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PCR產(chǎn)物是否為特異性擴(kuò)增,其結(jié)果是否準(zhǔn)確可靠,必須對(duì)其進(jìn)行嚴(yán)格的分析與鑒定,才能得出正確的結(jié)論。PCR產(chǎn)物的分析,可依據(jù)研究對(duì)象和目的不同而采用不同的分析方法。凝膠電泳分析:PCR產(chǎn)物電泳,EB溴乙錠染色紫外儀下觀察,初步判斷產(chǎn)物的特異性。PCR產(chǎn)物片段的大小應(yīng)與預(yù)計(jì)的一致,特別是多重PCR,應(yīng)用多對(duì)引物,其產(chǎn)物片斷都應(yīng)符合預(yù)訐的大小,這是起碼條件。瓊脂糖凝膠電泳:通常應(yīng)用1~2%的瓊脂糖凝膠,供檢測(cè)用。聚丙烯酰胺凝膠電泳:6~10%聚丙烯酰胺凝膠電泳分離效果比瓊脂糖好,條帶比較集中,可用于科研及檢測(cè)分析。酶切分析:根據(jù)PCR產(chǎn)物中限制性內(nèi)切酶的位點(diǎn),用相應(yīng)的酶切、電泳分離后,獲得符合理論的片段,此法既能進(jìn)行產(chǎn)物的鑒定,又能對(duì)靶基因分型,還能進(jìn)行變異性研究。分子雜交:分子雜交是檢測(cè)PCR產(chǎn)物特異性的有力證據(jù),也是檢測(cè)PCR產(chǎn)物堿基突變的有效方法。Southern印跡雜交:在兩引物之間另合成一條寡核苷酸鏈(內(nèi)部寡核苷酸)標(biāo)記后做探針,與PCR產(chǎn)物雜交。此法既可作特異性鑒定,又可以提高檢測(cè)PCR產(chǎn)物的靈敏度,還可知其分子量及條帶形狀,主要用于科研。pcr檢測(cè)有哪些操作步驟?遼寧樣本pcr擴(kuò)增
PCR出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增帶的原因分析:PCR擴(kuò)增后出現(xiàn)的條帶與預(yù)計(jì)的大小不一致,或大或小,或者同時(shí)出現(xiàn)特異性擴(kuò)增帶與非特異性擴(kuò)增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補(bǔ)、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過(guò)高、退火溫度過(guò)低,及PCR循環(huán)次數(shù)過(guò)多有關(guān)。其次,是酶的質(zhì)和量,往往一些來(lái)源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來(lái)源的酶則不出現(xiàn),酶的量過(guò)多有時(shí)也會(huì)出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增。其對(duì)策有:①必要時(shí),重新設(shè)計(jì)引物。②減低酶的量或調(diào)換另一來(lái)源的酶。③降低引物量,適當(dāng)增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。④適當(dāng)提高退火溫度或采用二溫度點(diǎn)法(93℃變性,65℃左右退火與延伸,也叫兩步法)。四川有哪些pcrpcr檢測(cè)實(shí)驗(yàn)有哪些分類?
原位PCR就是在組織細(xì)胞里進(jìn)行PCR反應(yīng),它結(jié)合了具有細(xì)胞定位能力的原位雜交和高度特異敏感的PCR技術(shù)的優(yōu)點(diǎn),是細(xì)胞學(xué)科研與臨床診斷領(lǐng)域里的一項(xiàng)有較大潛力的新技術(shù)。原位PCR是Hasse等于1990年建立的,實(shí)驗(yàn)用的標(biāo)本是新鮮組織、石蠟包埋組織、脫落細(xì)胞、血細(xì)胞等。其基本方法為:1、固定組織或細(xì)胞:將組織細(xì)胞固定于預(yù)先用四氟乙烯包被的玻片上,并用多聚甲醛處理,再滅活除去細(xì)胞內(nèi)源性過(guò)氧化物酶。2、蛋白酶K消化處理:用60ug/ml的蛋白酶K將固定好的組織細(xì)胞片55℃消化處理2h后,96℃2min以滅活蛋白酶K。3、PCR擴(kuò)增:在組織細(xì)胞片上,加PCR反應(yīng)液,覆蓋并加液體石蠟后,直接放在擴(kuò)增儀的金屬板上,進(jìn)行PCR循環(huán)擴(kuò)增。有的基因擴(kuò)增儀帶有專門(mén)用于原位PCR的裝置。4、雜交:PCR擴(kuò)增結(jié)束后,用標(biāo)記的寡核苷酸探針進(jìn)行原位雜交。5、顯微鏡觀察結(jié)果。
PCR方法主要可以分為三類:終點(diǎn)PCR、qPCR和dPCR。終點(diǎn)PCR終點(diǎn)PCR是較原始、較簡(jiǎn)單的PCR方法,如今仍在被我們普遍使用。使用者只能在PCR反應(yīng)結(jié)束之后,通過(guò)凝膠電泳、毛細(xì)管電泳等方法對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)。終點(diǎn)PCR本身是無(wú)法定量的,因?yàn)樵摲磻?yīng)產(chǎn)出的DNA量不一定能反映較初情況。舉例來(lái)說(shuō),不同樣品和序列的擴(kuò)增效率是有差異的。qPCR和dPCR研究者們通過(guò)兩種途徑克服了PCR定量分析的挑戰(zhàn):實(shí)時(shí)定量PCR(qPCR)和數(shù)字PCR(dPCR)。qPCR主要是利用插入性染料或熒光探針(比如TaqMan),人們可以通過(guò)監(jiān)控PCR過(guò)程中的熒光強(qiáng)度比較多個(gè)樣品的DNA水平。數(shù)字PCR(dPCR)的基本工作原理很簡(jiǎn)單,先將樣品劃分為多個(gè)PCR反應(yīng),每個(gè)反應(yīng)較多只含有一個(gè)模板。然后通過(guò)計(jì)數(shù)正負(fù)反應(yīng)來(lái)確定初始樣品中模板分子的數(shù)量。pcr儀的使用說(shuō)明是什么?
PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的錨定PCR(AnchoredPCR)介紹:錨定PCR主要用于分析具有可變末端的DNA序列,Loh等用A-PCR對(duì)人外周血淋巴細(xì)胞T細(xì)胞受體α-鏈的mRNA的多變性進(jìn)行了分析。先合成cDNA,并用末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶在其3’-可變區(qū)末端加上一個(gè)PolyG尾巴。Loh等恒定區(qū)與可變區(qū)連接部位設(shè)一個(gè)引物,另一個(gè)引物是一個(gè)具5’-polyG尾巴的引物。帶有PolyG尾巴的引物是一個(gè)固定點(diǎn),它可以并與PolyG尾巴結(jié)合,無(wú)論其余部分序列如何,只識(shí)別片段末端,利用此法可從前述mRNA中檢出至少20種不同序列,每一種都是獨(dú)特的,表明A-PCR不對(duì)任何特殊序列有傾向性結(jié)果,可用于T細(xì)胞及其它部位抗體基因的研究。pcr檢測(cè)樣本的保存要求與方法?福建高效pcr怎么選擇
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PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的兼并引物PCR(DegeneratePrimer)介紹:兼并引物是指代替編碼單個(gè)氨基酸所有不同堿基可能性的不同序列的混合物。兼并度越低,產(chǎn)物特異性越強(qiáng)。設(shè)計(jì)引物時(shí)應(yīng)盡量選擇兼并性小的氨基酸,并避免引物3’末端兼并,因?yàn)?'端末尾3個(gè)堿基的退火足以在錯(cuò)誤位點(diǎn)起始PCR;次黃嘌呤可以同所有的堿基配對(duì),降低引物的退火溫度。因此,在引物設(shè)計(jì)時(shí),比較選擇兼并性小的氨基酸,并避免引物3'端被兼并,因?yàn)?'端末尾3個(gè)堿基的退火足以在錯(cuò)誤位點(diǎn)起始PCR;次黃嘌呤可以同所有的堿基配對(duì),降低引物的退火溫度。實(shí)驗(yàn)證明,用脫氧肌苷引物進(jìn)行PCR,可以代替編碼蛋白的多種兼并密碼子中的兼并堿基。遼寧樣本pcr擴(kuò)增
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