植物線粒體（pMtDNA）復(fù)雜性概況
1. 相比于動物線粒體基因組的大小（10-20k），已知的pMtDNA大小變異非常劇烈，從190k-11Mb不等
2. 重復(fù)序列變異范圍**片段結(jié)構(gòu)變異很常見
3. pMtDNA中基因的SNP同義突變率很低，***低于動物線粒體與核基因
4. 越來越多的證據(jù)表明：開花植物的pMtDNA并不一定是環(huán)狀，而是以線性狀態(tài)或者多種形式共存于細胞中，而且不同生長時期還能相互轉(zhuǎn)變
5. 除了參與能量代謝，pMtDNA經(jīng)常性與植物育性相關(guān)
6. 編碼基因非常保守：24個**保守基因+17個變異基因，但是保守基因的order可不保守哦，嘻嘻~
7. 經(jīng)?？梢宰⑨尩酱罅縩ovel genes，部分基因的功能非常重要，影響植物生育周期與育性 云生物提供小基因組測序剩余樣本可返還。湖北線粒體小基因組測序服務(wù)
InDel檢測及注釋：InDel是DNA序列的插入（Insertion）和缺失（Deletion）現(xiàn)象的總稱，狹義的InDel表示1~10bp的短InDel。在基因組編碼區(qū)域，InDel的發(fā)生可能會引起移碼突變、氨基酸改變、假基因的出現(xiàn)等等現(xiàn)象。這里分析的是狹義的InDel。利用LASTZ軟件將樣品和參考序列進行比對，檢測得到初步InDel結(jié)果。然后取參考序列InDel位點上下游150bp與樣品的測序reads用BWA軟件及SAMtools進行比對驗證，過濾得到可靠的InDel。SV檢測：基因組結(jié)構(gòu)變異（SV，StructuralVariation）通常是指基因組內(nèi)DN**段缺失、插入、重復(fù)、倒位、異位。使用MUMmer軟件對目標基因組和參考基因組進行比對，再使用LASTZ對區(qū)域間進行比對，從區(qū)域比對結(jié)果中查找SV。 青海線粒體小基因組測序銷售您喜歡小基因組測序的這些特點嗎？
標準分析：1.測序數(shù)據(jù)概況
(1) 原始測序數(shù)據(jù)說明
(2) 測序數(shù)據(jù)質(zhì)控及統(tǒng)計
(3) 三代測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計
2.基因組組裝
3. 基因組組分分析
(1) 編碼基因分析
(2) ORFs掃描及跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測
(3) 非編碼RNA分析
4. 基因功能注釋
基因組圈圖
高級分析：
比較基因組分析
1.SNP檢測與注釋
2.Indel檢測與注釋
3.SV檢測
4.基因組共線性分析
5.線粒體與葉綠體基因組片段交流分析
6.共有和特有基因分析
7.系統(tǒng)進化分析、選擇壓力分析
定制化生信分析
1.密碼子偏好性分析
2.長重復(fù)序列Long repeat分析
3.簡單重復(fù)序列SSR分析
4.基因表達量及表達差異分析（可由客戶提供RNAseq）
復(fù)旦大學(xué)腦科學(xué)研究院朱劍虹教授、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院沙紅英博士研究組與安徽醫(yī)科大學(xué)曹云霞研究組合作，創(chuàng)新性進行極體基因組移植用于預(yù)防遺傳線粒體疾病研究。該研究論文于2014年6月在國際刊物《細胞》上發(fā)表。論文**作者單位包括復(fù)旦大學(xué)醫(yī)學(xué)神經(jīng)生物學(xué)國家重點實驗室、復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院神經(jīng)外科、復(fù)旦大學(xué)腦科學(xué)研究院、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院等，第二作者單位為安徽醫(yī)科大學(xué)**附屬醫(yī)院婦產(chǎn)科生殖中心。我校上海醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)八年制醫(yī)學(xué)生王天同學(xué)、沙紅英博士及安徽醫(yī)科大學(xué)紀冬梅醫(yī)師為該論著的共同**作者，沙紅英博士和朱劍虹教授為共同通訊作者，曹云霞教授和朱劍虹教授為共同***作者。該研究在國際上發(fā)表后獲得高度評價?！蹲匀弧泛汀蹲匀贿z傳學(xué)-綜述》雜志分別發(fā)表題為《阻斷遺傳病變異傳遞》和《聚光燈下的線粒體置換技術(shù)》的文章，介紹中國的發(fā)明，并稱“重要的是證明極體移植的可行性，并***提高了線粒體移植療法的效率”。美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)會**稱該研究“為線粒體疾病干預(yù)提供新假設(shè)、新發(fā)現(xiàn)、新手段”。線粒體置換技術(shù)是當前國際生物醫(yī)學(xué)的高科技前沿，我國遺傳性線粒體疾病患者數(shù)量很大，該研究表明極體移植線粒體置換技術(shù)有潛在和重要的臨床應(yīng)用前景。。 云生物小基因組測序可進行測序組裝。
葉綠體基因組楝科植物葉綠體揭示物種進化遺傳標記：葉綠體基因組（cpDNA）在大多數(shù)種子植物中是母系遺傳，與核基因組相比，cpDNA顯示出致密的基因含量和較慢的進化速率。楝科（Meliaceae）屬于薔薇亞綱無患子目，主要由***分布在熱帶地區(qū)得喬木和灌木組成。楝科植物具有極高的經(jīng)濟價值，應(yīng)用葉綠體基因組開發(fā)木材種屬鑒定的遺傳標記具有很大的研究價值。對Cedrelaodorata，Entandrophragmacylindricum，Khayasenegalensis和Carapaguianensi四種楝科的葉綠體基因組進行測序組裝，cpDNA呈環(huán)狀，大小在158,558~160,737bp之間，典型的四分體結(jié)構(gòu)，即由兩個反向重復(fù)序列組成（IRa和IRb），分別由大（LSC）和?。⊿SC）單拷貝區(qū)分開。四個新測序的楝科植物的每個cpDNA中，注釋了112個基因（包括78個蛋白質(zhì)編碼，30個tRNA和4個rRNA基因），其中18個在IR區(qū)域中重復(fù)，總共編碼85種蛋白質(zhì)，37種tRNA和8種rRNA共130種基因。內(nèi)含子大小范圍從trnL-UAA的532bp到trnK-UUU的2535bp。rps12基因存在反式剪接。 云生物提供小基因組測序的質(zhì)檢報告嗎？湖北植物葉綠體基因組小基因組測序售后服務(wù)
云生物提供小基因組測序建庫流程。湖北線粒體小基因組測序服務(wù)
云生物開發(fā)了擁有自主知識產(chǎn)權(quán)的項目管理系統(tǒng)，該系統(tǒng)是一款針對**科研項目進行實時**及狀態(tài)反饋的系統(tǒng)軟件。該系統(tǒng)實時**項目進展各個環(huán)節(jié)、提高科研工作者和服務(wù)商間的溝通效率、規(guī)范項目進度監(jiān)管，***掌控項目的服務(wù)周期，讓云生物客戶更好的享受服務(wù)！本系統(tǒng)軟件目前預(yù)設(shè)了項目展示、項目流程、用戶管理、個人設(shè)置、系統(tǒng)設(shè)置功能模塊。項目展示模塊集成了項目創(chuàng)建，項目分配，物流商安排，服務(wù)商收樣，項目報告上傳、審核、下載、確認，項目資料（圖像文字音視頻等）上傳、下載 ，離線消息對話，項目周期修正、重新取樣，物流商服務(wù)商評價，項目刪除等操作。湖北線粒體小基因組測序服務(wù)