云南凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

Genovis的SialEXO固定化用于復(fù)雜糖蛋白的去唾液酸化：在設(shè)置反應(yīng)條件時(shí)，需要在所需的反應(yīng)時(shí)間和完成反應(yīng)所需的酶量之間進(jìn)行權(quán)衡。較高的酶量可保證在更短的時(shí)間內(nèi)完成周轉(zhuǎn)，但會(huì)使下游分析復(fù)雜化。為了避免此類問(wèn)題，我們以離心柱形式固定了活性SialEXO。這允許以更短的孵育時(shí)間孵育具有明顯更高量的唾液酸酶的糖蛋白底物。Genovis測(cè)試了 SialEXO 凍干和 SialEXO 固定化在人 C1 抑制劑上的性能。這種糖蛋白是一種具有挑戰(zhàn)性的底物，具有 6 個(gè) N- 和多達(dá) 26 個(gè) O-聚糖，由 α2,3 和 α2,6 連接的唾液酸修飾。對(duì)游離的N-聚糖的分析表明，SialEXO在溶液中完全脫唾液酸化，SialEXO固定化。SialEXO凍干由兩種唾液酸酶組成，每種唾液酸酶都具有獨(dú)特的活性，并且它們同時(shí)起作用。云南凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

蛋白質(zhì)的N-糖基化特征是一個(gè)關(guān)鍵的質(zhì)量屬性。它會(huì)影響生物制藥的安全性和有效性，因此需要在開(kāi)發(fā)和生產(chǎn)過(guò)程中進(jìn)行表征和監(jiān)測(cè)。常見(jiàn)的聚糖分析工作流程是用PNGase F釋放N-聚糖，然后用熒光標(biāo)記物（如2-AB、2-AA、普魯卡因胺或RapiFluor-MS?（沃特世公司））標(biāo)記生成的聚糖。然后使用HILIC-HPLC或毛細(xì)管電泳分離標(biāo)記的聚糖，以表征和定量不同的聚糖結(jié)構(gòu)。 在這里，使用游離聚糖方法分析zhiliao性抗體曲妥珠單抗、Fc-融合蛋白依那西普和糖蛋白R(shí)Nase B的N-聚糖。曲妥珠單抗和依那西普在天然條件下在37°C下用Genvois的PNGase F去糖基化1小時(shí)，而RNase B需要變性和還原才能完全去糖基化。因此，在50°C下用PNGase F去糖基化10分鐘之前，用RapiGest? SF表面活性劑（沃特世公司）和TCEP處理RNase B。 用RapiFluor-MS標(biāo)記所得游離的聚糖，并通過(guò)HILIC UPLC-FLD-MS進(jìn)行分析。甘肅凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶生物藥物開(kāi)發(fā)GalactEXO由兩種半乳糖苷酶組成，均帶有His標(biāo)簽，組分的分子量為87 kDa和109 kDa。

由于蛋白質(zhì)的O-糖模式的異質(zhì)性和O-糖結(jié)構(gòu)的OpeRATOR特異性，形成了重疊的肽，從而可以獲得O-糖位點(diǎn)的完整圖譜為了進(jìn)行比較，相同材料的標(biāo)準(zhǔn)胰蛋白酶消化物， 顯示難以分析的少量且非常大的糖肽。使用Genovis的OpeRATOR進(jìn)行O-糖位點(diǎn)定位：OpeRATOR 是一種 O-聚糖特異性蛋白酶，可消化絲氨酸和蘇氨酸糖基化位點(diǎn)的粘蛋白型 O-糖蛋白 N 端。這會(huì)產(chǎn)生攜帶O-糖的糖肽，并能夠使用質(zhì)譜法進(jìn)行O-糖分析、O-糖肽圖譜以及中級(jí)分析。下面是OpeRATOR消解位點(diǎn)的示意圖。

為了證明Genovis的PNGase F凍干和PNGase F固定在各種底物上的去糖基化能力，用PNGase F凍干或PNGase F固定化處理了一系列糖蛋白。使用天然反應(yīng)條件在一小時(shí)內(nèi)有效去除曲妥珠單抗和依那西普上的所有N-糖，以及西妥昔單抗上的Fc-糖。當(dāng)加入RapiGest?并在變性條件下進(jìn)行反應(yīng)時(shí)，西妥昔單抗的所有N-聚糖（包括Fab-聚糖）在PNGase F固定化10分鐘內(nèi)完全去除，PNGase F固定化15分鐘內(nèi)完全去除。在變性反應(yīng)條件下，PNGase F 在 30 分鐘內(nèi)成功將更復(fù)雜的 F 融合蛋白阿巴西普和阿柏西普去糖基化。使用變性和還原反應(yīng)條件，將常用的糖蛋白標(biāo)準(zhǔn)品RNase B在10或15分鐘內(nèi)完全去糖基化，分別使用PNGase F凍干或PNGase F固定化。在天然和變性條件下生成的去糖基化樣品與LC-MS分析兼容。實(shí)現(xiàn)高通量 N-糖去除，簡(jiǎn)化糖蛋白底物的下游分析。

用于糖蛋白去唾液酸化的凍干酶混合物。Genovis的SialEXO 凍干劑以凍干粉的形式提供，裝在 2000 個(gè)單位的小瓶中，用于 2 mg 糖蛋白的去唾液酸化。1. 用于方法開(kāi)發(fā)的靈活格式；2. 可以結(jié)合酶以提高效率；3. 適用于自動(dòng)化工作流程；4. 即用型 - 只需加水即可。用于水解ɑ2-3-連接唾液酸的凍干酶。 Genovis的SialEXO 2-3凍干劑以凍干粉末的形式提供，裝在500個(gè)單位的小瓶中，用于0.5mg糖蛋白的去唾液酸化。 與唾液酸酶混合物 SialEXO 相比，SialEXO 2-3 是一種 α2-3 特異性唾液酸酶，允許對(duì) α2-3 連接的唾液酸進(jìn)行靶向分析。O-和N-糖基化蛋白的高效α2-3去唾液酸化可以在1小時(shí)內(nèi)實(shí)現(xiàn)。OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 （Gal-β1,3-GalNAc）；云南凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究

GalNAcEXO 酶來(lái)源于Akkermansia muciniphila，在大腸桿菌中表達(dá)，帶有His標(biāo)簽，分子量為52 kDa。云南凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

經(jīng)過(guò)多年的經(jīng)驗(yàn)積累及市場(chǎng)積淀，倍篤生物已組合多條不同產(chǎn)品線，分別滿足體外診斷、organoid及干細(xì)胞、細(xì)胞基因藥物等領(lǐng)域的需求。其中，細(xì)胞基因藥物領(lǐng)域產(chǎn)品線包含SAN HQ高鹽核酸酶及M-SAN HQ中鹽核酸酶、泊洛沙姆P 188 Bio、GMP級(jí)MSC/PSC培養(yǎng)基、GMP級(jí)膠原酶、AAV滴度檢測(cè)產(chǎn)品、工藝雜質(zhì)及外源污染物殘留檢測(cè)產(chǎn)品、聚糖分析用酶、ADC偶聯(lián)技術(shù)、QED抗體對(duì)、AAV中和抗體、蛋白酶等；相關(guān)品牌有挪威ArcticZymes Technologies、德國(guó)BASF、德國(guó)Sartorius、德國(guó)Nordmark、瑞典Genovis、美國(guó)QED、中國(guó)君研生物等。云南凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究