廣州Protein AG免疫沉淀實驗視頻

來源: 發(fā)布時間:2024-06-14

免疫沉淀(Co-IP)實驗中抗體的選擇非常關鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結合,導致假陽性結果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應用驗證:選擇已經過免疫沉淀(Co-IP)或相關應用(如Western blot, IHC)驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應商信息:選擇信譽良好的抗體供應商,并查看供應商提供的技術數(shù)據和客戶評價,以幫助做出決策。
免疫沉淀抗體的選擇?廣州Protein AG免疫沉淀實驗視頻

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免疫沉淀技術RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)的實驗方法基于以下幾個關鍵步驟:
1. 細胞裂解:首先,細胞或組織樣本被裂解,以釋放細胞內的蛋白質和RNA復合物。
2.抗體特異性結合:裂解后的樣本中加入針對特定RNA結合蛋白的抗體。這些抗體能夠特異性地識別并結合到目標蛋白。
3. 免疫復合物形成:抗體與目標蛋白結合后,形成抗體-蛋白質-RNA復合物。
4. 親和介質捕獲:使用蛋白A或蛋白G結合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)來捕獲這些抗體-蛋白質-RNA復合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結合,從而拉下與之結合的復合物。
5. 洗滌:捕獲的復合物被洗滌以去除未特異性結合的蛋白質和RNA。
6. RNA分離和分析:從珠子上洗脫或消化復合物,分離出RNA,并進行進一步的分析,如qPCR、Northern blot或高通量測序(RNA-Seq)。
廣州Protein AG免疫沉淀實驗視頻免疫沉淀技術是什么?

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免疫沉淀ChIP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結構  (直徑 50-150 μm)  可以結合抗體  (繼而結合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設備。瓊脂糖珠呈多孔結構,這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質相互接觸,具有更高的結合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結合表面積滿足高容量的抗體結合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結合能力較強,而磁珠在得率,可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。

RIP技術的優(yōu)勢在于:
1. 特異性:利用特異性抗體,可以精確地捕獲目標RNA結合蛋白及其相互作用的RNA。
2. 應用場景多:適用于研究RNA結合蛋白、miRNA、lncRNA等非編碼RNA與蛋白質的相互作用。
3. 技術結合:RIP后的RNA可以用于多種下游分析,如qPCR、測序等,為研究RNA的功能和調控提供了重要信息。
RIP技術的限制包括:
1. 抗體質量:需要高質量的特異性抗體,否則可能得到假陽性或假陰性結果。
2. 非特異性結合:可能存在非特異性結合問題,需要仔細的實驗設計和對照來控制。
免疫沉淀技術的應用。

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Co-IP(免疫共沉淀)技術主要用于研究蛋白質之間的相互作用,其實驗設計如下:
1. 樣品準備:Co-IP實驗通常有兩種,一種是內源性蛋白相互作用驗證,一種是非內源性蛋白相互作用驗證。內源性相互作用通過質粒共轉染的方式將兩種蛋白轉染至同一細胞內表達;非內源性相互作用則是將含有靶蛋白的組織進行預處理及細胞裂解獲得細胞裂解液。
2. 沉淀誘餌蛋白:利用磁珠偶聯(lián)抗體沉淀誘餌蛋白。在樣品中加入磁珠偶聯(lián)抗體,抗體會與誘餌蛋白結合,利用磁鐵將磁珠拉下,同時誘餌蛋白會一起被沉淀出來。
3. SDS-PAGE及WB檢測:得到沉淀后,需要驗證沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE將蛋白復合物分離,隨后利用WB檢測是否存在靶蛋白。
4. 實驗對照設置:為了避免“假陽性”,需要設置正確的對照,包括陰性對照和陽性對照(Input組)。Input組為直接利用抗體對細胞裂解液進行WB檢測,驗證細胞裂解液中存在蛋白。
5. 結果真實性:確保共沉淀的蛋白是由所加入的抗體沉淀得到的,而并非外源非特異蛋白。使用單克隆抗體有助于避免污染的發(fā)生。
免疫沉淀技術IP的實驗設計。蘇州ChIP免疫沉淀實驗原理

免疫沉淀技術ChIP的優(yōu)缺點是什么?廣州Protein AG免疫沉淀實驗視頻

免疫沉淀RIP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結構  (直徑 50-150 μm)  可以結合抗體  (繼而結合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設備。瓊脂糖珠呈多孔結構,這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質相互接觸,具有更高的結合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結合表面積滿足高容量的抗體結合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結合能力較強,而磁珠在得率,可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
廣州Protein AG免疫沉淀實驗視頻

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