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Real-time PCR鏈反應的常見問題分析與解決方法:反應緩沖液未完全融化或未充分混勻。確保反應緩沖液融化完全并徹底混勻。引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設計引物。引物量過多。減少反應體系中引物的用量。模板量過多。質(zhì)粒DNA的用量應<50ng,而基因組DNA則應<200ng。外源DNA污染。確保操作的潔凈。陰性對照出現(xiàn)條帶:試劑,頭,工作臺污染。使用全新的試劑和頭,對工作臺進行清潔。條帶大小與理論不符:污染。使用全新的試劑和頭,對工作臺進行清潔。模板或引物使用錯誤。更換引物和模板?;騺喰?。對研究的基因進行序列分析和BLAST研究。逆轉錄-聚合酶鏈反應較廣用于表達譜,以確定基因的表達或鑒定RNA轉錄物的序列。PCR由變性-退火-延伸三個基本反應步驟構成。武漢血液PCR檢測技術供應商
PCR的反應條件:dNTP濃度過高會加快反應速度,但同時還可以增加堿基的錯誤摻入率。引物濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯誤率達2*E-4個核苷酸,一個30個循環(huán)的擴增反應0.1%-0.25%總錯誤率。在90~95度下可使整個基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結合。引物長度在15~25時退火溫度。熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應是通過新的雜合聚合酶實現(xiàn)的,這些酶在環(huán)境溫度下不活躍。深圳血液PCR檢測技術方案因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高,所以相應的對引物設計的要求就很高。
Real-time PCR的染料法和探針法的選擇:進行mRNA表達量的測定,采用染料法是比較經(jīng)濟實惠的;染料法可以通過比較熔解曲線的熔解峰位置得到產(chǎn)物特異性的情況;目的基因和內(nèi)參基因分管檢測,染料法可以選用Realtime染料PCRPreMIX,探針法主要應用于病毒RNA的檢測;以及單位點突變(SNP);多基因的合并檢測,探針法還可用于同一個反應中同時檢測目的基因和內(nèi)參基因的情況;而染料法則必須分管檢測。Real-time PCR:實時熒光定量PCR技術(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction簡稱Real-time PCR)是在定性PCR技術基礎上發(fā)展起來的核酸定量技術。實時熒光定量在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程,使每一個循環(huán)變得“可見”,之后通過Ct值和標準曲線對樣品中的DNA(orcDNA)的起始濃度進行定量的方法。
Real-time PCR原理:所謂實時熒光定量PCR技術,是指在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程,通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。DNA結合染料法,應用一種帶有熒光的、非特異的DNA結合染料檢測PCR過程中積累的擴增產(chǎn)物。檢測所有雙鏈DNA擴增產(chǎn)物,包括非特異反應產(chǎn)物,如引物二聚體??蓪θ魏坞p鏈DNA進行定量;不需要探針,因此減少了實驗設計及運轉成本;適合于大量基因的分析;簡單易用。實時熒光定量PCR:實時熒光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一種在DNA擴增反應中,以熒光化學物質(zhì)測每次聚合酶鏈式反應(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進行定量分析的方法。Real-time PCR是在PCR擴增過程中,通過熒光信號,對PCR進程進行實時檢測。由于在PCR擴增的指數(shù)時期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關系,所以成為定量的依據(jù)。Real-time PCR的基本目標是精確測量和鑒別非常微量的特異性核酸。
Real-time PCR:基線(baseline):通常是3-15個循環(huán)的熒光信號,同一次反應中針對不同的基因需單獨設置基線。閾值(threshold):自動設置是3-15個循環(huán)的熒光信號的標準偏差的10倍。手動設置:置于指數(shù)擴增期,剛好可以清楚地看到熒光信號明顯增強。同一次反應中針對不同的基因可單獨設置閾值,但對于同一個基因擴增一定要用同一個閾值。Ct值:與起始濃度的對數(shù)成線性關系,分析定量時候一般取Ct:15-35.太大或者太小都會導致定量的不準確。相對定量:通過與內(nèi)參基因Ct值之間的相差來計算基因之間的表達差異,一般是2-△△Ct。或者是考慮擴增效率的Pfaffl法。聚合酶鏈式反應又稱多聚酶鏈式反應。上海血液定量PCR技術服務
Real-time PCR探針法實驗結果穩(wěn)定重複性好,特異性更高。武漢血液PCR檢測技術供應商
聚合酶鏈式反應的試驗污染:陽性對照,在建立PCR反應實驗室及一般的檢驗單位都應設有PCR陽性對照,它是PCR反應是否成功、產(chǎn)物條帶位置及大小是否合乎理論要求的一個重要的參考標志。陽性對照要選擇擴增度中等、重復性好,經(jīng)各種鑒定是該產(chǎn)物的標本,如以重組質(zhì)粒為陽性對照,其含量宜低不宜高(100個拷貝以下)。但陽性對照尤其是重組質(zhì)粒及高濃度陽性標本,其對檢測或擴增樣品污染的可能性很大。因而當某一PCR試劑經(jīng)自己使用穩(wěn)定。武漢血液PCR檢測技術供應商
上海司鼎生物科技有限公司擁有從事生物科技領域內(nèi)的技術開發(fā)、技術轉讓、技術咨詢、技術服務,營養(yǎng)健康咨詢服務,商務咨詢,計算機軟件開發(fā),化工原料及產(chǎn)品(除危險化學品、監(jiān)控化學品、煙花爆竹、易制毒化學品),實驗室設備,儀表儀器的銷售。 【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動】等多項業(yè)務,主營業(yè)務涵蓋免疫印跡(WB)技術服務,熒光定量PCR技術服務,膜片鉗電生理技術服務,在體光纖成像記錄技術服務。公司目前擁有專業(yè)的技術員工,為員工提供廣闊的發(fā)展平臺與成長空間,為客戶提供高質(zhì)的產(chǎn)品服務,深受員工與客戶好評。上海司鼎生物科技有限公司主營業(yè)務涵蓋免疫印跡(WB)技術服務,熒光定量PCR技術服務,膜片鉗電生理技術服務,在體光纖成像記錄技術服務,堅持“質(zhì)量保證、良好服務、顧客滿意”的質(zhì)量方針,贏得廣大客戶的支持和信賴。公司力求給客戶提供全數(shù)良好服務,我們相信誠實正直、開拓進取地為公司發(fā)展做正確的事情,將為公司和個人帶來共同的利益和進步。經(jīng)過幾年的發(fā)展,已成為免疫印跡(WB)技術服務,熒光定量PCR技術服務,膜片鉗電生理技術服務,在體光纖成像記錄技術服務行業(yè)出名企業(yè)。