江西瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物學研究

來源: 發(fā)布時間:2024-08-05

Genvis測試去除唾液酸以揭示電荷變體:唾液酸是帶負電荷的糖殘基,存在于 N- 和 O-連接的聚糖上。唾液酸的固有電荷可能會使分析工作流程復雜化,從而掩蓋其他重要的修飾。Microspin 色譜柱可用于 2 x 0.5 mg、5 x 0.5 mg 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白的去唾液酸化。1. 易于使用的離心柱;2. 提高酶與底物的比例,提高消化效率;3. 樣品中不含酶。因此,唾液酸的去除有助于研究蛋白質中的潛在變體。該應用展示了一種快速簡便的樣品制備方法,可在電荷異構體分析之前去除所有唾液酸。GalNAcEXO酶是可降低樣品異質性,用于分析攜帶α連接的 GalNAc 殘基作為未成熟截短he心 1 的復雜 O-糖蛋白。江西瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物學研究

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GalactEXO中的酶來源于Akkermansia muciniphila,并在大腸桿菌中表達。GalactEXO由兩種半乳糖苷酶組成,均帶有His標簽,組分的分子量為87 kDa和109 kDa。用于水解糖蛋白上β1-3,4-連接半乳糖的凍干酶。Genovis的GalactEXO 凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在 2000 單位小瓶中,用于在 2 mg 糖蛋白上水解 β1-3,4-連接的半乳糖。1. 用于方法開發(fā)的靈活格式;2. 可以結合酶以提高效率; 3. 適用于自動化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可!將混合物加載到GlycOCATCH上,洗滌樹脂,并用8M尿素洗脫結合的肽。純化后,在RP-LC-MS上分離樣品。數(shù)據(jù)顯示,糖苷酸肽的選擇性純化,攜帶he心1-O-聚糖。IgA 特異性 O-糖肽富集:IgA 抗體包含 N-連接的糖基化和重度 O-糖基化的鉸鏈區(qū)域。胰蛋白酶消化IgA后,將肽和genovis 的SialEXO的混合物加載到GlycOCATCH樹脂上,并用PBS和離心洗滌。用 8 M 尿素洗脫顯示預期的 O-糖基化鉸鏈肽富集,具有不同程度的糖基化。遼寧凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶疾病機理研究GlycOCATCH?用于結合的 O-糖蛋白的可選洗脫方法:靶向 O-糖蛋白富集;

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Genovis的PNGase F(肽 N-糖苷酶 F)是一種糖酰胺酶,可水解多肽天冬酰胺與所有哺乳動物天冬酰胺連接復合物、雜交或高甘露糖寡糖的內層 GlcNAc 之間的酰胺鍵。該酶用于MS分析前的樣品制備,以降低蛋白質異質性并實現(xiàn)游離的聚糖分析,并研究N-聚糖的功能作用。1. 對所有哺乳動物N-聚糖的高效水解;2.對多種糖蛋白具有活性;3.可固定在即用型離心柱產(chǎn)品形式;4. 自動化友好型,96孔板,用于高通量 N-糖去除。Genovis的ImpaRATOR 是一種 O-糖依賴性蛋白酶,可消化攜帶粘蛋白型。O-聚糖的蛋白質,包括唾液酸化物質、糖基化絲氨酸和 Thr 殘基的 N-末端。該酶產(chǎn)生攜帶 O-糖的糖肽,從而實現(xiàn) O-糖譜分析、位點占用測定和 O-糖肽圖譜以及使用 LC-MS 分析的中級方法。1. 特異性廣 - 接受多種 O-聚糖變體,包括唾液酸化物種;2. 可靠O-聚糖特異性蛋白酶 – 消化絲氨酸/蘇氨酸糖基化位點的 N 末端;3. 穩(wěn)健的消化,增強復雜生物制藥的表征。

FucosEXO中的酶在大腸桿菌中表達,帶有His標簽,分子量為87 kDa和64 kDa。FucosEXO在天然條件下水解糖蛋白上的巖藻糖,在6至8的pH值范圍內顯示出高活性,無需輔助因子或添加劑。1. 用于方法開發(fā)的靈活格式;2. 可以結合酶以提高效率;3. 適用于自動化工作流程;4.即用型 - 只需加水即可。Genovis的FucosEXO 是 α-巖藻糖苷酶的混合物,用于在 N-和 O-糖基化蛋白或游離寡糖上有效水解 α1-2、α1-3 和 α1-4-連接的巖藻糖。人血清中 O-糖蛋白的富集:GlycOCATCH還可用于從復雜的樣品混合物(如人血清)中選擇性富集O-糖基化蛋白。簡而言之,用Genovis的SialEXO處理血清并應用于GlycOCATCH樹脂。洗滌樹脂,用8M尿素洗脫O-糖基化蛋白。用胰蛋白酶消化樣品并使用 RP-LC-MS/MS 進行分析,并使用 Swiss Prot 數(shù)據(jù)庫鑒定蛋白質列表。O-糖基化蛋白以黃色表示。使用 GalactEXO 凍干和 GalactEXO 固定化都可以看到向 G0F 糖型的轉變。

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為了研究 OglyZOR 對天然糖蛋白的活性,將該酶與依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或沒有 SialEXO 孵育 1 小時。當唾液酸被去除時,OglyZOR酶有效地水解了所有三種底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 (Gal-β1,3-GalNAc)。這使得這些酶適合在LC-MS分析之前制備樣品,以鑒定其他PTM或確認氨基酸序列O-糖基化生物制藥的全去糖基化:O-糖基化生物制藥(如依那西普)很難表征。為了能夠通過質譜法測定完整質量數(shù),我們進行了酶促總去糖基化。N-聚糖被Genovis的PNGase F裂解,而O-聚糖可以與OglyZOR和SialEXO一起去除。。GlycOCATCH的應用包括O糖蛋白和肽的特異性富集或去除、糖組學、復雜樣品的研究和生物制藥的表征。江西瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物學研究

依那西普是一種 Fc 融合蛋白,具有高度 O-糖基化的鉸鏈區(qū)域。江西瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物學研究

Fc N-聚糖在抗體的效應功能中起著至關重要的作用,但可能會增加蛋白質表征測定的復雜性。在天然條件下用PNGase F去除Fc N-糖可以表征游離N-糖以及去糖基化抗體的功能和結構。 為了證明PNGase F固定化和PNGase F凍干在天然反應條件下有效去除Fc N-聚糖,對zhiliao性抗體曲妥珠單抗進行了處理。圖2中的質量數(shù)偏移表明,在37°C下用Genovis的PNGase F凍干或PNGase F固定化孵育1小時后,曲妥珠單抗上的Fc N-聚糖成功去除,與在溶液中用PNGase F凍干處理的樣品相比,沒有酶干擾用PNGase F固定處理的樣品的分析。江西瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物學研究