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來源: 發(fā)布時間:2022-01-05

PCR出現(xiàn)非特異性擴增帶的原因分析:PCR擴增后出現(xiàn)的條帶與預計的大小不一致,或大或小,或者同時出現(xiàn)特異性擴增帶與非特異性擴增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環(huán)次數(shù)過多有關。其次,是酶的質(zhì)和量,往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶則不出現(xiàn),酶的量過多有時也會出現(xiàn)非特異性擴增。其對策有:①必要時,重新設計引物。②減低酶的量或調(diào)換另一來源的酶。③降低引物量,適當增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。④適當提高退火溫度或采用二溫度點法(93℃變性,65℃左右退火與延伸,也叫兩步法)??孔V的pcr檢測外包公司推薦!安徽細胞pcr多少錢

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PCR實驗技術中的反向PCR介紹:反向PCR的目的在于擴增一段已知序列旁側的DNA,也就是說這一反應體系不是在一對引物之間而是在引物外側合成DNA.反向PCR可用于研究與已知DNA區(qū)段相連接的未知染色體序列,因此又稱為染色體步移。這時選擇的引物雖然與中心DNA兩末端序列互補,但引物3’端是相互反向的。反向PCR的操作流程:擴增前先用限制性內(nèi)切酶酶切樣品DNA,然后用DNA連接酶連接成一個環(huán)狀分子,通過反向PCR擴增引物的上游片段和下游片段。選擇多種限制性內(nèi)切酶,基本準則是選擇不能在非酶切位點切斷靶DNA的酶。裂解中心區(qū)的內(nèi)切酶使反向PCR只能擴增引物所定模板(依賴于引物)的上游或下游區(qū),而不裂解中心區(qū)的酶則使兩側序列都擴增Southern雜交來確定內(nèi)切酶用以產(chǎn)生大小適于環(huán)化及反向PCR的片段的末端片段大多數(shù)有核基因組含有大量中度和高度重復序列,所以往往需要兩組到三組嵌套引物四川組織pcr檢測做一次pcr檢測要多久?

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PCR引物設計的原則PCR反應中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設計引物時以一條DNA單鏈為基準(常以信息鏈為基準),5′端引物與位于待擴增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴增片段3′端的一小段DNA序列互補。(1)引物設計的基本原則引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC比較好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。引物內(nèi)部不應出現(xiàn)互補序列。兩個引物之間不應存在互補序列,尤其是避免3′端的互補重疊。引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續(xù)8個堿基在待擴增區(qū)以外不能有完全互補序列,否則易導致非特異性擴增。引物3‘端的堿基,特別是較末及倒數(shù)第二個堿基,應嚴格要求配對,比較好選擇是G和C。引物的5′端可以修飾。如附加限制酶位點,引入突變位點,用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。

PCR實驗技術中的Touch-downPCR介紹:Touch-downPCR又稱降落PCR.即選定一個溫度范圍,如50—35℃,每降1-2℃進行1-2個循環(huán),然后在50度下進行15個循環(huán)。Touch-down的原理隨著退火溫度的降低,特異性逐步降低,但特異性條帶在溫度較高時已經(jīng)擴增出來,其濃度遠遠超過非特異性條帶,隨著退火溫度的降低,特異性條帶優(yōu)先被擴增。選擇初始復性溫度的原則起始復性溫度應該比引物的Tm值高出5-10度,然后每個循環(huán)遞減1-2度Touch-downPCR的應用范圍lowcopyoftargetedDNA;highdegreedegeneracy(orlessspecific)ofthefirstsetofprimers;英瀚斯生物pcr,不只是檢測,還有專業(yè)數(shù)據(jù)分析。

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PCR由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構成:

1、模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應作準備。

2、模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合。3、引物的延伸:DNA模板--引物結合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基互補配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復制鏈。重復循環(huán)變性--退火--延伸三過程就可獲得更多的“半保留復制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍 簡述熒光定量pcr的基本原理。推薦pcr多少錢

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PCR實驗技術中的高GC含量PCR(GC-richPCR)介紹:具有高GC含量(>65%)的模板由于G和C堿基間的強氫鍵影響,比較難以擴增。高GC含量序列同時也涉及二級結構。因此,高GC含量序列可使DNA聚合酶在擴增時卡住,從而影響了DNA的合成。為了擴增高GC含量片段,雙鏈模板必須分離,以便引物結合及DNA聚合酶讀取序列。為了克服強GC相互作用,較常用的方法是依靠PCR添加劑或共溶劑來幫助DNA變性(圖6A),如DMSO。這些試劑通常會降低引物的Tm,所以退火溫度也需做相應的調(diào)整。高合成能力的DNA聚合酶由于其與模板的強結合能力,有助于高GC含量模板的PCR擴增(圖6B)。高熱穩(wěn)定性DNA聚合酶也有益于高GC含量PCR擴增,因為更高的變性溫度(如98℃代替95℃)可促進解鏈和PCR擴增。安徽細胞pcr多少錢

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