寧波細胞RT-PCR檢測技術

Real-time PCR原理：所謂實時熒光定量PCR技術，是指在PCR反應體系中加入熒光基團，利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程，通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。DNA結(jié)合染料法，應用一種帶有熒光的、非特異的DNA結(jié)合染料檢測PCR過程中積累的擴增產(chǎn)物。檢測所有雙鏈DNA擴增產(chǎn)物，包括非特異反應產(chǎn)物，如引物二聚體?？蓪θ魏坞p鏈DNA進行定量；不需要探針，因此減少了實驗設計及運轉(zhuǎn)成本；適合于大量基因的分析；簡單易用。實時熒光定量PCR：實時熒光定量PCR（QuantitativeReal-time PCR）是一種在DNA擴增反應中，以熒光化學物質(zhì)測每次聚合酶鏈式反應（PCR）循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進行定量分析的方法。Real-time PCR是在PCR擴增過程中，通過熒光信號，對PCR進程進行實時檢測。由于在PCR擴增的指數(shù)時期，模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關系，所以成為定量的依據(jù)。聚合酶鏈反應很容易理解和使用，并迅速產(chǎn)生結(jié)果。寧波細胞RT-PCR檢測技術

Real-time PCR鏈反應的常見問題分析與解決方法：反應緩沖液未完全融化或未充分混勻。確保反應緩沖液融化完全并徹底混勻。引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設計引物。引物量過多。減少反應體系中引物的用量。模板量過多。質(zhì)粒DNA的用量應<50ng，而基因組DNA則應<200ng。外源DNA污染。確保操作的潔凈。陰性對照出現(xiàn)條帶：試劑，頭，工作臺污染。使用全新的試劑和頭，對工作臺進行清潔。條帶大小與理論不符：污染。使用全新的試劑和頭，對工作臺進行清潔。模板或引物使用錯誤。更換引物和模板。基因亞型。對研究的基因進行序列分析和BLAST研究。逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應較廣用于表達譜，以確定基因的表達或鑒定RNA轉(zhuǎn)錄物的序列。無錫組織熒光PCR設計公司聚合酶鏈反應的試劑應分配到一次性的等分試樣中。

Real-time PCR：實時熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準確的方法。如果用于RNA檢測，這被稱為逆轉(zhuǎn)錄實時PCR即（Real-timeRT-PCR）是實時PCR法，它是指對DNA或經(jīng)過反轉(zhuǎn)入（RT-PCR）的RNA通過聚合酶鏈式反應并實時監(jiān)測DNA的放大過程，在擴增的指數(shù)增長期就測量擴增產(chǎn)物，因為擴增指數(shù)增長期測量值與特異DNA（RNA）起始量存在相關性，從而實現(xiàn)定量檢測。Real-time PCR的基本目標是精確測量和鑒別非常微量的特異性核酸，從而可通過監(jiān)測CT值而實現(xiàn)對原始目標基因的含量定量。實時熒光定量PCR法較大的優(yōu)點是克服了終點PCR法進入平臺期或叫飽和期后定量的較大誤差，實現(xiàn)DNA/RNA的精確定量。該技術不單單實現(xiàn)了對DNA/RNA模板的定量，而且具有靈敏度和特異性高、能實現(xiàn)多重反應、自動化程度高、無污染、實時和準確等特點，該技術在醫(yī)學臨床檢驗及臨床醫(yī)學研究方面有著重要的意義。

聚合酶鏈式反應生物學研究的歷史中占據(jù)了重要的地位。以此為基礎發(fā)展出包括Real-time PCR在內(nèi)的多項應用技術。自誕生后Real-time PCR技術持續(xù)發(fā)展，從簡單的增擴到整個PCR過程，Real-time PCR表現(xiàn)出比PCR更敏感、更明確的定量分析特性和對識別等位基因的能力。不少人以為real-time就是意味著可以在顯示器上看到每個循環(huán)增擴曲線的增長。事實并非如此，早期的軟件不能在運行期間提供可視化的增擴曲線。主要是因為SDS軟件采用整個平臺較終的數(shù)據(jù)執(zhí)行數(shù)據(jù)分析工作，而不是分析每個單獨的反應循環(huán)。對某些設備來說，必須向分析軟件提供實時的數(shù)據(jù)，有些設備則不需要。前一種設備允許軟件實時跟蹤每個加樣口的增擴曲線，同時顯示在電腦屏幕上。聚合酶鏈反應的這種能力增強了許多方法，例如生成雜交探針用于雜交。

PCR的反應條件：dNTP濃度過高會加快反應速度，但同時還可以增加堿基的錯誤摻入率。引物濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增，低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能，摻入錯誤率達2*E-4個核苷酸，一個30個循環(huán)的擴增反應0.1%-0.25%總錯誤率。在90～95度下可使整個基因組的DNA變性為單鏈。一般94～95度30～60s。時間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40～60度使引物和模板結(jié)合。引物長度在15～25時退火溫度。熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應是通過新的雜合聚合酶實現(xiàn)的，這些酶在環(huán)境溫度下不活躍。Real-time PCR在實驗過程中注意避免mRNA的斷裂。常州組織Real-time PCR應用

PCR反應的關鍵環(huán)節(jié)有模板核酸的制備，引物的質(zhì)量與特異性，酶的質(zhì)量及溴乙錠的使用。寧波細胞RT-PCR檢測技術

Real-time PCR：基線（baseline)：通常是3－15個循環(huán)的熒光信號，同一次反應中針對不同的基因需單獨設置基線。閾值（threshold)：自動設置是3-15個循環(huán)的熒光信號的標準偏差的10倍。手動設置：置于指數(shù)擴增期，剛好可以清楚地看到熒光信號明顯增強。同一次反應中針對不同的基因可單獨設置閾值，但對于同一個基因擴增一定要用同一個閾值。Ct值：與起始濃度的對數(shù)成線性關系，分析定量時候一般取Ct:15-35.太大或者太小都會導致定量的不準確。相對定量：通過與內(nèi)參基因Ct值之間的相差來計算基因之間的表達差異,一般是2-△△Ct。或者是考慮擴增效率的Pfaffl法。寧波細胞RT-PCR檢測技術

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