PCR實驗技術(shù)中的RT-PCR一步法和兩步法的優(yōu)缺點介紹:一步法:利用同一緩沖液,在同一體系中加入逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、Taq酶、4種dNTP直接進行mRNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴增。發(fā)現(xiàn)Taq酶不僅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反轉(zhuǎn)錄酶活性,可利用其雙重作用在同一體系中直接以mRNA為模板進行反轉(zhuǎn)錄和其后PCR擴增,從而使mRNA的PCR步驟更為簡化。所需樣品量減少到比較低限度,臨床小樣品的檢測非常有利。用一步法擴增可檢測出總RNA中小于1ng的低豐度mRNA.該法可用于低豐度mRNA的cDNA文庫的構(gòu)建及特異cDNA的克隆,并有可能與Taq酶的測序技術(shù)相組合,使得自動反轉(zhuǎn)錄、基因擴增與基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的測序在單管中進行。兩步法:由于單管反應時RT和PCR都不能在比較好條件下進行并且容易相互干擾,常只適宜用基因特異引物擴增較短的基因,及定量PCR.兩步法則是將RT和PCR分別進行,這樣使得兩個反應充分發(fā)揮各自的特點,更為靈活而且嚴謹,適合那些GC含量、二級結(jié)構(gòu)嚴重的模板或者是未知模板,以及多個基因的RT-PCR。熒光定量pcr正常值多少?黑龍江細胞pcr哪家好
PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復制過程,DNA的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性-退火-延伸三個基本反應步驟構(gòu)成:①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應作準備;②模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合;③引物的延伸:DNA模板-引物結(jié)合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基互補配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復制鏈,重復循環(huán)變性-退火-延伸三過程就可獲得更多的“半保留復制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍組織pcr怎么樣一步法熒光定量pcr在哪做?
PCR實驗技術(shù)中的高GC含量PCR(GC-richPCR)介紹:具有高GC含量(>65%)的模板由于G和C堿基間的強氫鍵影響,比較難以擴增。高GC含量序列同時也涉及二級結(jié)構(gòu)。因此,高GC含量序列可使DNA聚合酶在擴增時卡住,從而影響了DNA的合成。為了擴增高GC含量片段,雙鏈模板必須分離,以便引物結(jié)合及DNA聚合酶讀取序列。為了克服強GC相互作用,較常用的方法是依靠PCR添加劑或共溶劑來幫助DNA變性(圖6A),如DMSO。這些試劑通常會降低引物的Tm,所以退火溫度也需做相應的調(diào)整。高合成能力的DNA聚合酶由于其與模板的強結(jié)合能力,有助于高GC含量模板的PCR擴增(圖6B)。高熱穩(wěn)定性DNA聚合酶也有益于高GC含量PCR擴增,因為更高的變性溫度(如98℃代替95℃)可促進解鏈和PCR擴增。
PCR出現(xiàn)假陽性的原因分析。引物設(shè)計不合適:選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性,因而在進行PCR擴增時,擴增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現(xiàn)假陽性。需重新設(shè)計引物。靶序列或擴增產(chǎn)物的交叉污染:這種污染有兩種原因:一是整個基因組或大片段的交叉污染,導致假陽性。這種假陽性可用以下方法解決:①操作時應小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣器內(nèi)或濺出離心管外。②除了酶及其他不耐高溫的物質(zhì)外,所有試劑或器材均應高壓消毒。所用離心管均應一次性使用。③必要時,在加標本前,反應管和試劑用紫外線照射,以破壞存在的核酸。二是空氣中的小片段核酸污染,這些小片段比靶序列短,但有一定的同源性??苫ハ嗥唇?,與引物互補后,可擴增出PCR產(chǎn)物,而導致假陽性的產(chǎn)生,可用巢式PCR方法來減輕或消除。做pcr檢測,需要注意哪些事項?
PCR由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構(gòu)成:
1、模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應作準備。
2、模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合。3、引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基互補配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復制鏈。重復循環(huán)變性--退火--延伸三過程就可獲得更多的“半保留復制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍 熒光定量pcr的原理和步驟是什么?新疆高效pcr實驗室
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pcr是一種在體外擴增特定DNA序列的技術(shù)方法,通過與特定DNA區(qū)域兩端互補的寡核苷酸為引物(primer)在試管中DNA聚合酶選擇性地單獨復制合成介于兩引物直接的基因片段,如同DNA復制中的半保留復制一樣,新合成的基因片段與模板鏈形成新的DNA雙鏈,經(jīng)反復的變性(denature)引物退火(anerling)和引物延伸(extention)三步循環(huán),前一循環(huán)合成的DNA鏈成為下一循環(huán)引物結(jié)合的模板,每循環(huán)一次,反應體系的DNA的量就增加一倍,20-30次反復循環(huán),即可由微量的DNA模板開始獲得大量的DNA特異片段。近年來,PCR迅速發(fā)展,已深入生命科學的各個領(lǐng)域,技術(shù)方法不端完善,基本的PCR實驗技術(shù)主要有經(jīng)典PCR技術(shù)、RT-PCR技術(shù)、免疫-PCR技術(shù)、PCR-SSCP技術(shù)等。黑龍江細胞pcr哪家好
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