DNA病毒基因組測序:動物、人、植物被特定病毒株侵染、分離到病毒株、連續(xù)傳代的病毒株往往都需要獲得盡量完整的基因組序列來指導(dǎo)下一步的研究,傳統(tǒng)的sanger測序需要了解序列、設(shè)計引物、做很多PCR,往往效率很低,而NGS作為一種無需特異性引物擴(kuò)增的測序方式,可以直接從DNA中獲得序列。DNA病毒基因組測序:如果,1,您的目的是:獲得一種指定DNA病毒盡量完整的序列;2,您可以提供該病毒的中英文名稱;3,您了解樣本中病毒的載量情況、培養(yǎng)狀況、ct值等任一信息。那么,探普為你準(zhǔn)備了完整的下單、樣本準(zhǔn)備方法,經(jīng)過探普的實(shí)驗,測序、分析,你將獲得:1,1-5Gb測序數(shù)據(jù)量rawdata;2,一般可獲得95%以上的拼接序列,100kb以上大基因組病毒除外;其他特殊要求如:突變分析、進(jìn)化分析都可直接與技術(shù)支持聯(lián)系。
測序的完成程度,決定著基因組的下游應(yīng)用。浙江病毒測序分析多少錢
哪些應(yīng)用場景需要對病毒的全基因組進(jìn)行測序?在探普生物長時間運(yùn)行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進(jìn)行測序項目有比較豐富的應(yīng)用場景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時省力省經(jīng)費(fèi),同時能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對病毒的全基因組進(jìn)行測序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測疫病的目的。
國內(nèi)全基因組測序分析要多久傳統(tǒng)Sanger測序相比,NGS技術(shù)的發(fā)展使得一個小的研究小組可以擁有大量病毒株的全基因組序列。
探普生物進(jìn)行病毒基因組測序的流程:在探普生物進(jìn)行病毒基因組測序非常簡單,簡而言之,客戶只需要說清楚樣品情況,準(zhǔn)備樣品即可,其他事宜都由探普來進(jìn)行安排。大致流程如下:1)與銷售人員溝通項目需求和樣本情況;2)探普生物工作人員擬定項目合同,雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章;3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本,填寫信息單后通知銷售人員預(yù)訂干冰,安排樣本寄運(yùn)輸;4)客戶支付項目啟動款,探普生物啟動項目實(shí)驗和分析并提供測序報告;5)客戶支付項目尾款,探普生物提交測序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果;6)售后問題處理,項目結(jié)題。
二代測序可以用于對病毒的全基因組進(jìn)行測序有哪些挑戰(zhàn)?二代測序相較sanger測序,差異主要就是單次運(yùn)行可以獲得海量的數(shù)據(jù)量,因此也稱為高通量測序。想要通過高通量測序獲得病毒全序列,需要經(jīng)歷:核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這三大基本流程。而高通量測序技術(shù)本身并不是以病毒為目標(biāo)開發(fā)的,因此每個環(huán)節(jié)都是挑戰(zhàn)。核酸純化步驟決定了Input核酸的起始濃度和總量,從而決定了文庫構(gòu)建的成敗、質(zhì)量和產(chǎn)量;文庫的好壞決定了數(shù)據(jù)的質(zhì)量和產(chǎn)出;而數(shù)據(jù)的質(zhì)量產(chǎn)出直接影響分析結(jié)果。樣品一般核酸濃度很低,且?guī)в写罅克拗魑廴?,因此?shí)驗部分和分析部分都比較困難。探普生物基于這些困難點(diǎn),進(jìn)行了大量有針對性的研發(fā)和測試,開發(fā)了全套的實(shí)驗和分析流程用于對病毒的全基因組進(jìn)行測序,該流程自運(yùn)行以來廣受研究者們好評。
病毒全基因組測序產(chǎn)品特點(diǎn):樣本的所有病原信息一網(wǎng)打盡。
高通量測序在病毒準(zhǔn)種研究中如何應(yīng)用 在采用高通量測序技術(shù)研究準(zhǔn)種耐藥性方面,人類免疫缺陷病毒(HIV)較為突出。人類免疫缺陷病毒的逆轉(zhuǎn)錄酶有非常大的錯配傾向,造成幾乎每復(fù)制1輪出現(xiàn)1個堿基對替換突變。被侵染的個體中存在非常巨大的病毒群,每天有1010個病毒粒子產(chǎn)生和死亡,在侵染后這種行為導(dǎo)致病毒快速形成一個多樣性的群,即準(zhǔn)種。高通量測序是研究大群體中序列突變體特征的先進(jìn)方法,它的一種應(yīng)用是對個體抗病毒治療失敗時產(chǎn)生的數(shù)量很少的耐藥突變的定量研究。全基因組測序可以檢測個體基因組中的全部遺傳信息,準(zhǔn)確性高。國內(nèi)全基因組測序分析要多久
高通量測序技術(shù)正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測序和分析。浙江病毒測序分析多少錢
需要對病毒的全基因組進(jìn)行測序的應(yīng)用場景:在探普生物長時間運(yùn)行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進(jìn)行測序項目有比較豐富的應(yīng)用場景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時省力省經(jīng)費(fèi),同時能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對病毒的全基因組進(jìn)行測序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測疫病的目的。
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上海探普生物科技有限公司是一家集生產(chǎn)科研、加工、銷售為一體的****,公司成立于2018-10-30,位于放鶴路1088號6號樓307。公司誠實(shí)守信,真誠為客戶提供服務(wù)。公司主要經(jīng)營病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定等產(chǎn)品,我們依托高素質(zhì)的技術(shù)人員和銷售隊伍,本著誠信經(jīng)營、理解客戶需求為經(jīng)營原則,公司通過良好的信譽(yù)和周到的售前、售后服務(wù),贏得用戶的信賴和支持。公司與行業(yè)上下游之間建立了長久親密的合作關(guān)系,確保病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定在技術(shù)上與行業(yè)內(nèi)保持同步。產(chǎn)品質(zhì)量按照行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行研發(fā)生產(chǎn),絕不因價格而放棄質(zhì)量和聲譽(yù)。探普秉承著誠信服務(wù)、產(chǎn)品求新的經(jīng)營原則,對于員工素質(zhì)有嚴(yán)格的把控和要求,為病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定行業(yè)用戶提供完善的售前和售后服務(wù)。