基于測(cè)序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強(qiáng)大之處，因?yàn)樗軌蛄私馔粏渭?xì)胞的多種生物分析指標(biāo)。如果說(shuō)單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息，那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜，為您帶來(lái)樣本的真實(shí)視圖。烈冰自2019年引進(jìn)的BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)以來(lái)，能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同，單細(xì)胞多組學(xué)簡(jiǎn)化了您需要開展的實(shí)驗(yàn)，也節(jié)省了您需要分析的樣本，而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本，還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性，因?yàn)槟恍枰ヅ洳鸱謽颖镜臄?shù)據(jù)集并通過(guò)計(jì)算來(lái)推斷各個(gè)組學(xué)之間的關(guān)系。烈冰一站式單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)：立足科學(xué)研究，解碼生命本質(zhì)。上海BD Rhapsody單...

為什么需要單細(xì)胞分辨率？ 生物學(xué)就像宇宙一樣。它非常復(fù)雜，有許多獨(dú)特的單體，也就是細(xì)胞。這些細(xì)胞相互作用并扮演不同的角色，在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動(dòng)多個(gè)過(guò)程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣，發(fā)現(xiàn)和定義這些細(xì)胞也需要高分辨率的工具，才能解開促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達(dá)異質(zhì)性。單細(xì)胞測(cè)序能夠在以一個(gè)細(xì)胞為功能單位中開展生物學(xué)研究，闡明具體細(xì)節(jié)，構(gòu)建出一幅更大、更精細(xì)的圖譜，說(shuō)明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細(xì)胞之間是如何相互作用的：患者為什么會(huì)復(fù)發(fā)？是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問(wèn)題。烈冰專注單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序領(lǐng)域。上海single cell RNA單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)公司單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)（Si...

現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)陣營(yíng)在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別。一個(gè)是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動(dòng)態(tài)結(jié)合，通過(guò)油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔，在這個(gè)空間，單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放，轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引，以便下游識(shí)別。BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)采用靜態(tài)微孔技術(shù)（Cyto-Seq具有類似的技術(shù)原理）。通過(guò)微孔板的物理分隔，將一個(gè)個(gè)單個(gè)細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠，一對(duì)一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺(tái)中。這樣，每一個(gè)細(xì)胞都會(huì)結(jié)合一個(gè)磁珠，那么在每一個(gè)磁珠中上長(zhǎng)滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，這...

單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對(duì)于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求，首先針對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié)：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列，不可避免的會(huì)出現(xiàn)低質(zhì)量的測(cè)序結(jié)果，存在各種情況的序列污染。因此序列過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估就會(huì)變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過(guò)測(cè)序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來(lái)表征，即堿基測(cè)序結(jié)果的錯(cuò)誤率在1% / 0.1%以下的比例。理想的測(cè)序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性，為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)，烈冰提供高性價(jià)比服務(wù)方案。成都single cell RNA單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)科研的魅力之處，在于無(wú)窮盡的探尋生命的本底，...

多樣本數(shù)據(jù)合并：Fraction of Reads Kept：合并樣本時(shí)，各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進(jìn)行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！深度的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時(shí)代。重...

科研的魅力之處，在于無(wú)窮盡的探尋生命的本底，通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序，我們對(duì)組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級(jí)到深層，并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致，那么不禁要問(wèn)一句，組織的空間位置到底重不重要？空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征，細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過(guò)程。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面，而不可否認(rèn)的是，此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄，像一個(gè)還未長(zhǎng)大的娃娃，雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層，但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個(gè)高峰。自2019年起，烈冰生物BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)已助力發(fā)表近20篇一區(qū)CNS高分文章。西安single cell RNA單細(xì)胞測(cè)序樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化，在對(duì)細(xì)...

烈冰生物BD Rhapsody平臺(tái)，采用精簡(jiǎn)的工作流程助力您的實(shí)驗(yàn)成功： 1.制備單細(xì)胞懸液：可使用碧迪醫(yī)療單細(xì)胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細(xì)胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動(dòng)移液器進(jìn)行液體交換 3.單細(xì)胞捕獲工作流程: (1)細(xì)胞上樣:上樣 575微升細(xì)胞懸液；系統(tǒng)未采用微流體通道設(shè)計(jì)，無(wú)需擔(dān)心通道堵寨；通過(guò)重力輕輕沉淀細(xì)胞，可捕獲脆弱細(xì)胞，BD Rhapsody微孔板包含大于220,000個(gè)分區(qū)，可在低雙細(xì)胞率下捕獲多達(dá)40000個(gè)細(xì)胞 (2)細(xì)胞上樣掃描：估算捕獲的活細(xì)胞數(shù)量和細(xì)胞多態(tài)率 (3)磁珠上樣：微孔的正六邊形幾何形狀...

什么時(shí)候要用到去死細(xì)胞的操作呢？跟進(jìn)烈冰生物多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)來(lái)看，當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測(cè)后，考慮對(duì)細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作。而太低活性的懸液（小于30%），懸液中細(xì)胞大量死亡，可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài)，失真嚴(yán)重，建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn)，保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。但需要注意到，去除死細(xì)胞的操作會(huì)損失一定的細(xì)胞數(shù)量，因此希望您在提供樣本時(shí)，盡可能提供足量的細(xì)胞，以備實(shí)驗(yàn)過(guò)程中可能存在的細(xì)胞死亡的問(wèn)題，BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對(duì)樣本起始細(xì)胞量的要求較低，一般提供10萬(wàn)個(gè)細(xì)胞以上均可滿足需求，特殊樣本可詳細(xì)咨詢烈冰生物。十...

烈冰生物搭建近10臺(tái)BD Rhapsody平臺(tái)，目前為全國(guó)范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供服務(wù)，BD Rhapsody平臺(tái)采用U型微孔板，1個(gè)板即對(duì)應(yīng)1個(gè)樣本（不混樣的情況下），每個(gè)通道一般捕獲細(xì)胞數(shù)在1000-10000個(gè)之間，而上限可捕獲40000細(xì)胞時(shí)也能獲得較低的雙細(xì)胞率，此外，單個(gè)細(xì)胞捕獲效率高達(dá)80%，可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型，有利于稀有樣本或小細(xì)胞量類型樣本研究；細(xì)胞可適性高，對(duì)細(xì)胞大?。ㄖ睆匠^(guò)40um細(xì)胞需要制備成細(xì)胞核）及類型無(wú)限制。細(xì)胞捕獲周期較短，能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)分離，且實(shí)驗(yàn)端捕獲細(xì)胞過(guò)程全程可視化進(jìn)行，保障每一例珍貴樣本實(shí)驗(yàn)的成功進(jìn)行，1天內(nèi)可完成從細(xì)胞懸液到...

單細(xì)胞獲得困難，不同組織要求不盡相同難以搞定？ 烈冰2000+項(xiàng)目消化經(jīng)驗(yàn)，100+組織類型解離protocol，精心設(shè)計(jì)不同組織實(shí)驗(yàn)的解離、細(xì)胞懸浮實(shí)驗(yàn)體系，確保單細(xì)胞的獲得。 凍存樣本無(wú)法實(shí)驗(yàn)，珍貴樣本無(wú)法使用？ 烈冰采用國(guó)際認(rèn)可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細(xì)胞過(guò)濾技術(shù)，確保凍存組織使用。 珍貴樣本，細(xì)胞數(shù)量太少，消化背景雜無(wú)法做單細(xì)胞？ 采用國(guó)際認(rèn)可的10X Genomics，BD Rhapsody雙平臺(tái)模式，根據(jù)樣本實(shí)際情況和用戶需求提供客觀有效的實(shí)驗(yàn)方案,細(xì)胞量少，背景雜也能做單細(xì)胞。 單細(xì)胞RNA分類精度不足，部分細(xì)胞無(wú)法細(xì)分？ 烈冰同時(shí)采用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，真正做...

烈冰生物搭建近10臺(tái)BD Rhapsody平臺(tái)，目前為全國(guó)范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供服務(wù)，BD Rhapsody平臺(tái)采用U型微孔板，1個(gè)板即對(duì)應(yīng)1個(gè)樣本（不混樣的情況下），每個(gè)通道一般捕獲細(xì)胞數(shù)在1000-10000個(gè)之間，而上限可捕獲40000細(xì)胞時(shí)也能獲得較低的雙細(xì)胞率，此外，單個(gè)細(xì)胞捕獲效率高達(dá)80%，可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型，有利于稀有樣本或小細(xì)胞量類型樣本研究；細(xì)胞可適性高，對(duì)細(xì)胞大?。ㄖ睆匠^(guò)40um細(xì)胞需要制備成細(xì)胞核）及類型無(wú)限制。細(xì)胞捕獲周期較短，能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)分離，且實(shí)驗(yàn)端捕獲細(xì)胞過(guò)程全程可視化進(jìn)行，保障每一例珍貴樣本實(shí)驗(yàn)的成功進(jìn)行，1天內(nèi)可完成從細(xì)胞懸液到...

烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)體系，不僅提供10X Genomics和BD Rhapsody兩大國(guó)際認(rèn)可的單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，在“附加”產(chǎn)品上，我們提供BD FACS Melody流式細(xì)胞儀，滿足您對(duì)特殊細(xì)胞類型的富集需求，自主研發(fā)的Panocell單細(xì)胞捕獲芯片，可兼容BD 平臺(tái)全套原裝磁珠、試劑和protocol,為您提供完整的單細(xì)胞多組學(xué)解決方案。從細(xì)胞多樣本分析和染色所需的試劑到檢測(cè)試劑盒，生物信息分析工具，和在線大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)、精簡(jiǎn)方案和專業(yè)團(tuán)隊(duì)技術(shù)支持，烈冰生物可為您提供用于單細(xì)胞多組學(xué)甚至到空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的各種工具，助您加速科研探索之旅。附加流式分選細(xì)胞表面Marker，對(duì)于較低分辨率的標(biāo)志...

關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)樣本制備，這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致，也就是通過(guò)酶促或機(jī)械消化、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟，以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞，并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要，您還可以使用抗體對(duì)樣本進(jìn)行染色，標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通過(guò)FACS來(lái)富集感興趣的細(xì)胞類型。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定。也許需要額外的制備步驟，具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度、細(xì)胞大小，以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析。無(wú)論具體的考慮因素如何，所有樣本類型都遵循同一個(gè)基本原則，那就是生...

關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)樣本制備，這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致，也就是通過(guò)酶促或機(jī)械消化、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟，以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞，并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要，您還可以使用抗體對(duì)樣本進(jìn)行染色，標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通過(guò)FACS來(lái)富集感興趣的細(xì)胞類型。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定。也許需要額外的制備步驟，具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度、細(xì)胞大小，以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析。無(wú)論具體的考慮因素如何，所有樣本類型都遵循同一個(gè)基本原則，那就是生...

您的珍貴樣本，還可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)，BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)采用微孔技術(shù)，對(duì)細(xì)胞的捕獲沒(méi)有偏好性，實(shí)現(xiàn)高達(dá)80%的微孔板捕獲率，由于單個(gè)微孔板中容納了22萬(wàn)+個(gè)微孔，而現(xiàn)階段單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)技術(shù)通常要求單個(gè)樣本捕獲3000-5000，至高達(dá)10000個(gè)細(xì)胞，即可滿足科研探索需求，因此這種“泊松分布”的原理類似于上樣細(xì)胞的無(wú)限稀釋過(guò)程，但22萬(wàn)+微孔的存在，也對(duì)大體量細(xì)胞數(shù)目的科學(xué)研究有很好的包容性，細(xì)胞通量分為可擴(kuò)展至100-40000個(gè)細(xì)胞的捕獲（單個(gè)微孔板），滿足您的多重需求。2019年，烈冰已助力發(fā)表了采用BD Rahpsody平臺(tái)的單...

細(xì)胞計(jì)數(shù)和活力評(píng)估在評(píng)估樣本質(zhì)量時(shí)，需要在細(xì)胞清洗和過(guò)濾之后測(cè)定細(xì)胞活力，這一點(diǎn)至關(guān)重要。測(cè)定細(xì)胞活力有許多種方法，烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序經(jīng)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)臺(tái)盼藍(lán)法在鑒定活細(xì)胞與死細(xì)胞的比例時(shí)效果很好。細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性以及目標(biāo)回收量和實(shí)際回收量之間的一致性，取決于我們了解樣本中有多少個(gè)細(xì)胞。一旦過(guò)濾和清洗完成，可采用細(xì)胞計(jì)數(shù)設(shè)備（如血球計(jì)數(shù)器或自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀）進(jìn)行定量。這些設(shè)備不但能提供準(zhǔn)確的細(xì)胞計(jì)數(shù)，還能計(jì)算出向微流體芯片上樣適量細(xì)胞所需的細(xì)胞懸液體積。烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測(cè)序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。濟(jì)南BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)您的珍貴樣本，還可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲...

對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序而言，常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜，在此基礎(chǔ)上再開展后續(xù)各項(xiàng)分析，并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類（cell cluster）為討論對(duì)象，而不是像常規(guī)Bulk測(cè)序一樣以組別為分析對(duì)象，因此單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目對(duì)樣本入組要求沒(méi)有Bulk測(cè)序那樣嚴(yán)格，但是單細(xì)胞測(cè)序，特別是目的為圖譜研究時(shí)，需要通過(guò)提高樣本復(fù)雜度（增加樣本數(shù)），盡可能的構(gòu)建某一疾病類型、群體細(xì)胞圖譜信息。因此，單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)時(shí)首先需要保證生物學(xué)重復(fù)，不同樣本來(lái)源的樣本建議單獨(dú)進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲、建庫(kù)、測(cè)序，以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù)，單個(gè)樣本分別捕獲細(xì)胞時(shí)，后續(xù)分析除了整體分析以外，還可以做單樣本分析，保證分析的完備準(zhǔn)確性。烈冰科技已...

單細(xì)胞測(cè)序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡(jiǎn)單方便：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器的操作簡(jiǎn)單，不需要命令行操作。簡(jiǎn)單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等；3D立體展示，文章動(dòng)圖先人一步：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器針對(duì)t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。基于磁珠Barcode和UMI及pol...

烈冰生物BD Rhapsody平臺(tái)，采用精簡(jiǎn)的工作流程助力您的實(shí)驗(yàn)成功： 1.制備單細(xì)胞懸液：可使用碧迪醫(yī)療單細(xì)胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細(xì)胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動(dòng)移液器進(jìn)行液體交換 3.單細(xì)胞捕獲工作流程: (1)細(xì)胞上樣:上樣 575微升細(xì)胞懸液；系統(tǒng)未采用微流體通道設(shè)計(jì)，無(wú)需擔(dān)心通道堵寨；通過(guò)重力輕輕沉淀細(xì)胞，可捕獲脆弱細(xì)胞，BD Rhapsody微孔板包含大于220,000個(gè)分區(qū)，可在低雙細(xì)胞率下捕獲多達(dá)40000個(gè)細(xì)胞 (2)細(xì)胞上樣掃描：估算捕獲的活細(xì)胞數(shù)量和細(xì)胞多態(tài)率 (3)磁珠上樣：微孔的正六邊形幾何形狀...

所謂的高通量測(cè)序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測(cè)序，是將 DNA（或者 cDNA）隨機(jī)片段化、加接頭，制備測(cè)序文庫(kù)，通過(guò)對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬(wàn)計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng)，檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào)，獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法（Sanger法等）相比，高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有明顯的優(yōu)勢(shì)，又快（兩天）又多（數(shù)百萬(wàn)克?。?，成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測(cè)序是一個(gè)系統(tǒng)的工程，開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見(jiàn)解是否與您的研究問(wèn)題相匹配，如果匹配，實(shí)驗(yàn)過(guò)程如何規(guī)劃，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇，樣本如何制備，數(shù)據(jù)如何分析等等，而在這一切開始之前，我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了，從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持，我們開通全線對(duì)接渠道，...

烈冰生物成立于2010年，與時(shí)俱進(jìn)，堅(jiān)持為科研學(xué)者提供國(guó)際前沿的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)和深度的生物信息數(shù)據(jù)分析服務(wù)，已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)****。專注于“單細(xì)胞測(cè)序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域，在上海、北京、廣州、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場(chǎng)所，并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營(yíng)銷、運(yùn)營(yíng)中心。2016年起連續(xù)被評(píng)為上海市****，60+項(xiàng)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)，轉(zhuǎn)化率近80%。產(chǎn)品覆蓋從單細(xì)胞測(cè)序，核測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等多組學(xué)聯(lián)合的實(shí)驗(yàn)+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺(tái)。為600+國(guó)內(nèi)高校和醫(yī)院、5000+深度合作學(xué)者用戶、10000+生命科學(xué)探索的重要科研項(xiàng)目在醫(yī)藥開發(fā)、科學(xué)研究、醫(yī)學(xué)及...

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié)：主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過(guò)濾標(biāo)準(zhǔn)：由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中，并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞，導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此，我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)過(guò)濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例，細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過(guò)分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn)，當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候，結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過(guò)濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候，選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn)；否則，選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因...

關(guān)于BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)的樣本類型和樣本制備 ：在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊，獲得分離良好的細(xì)胞懸液、且細(xì)胞活力高（＞70%）；此外，了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞（一般直徑不大于50μm）均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的BD Rhapsody平臺(tái)兼容。一般來(lái)說(shuō)，細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來(lái)源和細(xì)胞類型而變化。每種組織類型都是獨(dú)特的，因此，必須在開始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備，烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn)，累積10+物種、50+組織的消化protocol，若您的樣本為組織，且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液，烈...

關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)樣本制備，這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致，也就是通過(guò)酶促或機(jī)械消化、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟，以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞，并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要，您還可以使用抗體對(duì)樣本進(jìn)行染色，標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通過(guò)FACS來(lái)富集感興趣的細(xì)胞類型。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定。也許需要額外的制備步驟，具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度、細(xì)胞大小，以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析。無(wú)論具體的考慮因素如何，所有樣本類型都遵循同一個(gè)基本原則，那就是生...

烈冰與國(guó)內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作，服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu)，1000+客戶和5000+重要科研項(xiàng)目，助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國(guó)際學(xué)術(shù)期刊（不完全統(tǒng)計(jì)），在單細(xì)胞領(lǐng)域，烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇，總IF＞300+，IF＞10+以上文章占比65%以上，包含Immunity、Nature Cell Biology、Nature Plants 、Advanced Science等生物領(lǐng)域國(guó)際主流學(xué)術(shù)期刊，已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制，免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。豐富的測(cè)序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)...

烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)組中心，多地部署搭建BD Rhapsody單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng)，為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程，該系統(tǒng)可通過(guò)簡(jiǎn)單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng)，對(duì)高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲，由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類型的二代測(cè)序（NGS）文庫(kù)。之后對(duì)文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)（云平臺(tái)）的數(shù)據(jù)可視化分析，實(shí)現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度。2019年，烈冰已助力發(fā)表了采用BD Rahpsody平臺(tái)的單細(xì)胞風(fēng)濕類文章。上海scRNA單細(xì)胞平臺(tái)所謂的高通量測(cè)序技...

基因和基因產(chǎn)物并不是單獨(dú)運(yùn)作的，而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復(fù)雜通路、網(wǎng)絡(luò)和分子系統(tǒng)，這些合在一起實(shí)現(xiàn)了細(xì)胞、組織和生物體的運(yùn)作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用，對(duì)于了解生物系統(tǒng)如何運(yùn)作至關(guān)重要。”為了推動(dòng)科學(xué)發(fā)現(xiàn)，科學(xué)家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復(fù)雜性的研究工具。對(duì)于越來(lái)越多的研究人員來(lái)說(shuō)，單細(xì)胞RNA測(cè)序和單細(xì)胞多組學(xué)——即在單細(xì)胞分辨率下對(duì)基因表達(dá)及其他基于DNA、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進(jìn)行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學(xué)問(wèn)題上已證實(shí)是行之有效的。BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)同時(shí)兼容單細(xì)胞蛋白組測(cè)序（Ab-seq）和免疫組庫(kù)測(cè)序等工作。濟(jì)南scRNA單細(xì)胞平臺(tái)烈...

烈冰生物BD Rhapsody平臺(tái)，采用精簡(jiǎn)的工作流程助力您的實(shí)驗(yàn)成功： 1.制備單細(xì)胞懸液：可使用碧迪醫(yī)療單細(xì)胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細(xì)胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動(dòng)移液器進(jìn)行液體交換 3.單細(xì)胞捕獲工作流程: (1)細(xì)胞上樣:上樣 575微升細(xì)胞懸液；系統(tǒng)未采用微流體通道設(shè)計(jì)，無(wú)需擔(dān)心通道堵寨；通過(guò)重力輕輕沉淀細(xì)胞，可捕獲脆弱細(xì)胞，BD Rhapsody微孔板包含大于220,000個(gè)分區(qū)，可在低雙細(xì)胞率下捕獲多達(dá)40000個(gè)細(xì)胞 (2)細(xì)胞上樣掃描：估算捕獲的活細(xì)胞數(shù)量和細(xì)胞多態(tài)率 (3)磁珠上樣：微孔的正六邊形幾何形狀...

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞上樣數(shù)，為什么不建議捕獲到的細(xì)胞數(shù)量越高越好？一味地追求高數(shù)量的細(xì)胞捕獲可能會(huì)存在一些問(wèn)題。例如在上機(jī)細(xì)胞懸液濃度固定時(shí)，如果目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000，上樣細(xì)胞懸液體積勢(shì)必增加，在細(xì)胞懸液質(zhì)量不是很理想（細(xì)胞活性5%、結(jié)團(tuán)率均>5%）的情況下，引入的背景信號(hào)會(huì)增加，分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括：cell、non-cell無(wú)法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低。當(dāng)cell和non-cell無(wú)法有效區(qū)分時(shí)，會(huì)使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽(yáng)性和假陰性結(jié)果！當(dāng)目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)很大時(shí)，多細(xì)胞率會(huì)增加，數(shù)據(jù)分析時(shí)，此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測(cè)數(shù)和UMI檢...

烈冰生物BD Rhapsody平臺(tái)，采用精簡(jiǎn)的工作流程助力您的實(shí)驗(yàn)成功： 1.制備單細(xì)胞懸液：可使用碧迪醫(yī)療單細(xì)胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細(xì)胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動(dòng)移液器進(jìn)行液體交換 3.單細(xì)胞捕獲工作流程: (1)細(xì)胞上樣:上樣 575微升細(xì)胞懸液；系統(tǒng)未采用微流體通道設(shè)計(jì)，無(wú)需擔(dān)心通道堵寨；通過(guò)重力輕輕沉淀細(xì)胞，可捕獲脆弱細(xì)胞，BD Rhapsody微孔板包含大于220,000個(gè)分區(qū)，可在低雙細(xì)胞率下捕獲多達(dá)40000個(gè)細(xì)胞 (2)細(xì)胞上樣掃描：估算捕獲的活細(xì)胞數(shù)量和細(xì)胞多態(tài)率 (3)磁珠上樣：微孔的正六邊形幾何形狀...