少錢
采用二代IlluminaHiseq結(jié)合三代PacBio測序技術(shù)對樣本DNA進行基因組測序,分別構(gòu)建了IlluminaPE文庫(300-500bp)和PacBio文庫(8~10kb),對獲得的測序數(shù)據(jù)利用生物信息學(xué)分析方法完成基因組完成圖繪制。信息分析主要分為6大步驟:1.下機數(shù)據(jù)質(zhì)控。過濾測序質(zhì)量值低的reads,過濾duplicationreads,獲得高質(zhì)量的Cleandata;2.基因組組裝。利用組裝軟件對Cleandata進行組裝,多次調(diào)整參數(shù)及補洞后獲得基因組完成圖序列;3.基因組組分分析。組裝完成后,分析樣品的基因組組分,包括編碼基因、ncRNA等;4.基因功能注釋。與通用功能數(shù)據(jù)庫比對獲得樣本的基因功能注釋信息,并對特定功能進行分類;5.比較基因組分析。從基因組、基因兩個層面比較樣品與參考基因組的差異,包括共線性比較,SNP、Indel、SV檢測,Core-Pan分析,物種進化分析等;6.基因組可視化分析。將編碼基因、ncRNA、基因組GC%等信息以圈圖的形式展示。 甘肅系統(tǒng)進化小基因組測序要多少錢