二代測序——蛋白質(zhì)甲基化 概念及位置:蛋白質(zhì)甲基化是指在蛋白質(zhì)的氨基酸殘基上添加甲基基團(tuán)。常見的甲基化修飾位點(diǎn)包括精氨酸(Arg)和賴氨酸(Lys)殘基。 作用 1、調(diào)節(jié)蛋白質(zhì) - 蛋白質(zhì)相互作用:例如,組蛋白(染色體的組成成分)的甲基化...
什么樣本可以做二代測序?② 組織樣本 新鮮組織:如手術(shù)切除的**組織、活檢組織等。新鮮組織樣本中的細(xì)胞完整性較好,能夠提供高質(zhì)量的DNA和RNA。在**研究中,對新鮮**組織進(jìn)行全基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序等,可以深入了解**的基因突變、基因表達(dá)變...
二代測序——技術(shù)原理類問題 二代測序與一代測序的區(qū)別是什么:一代測序技術(shù)如Sanger測序,一次只能讀取一條DNA序列,通量低、速度慢、成本高,但準(zhǔn)確性高,適用于對少量基因片段的精確測序。而二代測序技術(shù)具有高通量、速度快、成本低等優(yōu)點(diǎn),可以同時(shí)對大量...
什么樣本可以做二代測序?① 1、血液樣本 全血:這是最常見的樣本類型之一。血液中含有白細(xì)胞,其細(xì)胞核內(nèi)有完整的基因組DNA。通過提取白細(xì)胞中的DNA,可以進(jìn)行全基因組測序、全外顯子組測序等。例如,在遺傳病的基因診斷中,抽取患者的全血,提取DNA...
④二代測序一般多久出結(jié)果? 4、數(shù)據(jù)分析的復(fù)雜程度 數(shù)據(jù)分析是二代測序的重要環(huán)節(jié)。簡單的分析,如檢測已知的單核苷酸多態(tài)性(SNP),可以通過與參考基因組比對后利用一些成熟的軟件快速完成。但如果是進(jìn)行復(fù)雜的分析,如尋找新的基因融合事件、復(fù)雜結(jié)構(gòu)變...
二代測序——轉(zhuǎn)錄組測序的實(shí)驗(yàn)流程(下) 測序 根據(jù)研究需求和預(yù)算選擇合適的測序平臺,如 Illumina 測序平臺。它的測序原理主要是邊合成邊測序(SBS)。在測序過程中,dNTP(脫氧核糖核苷三磷酸)帶有不同顏色的熒光標(biāo)記,當(dāng)新的 dNTP ...
①二代測序一般多久出結(jié)果? 二代測序(Next-GenerationSequencing,NGS)出結(jié)果的時(shí)間會(huì)受到多種因素的影響,一般在數(shù)天到數(shù)周不等。 1、樣本類型和質(zhì)量 不同的樣本類型處理時(shí)間不同。例如,血液樣本相對容易處理,提取D...
二代測序——甲基化的作用和檢測方法有哪些? 作用 基因表達(dá)調(diào)控:DNA 甲基化通常與基因沉默有關(guān)。例如,在**發(fā)生過程中,某些抑*基因的啟動(dòng)子區(qū)域(調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄起始的 DNA 序列)可能會(huì)發(fā)生高甲基化,導(dǎo)致這些基因無法正常表達(dá),從而失去對**細(xì)...
二代測序——技術(shù)原理類問題 二代測序與一代測序的區(qū)別是什么:一代測序技術(shù)如Sanger測序,一次只能讀取一條DNA序列,通量低、速度慢、成本高,但準(zhǔn)確性高,適用于對少量基因片段的精確測序。而二代測序技術(shù)具有高通量、速度快、成本低等優(yōu)點(diǎn),可以同時(shí)對大量...
二代測序——技術(shù)原理類問題 二代測序與一代測序的區(qū)別是什么:一代測序技術(shù)如Sanger測序,一次只能讀取一條DNA序列,通量低、速度慢、成本高,但準(zhǔn)確性高,適用于對少量基因片段的精確測序。而二代測序技術(shù)具有高通量、速度快、成本低等優(yōu)點(diǎn),可以同時(shí)對大量...
二代測序的建庫步驟④ 四、接頭連接 接頭選擇:根據(jù)測序平臺的要求選擇合適的接頭。不同的二代測序平臺(如Illumina、IonTorrent等)有各自特定設(shè)計(jì)的接頭。這些接頭包含與測序平臺的流動(dòng)池(flowcell)表面互補(bǔ)的序列,用于將DNA...
宏基因組二代測序,你了解多少? 宏基因組二代測序(mNGS)是一項(xiàng)覆蓋病原譜廣且高通量的檢測技術(shù),已在臨床領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用。對于血液病患者,病原mNGS通過對樣本快速高通量測序,可以獲得更準(zhǔn)確、相對無偏倚的病原信息,對病原診斷起到積極的作用,尤其...