微生物鑒定的傳統(tǒng)的鑒定方法雖然仍被普遍使用,但存在兩大缺點(diǎn)。它們只適用于可以體外培養(yǎng)的生物體,而且一些菌株表現(xiàn)出不符合已知種屬模式的獨(dú)特的生化特性。許多現(xiàn)代方法并不依賴于活的培養(yǎng)物,它們常常能揭示通過(guò)傳統(tǒng)方法檢測(cè)不到的有機(jī)體之間的細(xì)微差別。PCR,包括實(shí)時(shí)熒光定量PCR,可能是普遍應(yīng)用于微生物鑒定的分子技術(shù)。利用PCR技術(shù),可以快速檢測(cè)和鑒定臨床標(biāo)本的微生物種類,從而加快診斷程序。大多數(shù)基于PCR的方法涉及一組通用的PCR引物,通過(guò)測(cè)序PCR擴(kuò)增的序列來(lái)鑒定細(xì)菌/樣品。16S rRNA基因是PCR細(xì)菌鑒定的金標(biāo)準(zhǔn)序列,而內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)區(qū)域是種類的主要條碼標(biāo)記。由于微生物是對(duì)無(wú)菌性的重大威脅,對(duì)環(huán)境微生物的準(zhǔn)確鑒定通常是制藥行業(yè)良好的生產(chǎn)實(shí)踐(GMP)要求。杭州病毒篩查服務(wù)
微生物鑒定可以采用不同微生物對(duì)周圍環(huán)境的資源的利用度有所不同的特性來(lái)區(qū)別。比如說(shuō)微生物能否以二氧化碳作為微生物自身生長(zhǎng)的碳源以及對(duì)糖類等物質(zhì)的需求程度來(lái)區(qū)分。亦或者說(shuō)對(duì)不同類型生長(zhǎng)因子的需求也是重點(diǎn)。其實(shí)我們還可以通過(guò)控制微生物的生長(zhǎng)環(huán)境來(lái)判斷微生物的種屬類型。比如說(shuō)該微生物生長(zhǎng)需氧,以及適合在什么溫度進(jìn)行生長(zhǎng)繁殖,什么溫度微生物會(huì)轉(zhuǎn)入芽孢形態(tài)進(jìn)行休眠,根據(jù)這些表現(xiàn)的不同,都可進(jìn)行微生物的的鑒別。山東新病原檢查服務(wù)公司室內(nèi)空氣是微生物污染的重要傳播途徑。
微生物鑒定可以用微生物對(duì)噬菌體的敏感性作為指標(biāo)來(lái)鑒定微生物的種屬。因?yàn)楦鞣N噬菌體都有其嚴(yán)格的宿主范圍,不同的細(xì)菌作為噬菌體的宿主對(duì)應(yīng)有特定的已知特性的噬菌體,其和噬菌體的作用方式也有接合,轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)接,溶原性轉(zhuǎn)換和原生質(zhì)體融合等多種方式。部分細(xì)菌可以采用血清學(xué)反應(yīng)的方法來(lái)進(jìn)行區(qū)分和鑒別,就比如說(shuō)常見(jiàn)的疑似傷寒沙門菌的菌種鑒別,我們可以利用血清學(xué)反應(yīng),現(xiàn)有的已知的對(duì)應(yīng)的血清學(xué)反應(yīng)抗體,蘸取菌種液在抗體液中涂抹,看是否會(huì)出現(xiàn)血凝現(xiàn)象(即是否出現(xiàn)淡白色的凝集顆粒)。
未知病原鑒定測(cè)序?qū)嶒?yàn)基于二代測(cè)序技術(shù)。樣本經(jīng)過(guò)核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了病原體的序列數(shù)據(jù)。首先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專門針對(duì)病原的核酸純化樣本指南,以提高病原純度和得率,與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二,文庫(kù)構(gòu)建環(huán)節(jié),探普生物專門針對(duì)病原樣本的核酸低濃度/超微總量特點(diǎn)開(kāi)發(fā)了超微量核酸文庫(kù)構(gòu)建,可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構(gòu)建成測(cè)序文庫(kù)。第三,生物信息學(xué)分析環(huán)節(jié)。因?yàn)椴≡话闶窃趶?fù)雜環(huán)境或背景中獲得的,因此下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他非致病微生物的數(shù)據(jù),探普生物基于該特點(diǎn),優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫(kù),專門針對(duì)病原數(shù)據(jù)搭載了生物信息學(xué)分析流程,可處理復(fù)雜背景下的病原序列。可利用不同底物產(chǎn)生的不同代謝產(chǎn)物來(lái)間接檢測(cè)該微生物內(nèi)酶的有無(wú),從而達(dá)到檢測(cè)特定微生物的目的。
實(shí)現(xiàn)病原微生物種類鑒定有哪些技術(shù)手段? 病原微生物的研究歷史不算長(zhǎng)。發(fā)展至今已經(jīng)有了成套的檢測(cè)體系。利用不同類別的微生物有其本身不同于其他微生物的特點(diǎn),如從培養(yǎng)形態(tài)、顯微鏡觀測(cè)形態(tài)、生物學(xué)功能、致病性、生物化學(xué)反應(yīng)、抗原抗體反應(yīng)、核酸序列等方面,都可以進(jìn)行相當(dāng)程度的鑒別。即便如此,依然有很多微生物通過(guò)傳統(tǒng)技術(shù)無(wú)法鑒別。高通量測(cè)序技術(shù)問(wèn)世,給微生物鑒別打開(kāi)一扇新的大門。它對(duì)核酸進(jìn)行測(cè)序是非特異的,因此,對(duì)一無(wú)所知的核酸也可以實(shí)現(xiàn)鑒別。將微生物接到適于它生長(zhǎng)繁殖的人工培養(yǎng)基上或活的生物體內(nèi)的過(guò)程叫做接種。廣東微生物篩查服務(wù)公司
快速檢測(cè)方法是指從樣品制備到出具檢測(cè)結(jié)果的整個(gè)檢測(cè)過(guò)程能夠在短時(shí)間內(nèi)完成的檢測(cè)方法。杭州病毒篩查服務(wù)
臨床微生物鑒定必須經(jīng)歷的過(guò)程:1.分離培養(yǎng):臨床細(xì)菌學(xué)不可缺少的基本技術(shù),是獲得純培養(yǎng)物的必要手段,即使自動(dòng)化儀器先進(jìn)的現(xiàn)在也只能對(duì)純菌作出鑒定。2.細(xì)菌的菌落、色素、溶血性、氣味是鑒定的重要特征。3.形態(tài)學(xué)鑒定:如奴卡菌、紅球菌。4.動(dòng)力在各種細(xì)菌鑒定:針對(duì)形態(tài)不易區(qū)分時(shí)來(lái)鑒別菌種。5.氧化酶,觸酶試驗(yàn)是分別革蘭陰性菌和革蘭陽(yáng)性菌鑒定試驗(yàn)。傳統(tǒng)的鑒定方法通過(guò)選實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目,同一科內(nèi)的不同屬、種可以選擇不同的鑒定指標(biāo)。杭州病毒篩查服務(wù)
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