山西PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究

G0F 抗體在 30 分鐘內(nèi)：半乳糖的存在會(huì)影響zhiliao性抗體引發(fā)的效應(yīng)功能，為了研究抗體的作用方式，可能需要徹底去除半乳糖殘留物。Genovis的GalactEXO Immobilized 的 β1-4 半乳糖苷酶活性在曲妥珠單抗上使用 30 分鐘孵育證明。genovis的GalactEXO Immobilized 由強(qiáng)大的 GalactEXO 酶組成，該酶固定在瓊脂糖珠上，并以易于使用的微離心柱形式格式化。GalactEXO是β-半乳糖苷酶的混合物，可有效去除N-和O-糖基化蛋白上的半乳糖殘基。使用FabRICATOR?將抗體消化成亞基，并使用LC-MS進(jìn)行分析。使用 GalactEXO 凍干和 GalactEXO 固定化都可以看到向 G0F 糖型的轉(zhuǎn)變，但后者在z終制劑中沒有留下酶。沒有任何半乳糖基化結(jié)構(gòu)表明半乳糖殘基完全水解，因此LC-MS數(shù)據(jù)中任何剩余的次要峰都可以注釋為亞基的糖化。沒有任何半乳糖基化結(jié)構(gòu)表明半乳糖殘基完全水解，因此LC-MS數(shù)據(jù)中任何剩余的次要峰都可以注釋為亞基的糖化。GalNAcEXO 是一種 α-N-乙酰半乳糖胺苷酶，可有效水解糖蛋白上的末端 GalNAc 殘基。山西PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究

GalNAcEXO固定化離心柱含有與瓊脂糖珠共價(jià)偶聯(lián)的GalNAcEXO酶，用于水解糖蛋白上的GalNAc殘基，而不會(huì)用酶污染制劑。Microspin 色譜柱可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。1. 易于使用的離心柱；2. 提高酶與底物的比例，提高消化效率；3. 終樣品中不含酶。用于水解離心柱中糖蛋白上的Genovis的GalNAc殘基的固定化酶。GalNAcEXO 酶是一種n 外α-N-乙酰半乳糖氨酸酶，可快速有效地水解來自天然 O-糖蛋白的 z es GalNAc 殘基。 該酶來源于Akkermansia muciniphila，在大腸桿菌中表達(dá)，帶有His標(biāo)簽，分子量為52 kDa。 該酶在 Tn 抗原和 α1-3 連接末端 GalNAcs 上均顯示活性。在這里，我們展示了如何使用GalNAcEXO來表征復(fù)雜的生物制藥。廣東凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究O-連接聚糖通常存在于蛋白質(zhì)的暴露位置，因?yàn)樗鼈冊(cè)诘鞍踪|(zhì)折疊發(fā)生后附著。

與PNGase F類似，Genvois的OmniGLYZOR用于攜帶N-和簡(jiǎn)單O-糖的糖蛋白的去糖基化。 OmniGLYZOR 試劑盒包括：OmniGlyZOR 微離心柱；PNGase F 凍干；RapiGest?* SF表面活性劑。除非底物蛋白變性，否則某些 N-糖基化位點(diǎn)很難或無法被 PNGase F 接近。在OmniGLYZOR Microspin柱上孵育后剩余的N-糖可以在變性條件下使用試劑盒中包含的PNGase F凍干和RapiGest? SF表面活性劑通過額外的去糖基化步驟去除。使用Genovis的OpeRAT對(duì)EPO進(jìn)行O-糖位點(diǎn)特異性消化：對(duì)于jin攜帶一個(gè)或幾個(gè) O-糖基化位點(diǎn)的簡(jiǎn)單底物蛋白，OpeRATOR 也可用于繪制中間水平的 O-糖基化位點(diǎn)。

為了研究 OglyZOR 對(duì)天然糖蛋白的活性，將該酶與依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或沒有 SialEXO 孵育 1 小時(shí)。當(dāng)唾液酸被去除時(shí)，OglyZOR酶有效地水解了所有三種底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 （Gal-β1,3-GalNAc）。這使得這些酶適合在LC-MS分析之前制備樣品，以鑒定其他PTM或確認(rèn)氨基酸序列O-糖基化生物制藥的全去糖基化：O-糖基化生物制藥（如依那西普）很難表征。為了能夠通過質(zhì)譜法測(cè)定完整質(zhì)量數(shù)，我們進(jìn)行了酶促總?cè)ヌ腔?。N-聚糖被Genovis的PNGase F裂解，而O-聚糖可以與OglyZOR和SialEXO一起去除。。為了測(cè)試選擇性，將一系列 O-糖基化、N-糖基化和非糖基化蛋白與 GlycOCATCH 一起孵育：洗脫O-糖基化蛋白。

水解O-聚糖的酶不會(huì)從變性中獲益，這就是為什么OmniGLYZOR色譜柱只能在天然條件下使用的原因。 OmniGLYZOR 試劑盒 Microspin 以含有足夠材料的試劑盒形式提供，可使5 × 50-100 μg 或 10 × 50-100 μg 糖蛋白去糖酸化。N-和O-連接聚糖的快速高效；與LC-MS兼容；完全去除聚糖，改進(jìn)基礎(chǔ)蛋白的分析；固定形式可提高酶與底物的比率，從而實(shí)現(xiàn)快速去糖基化。 IgdE酶(FabALACTICA?)和PNGaseF酶分別購自Genovis(馬薩諸塞州，美國)。用于水解糖蛋白上N-聚糖的凍干酶。Genovis的PNGase F 凍干劑以凍干粉的形式提供，裝在 1000 或 5 x 1000 單位小瓶中，分別用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。SialEXO用于OpeRATOR或OglyZOR消化前預(yù)處理O-糖基化蛋白。河南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶

兩種酶都含有 His 標(biāo)簽，酶的分子量為 43 kDa 和 66 kDa。山西PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究

為了證明Genovis的PNGase F凍干和PNGase F固定在各種底物上的去糖基化能力，用PNGase F凍干或PNGase F固定化處理了一系列糖蛋白。使用天然反應(yīng)條件在一小時(shí)內(nèi)有效去除曲妥珠單抗和依那西普上的所有N-糖，以及西妥昔單抗上的Fc-糖。當(dāng)加入RapiGest?并在變性條件下進(jìn)行反應(yīng)時(shí)，西妥昔單抗的所有N-聚糖（包括Fab-聚糖）在PNGase F固定化10分鐘內(nèi)完全去除，PNGase F固定化15分鐘內(nèi)完全去除。在變性反應(yīng)條件下，PNGase F 在 30 分鐘內(nèi)成功將更復(fù)雜的 F 融合蛋白阿巴西普和阿柏西普去糖基化。使用變性和還原反應(yīng)條件，將常用的糖蛋白標(biāo)準(zhǔn)品RNase B在10或15分鐘內(nèi)完全去糖基化，分別使用PNGase F凍干或PNGase F固定化。在天然和變性條件下生成的去糖基化樣品與LC-MS分析兼容。山西PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究