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為了證明Genovis的PNGase F凍干和PNGase F固定在各種底物上的去糖基化能力,用PNGase F凍干或PNGase F固定化處理了一系列糖蛋白。使用天然反應(yīng)條件在一小時內(nèi)有效去除曲妥珠單抗和依那西普上的所有N-糖,以及西妥昔單抗上的Fc-糖。當(dāng)加入RapiGest?并在變性條件下進(jìn)行反應(yīng)時,西妥昔單抗的所有N-聚糖(包括Fab-聚糖)在PNGase F固定化10分鐘內(nèi)完全去除,PNGase F固定化15分鐘內(nèi)完全去除。在變性反應(yīng)條件下,PNGase F 在 30 分鐘內(nèi)成功將更復(fù)雜的 F 融合蛋白阿巴西普和阿柏西普去糖基化。使用變性和還原反應(yīng)條件,將常用的糖蛋白標(biāo)準(zhǔn)品RNase B在10或15分鐘內(nèi)完全去糖基化,分別使用PNGase F凍干或PNGase F固定化。在天然和變性條件下生成的去糖基化樣品與LC-MS分析兼容。使用OpeRATOR圖譜O-聚糖位點(diǎn)對依那西普進(jìn)行LC-MS分析。湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶
OglyZOR 來源于口腔鏈球菌,在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有 His 標(biāo)簽,分子量為 227 kDa。SialEXO來源于Akkermansia muciniphila,在大腸桿菌中表達(dá)。SialEXO酶含有His標(biāo)簽,組分的分子量分別為42 kDa和66 kDa。1.高效O-糖苷酶;2. 降低樣品異質(zhì)性,揭示潛在的關(guān)鍵蛋白質(zhì)修飾;3. 完全、穩(wěn)健地去除 O-糖he心 1 二糖。Genovis的凍干酶,用于水解糖蛋白上的he心1 O-聚糖。OglyZOR 凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在 2000 個單位的小瓶中,用于在 2 mg 糖蛋白上水解he心 1 O-聚糖。它需要去除唾液酸助劑才能發(fā)揮作用,因此與2000單位的SialEXO凍干一起提供。江西用于自動化系統(tǒng)的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究用于消化 2 mg O-糖基化蛋白。包括2000個單位SialEXO凍干酶。
C1抑制劑的去糖基化:在O-糖基化生物制藥的生產(chǎn)過程中,由于he心GalNAc殘基的加工不完全,可能會出現(xiàn)Tn抗原。這表現(xiàn)為具有 203 Da HexNAc 單位差異的重復(fù)質(zhì)量位移。為了確認(rèn) Tn 抗原的存在,可以應(yīng)用以下工作流程,此處在重度(26 個位點(diǎn))O-糖基化 C1 抑制劑上演示。首先,使用PNGaseF修剪糖蛋白的N-糖,使用Genovis的OglyZOR和SialEXO修剪he心1 O-糖。依那西普的磷性能測試?:依那西普是另一種具有挑戰(zhàn)性的生物制藥模型分子,攜帶 13 個 O-聚糖位點(diǎn),其中平均 9 至 10 個位點(diǎn)被占用。
使用Genovis的GalNAcEXO 對 O-糖基化生物制藥進(jìn)行 Tn 抗原表征:未成熟的截短O-聚糖導(dǎo)致了復(fù)雜生物制藥的異質(zhì)性,使其分析更具挑戰(zhàn)性。 O-聚糖的he心由n-α-GalNAc殘基組成,通過糖苷鍵與絲氨酸或蘇氨酸連接,稱為Tn抗原。 現(xiàn)在,使用GalNAcEXO可以采用合適的酶策略來去除這些GalNAc并簡化生物制藥的表征。在質(zhì)譜圖中可以觀察到重復(fù)峰的模式。其次,在與GalNAcEXO酶孵育后,剩余的GalNAc殘基被完全去除,留下一個峰。因此,該工作流程確認(rèn)了 O-糖基化生物制藥上存在 Tn 抗原,并允許定量he心 GalNAc 水平。這種工作流程的另一個好處是減少了剩余的異質(zhì)性,這有助于確認(rèn)蛋白質(zhì)的完整質(zhì)量,并揭示截短的片段。SialEXO在天然條件下水解糖蛋白,在pH值范圍為6.5至9時顯示出活性。
Genovis的ImpaRATOR? 和 OpeRATOR? - 兩種協(xié)同的作用:O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化區(qū)域O-聚糖位點(diǎn)的覆蓋率(圖3)。使用OpeRATOR鑒定對應(yīng)于所有13個O-聚糖位點(diǎn)的肽,而使用ImpaRATOR只能明確鑒定10個位點(diǎn)。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR (1) 具有更具選擇性的氨基酸序列偏好,此處由 S186 和 T245 位點(diǎn)缺乏消化來表明。此外,ImpaRATOR 在兩個相鄰的 O-糖基化氨基酸之間顯示出有限的裂解,如 S213 位點(diǎn)酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位點(diǎn)酶解肽的低強(qiáng)度所證明的那樣。在OpeRATOR酶解樣品(T184-S199和T200-H204;圖2b和d),而在ImpaRATOR消化的樣品中,具有漏裂的相應(yīng)肽(S184-H204)的強(qiáng)度更高。 雖然OpeRATOR顯示出更高的O-聚糖位點(diǎn)覆蓋率,但使用ImpaRATOR進(jìn)行消化可以表征O-聚糖結(jié)構(gòu),包括唾液酸化物種。例如,條形圖插入顯示了兩種糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖種類。這應(yīng)該與使用OpeRATOR的消化進(jìn)行比較,在OpeRATOR中,必須去除唾液酸才能產(chǎn)生酶活性,這意味著有關(guān)唾液酸化的信息丟失??偠灾?,ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有關(guān)聚糖組成和 O-聚糖位點(diǎn)的完整信息。在天然條件下用固定化PNGase F去除zhiliao性抗體;北京凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究
GalNAcEXO凍干劑以凍干粉末的形式提供,裝在2000單位的小瓶中,用于水解2mg糖蛋白上的GalNAc殘基。湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶
genvois的OpeRATOR 是一種內(nèi)切蛋白酶,可催化直接靠近 O-聚糖的天然粘蛋白型 O-糖基化蛋白的肽鍵的水解。內(nèi)切蛋白酶具有高特異性,可消化絲氨酸或蘇氨酸殘基的O-聚糖N端的蛋白質(zhì)。 OpeRATOR 活性需要粘蛋白型的 O-聚糖,并且該酶不會用 N-連接聚糖消化糖蛋白。該酶對具有亞洲化he心1 O-聚糖的位點(diǎn)z活躍。它還消化唾液酸化的he心 1 和he心 3,但程度要低得多。為了獲得z佳性能,需要去除唾液酸,因此,SialEXO凍干(唾液酸酶混合物)包含在購買中。 湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶