上海crispr脫靶檢測政策

插入突變風險評估一些整合性載體（如逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒、轉(zhuǎn)座子）可將外源基因插入整合到細胞基因組中，這可能會導(dǎo)致關(guān)鍵基因突變或jihuo原基因，從而導(dǎo)致惡性liu風險增加。影響插入突變的關(guān)鍵風險因素包括：（1）載體的整合特征，如插入位點的偏好性；（2）載體的設(shè)計，如增強子、啟動子等構(gòu)建元件的活性，影響鄰近基因的潛力；產(chǎn)生剪接突變體的潛在剪接位點或多聚腺苷酸信號等；（3）細胞載體拷貝數(shù)；4）轉(zhuǎn)基因表達產(chǎn)物的功能活性（如與細胞生長調(diào)控相關(guān)）和表達水平；5）靶細胞群的轉(zhuǎn)化可能性，這可能與細胞的分化狀態(tài)、增殖潛力、體外培養(yǎng)條件和體內(nèi)植入環(huán)境等有關(guān)。檢測脫靶效應(yīng)比較好的方法:CIRCLE-seq。上海crispr脫靶檢測政策

gRNA的長度和錯配： 17個核苷酸長度的gRNA顯示出更高的基因組編輯效率。相比之下，18-20 bp的長度顯示出較低的基因組編輯效率。在人類細胞中減少潛在脫靶效應(yīng)的指導(dǎo)方針：1) 應(yīng)避免在PAM的7-10 bp范圍內(nèi)靶序列有超過3個錯配；2) 在PAM的12 bp內(nèi)，應(yīng)避免sgRNA 凸起以減少脫靶效應(yīng)。gRNA的化學(xué)修飾：在gRNA核糖磷酸骨架中加入2?-O-甲基-3?-膦?；宜狨?dǎo)致位點特異性修飾，使脫靶切割減少40-120倍，同時保持靶向性能。gRNA上游5'發(fā)夾結(jié)構(gòu)的修飾可以提高Cas9和Cas12的特異性，降低脫靶效應(yīng)。定量脫靶檢測評估脫靶檢測政策，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結(jié)果準確率高。

基因zhiliao產(chǎn)品特有的可能會引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風險因素包括：基因組整合活性基因zhiliao產(chǎn)品可能會采用修飾宿主基因組的技術(shù)，并有可能在宿主細胞或組織中持續(xù)存在。很多基因zhiliao載體的基因整合不會指向基因組的特定位點，可能在整合位點處產(chǎn)生插入突變、或jihuo整合位點附近的原基因等，進而破壞重要基因功能或增加惡性liu的風險，例如，國外已有多項研究報告在接受了使用γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒載體轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因修飾細胞zhiliao的受試者中發(fā)生白血病。因此，對于存在此類風險的產(chǎn)品，有必要進行長期隨訪臨床研究以評估出現(xiàn)遲發(fā)不良反應(yīng)的風險。

檢測方法的敏感度、特異性和可重復(fù)性應(yīng)經(jīng)過驗證，并設(shè)計適當?shù)年栃院完幮詫φ?；當體內(nèi)靶細胞或替代細胞中載體序列陽性的比例超出預(yù)期范圍時，應(yīng)開展克隆性生長的評估。如果存在優(yōu)勢克隆或單克隆生長，應(yīng)在不超過3個月的時間內(nèi)再次檢測確認，并盡快開展整合位點的分析。當載體的整合位點確定后，應(yīng)與人類基因組數(shù)據(jù)庫及基因組的其他數(shù)據(jù)庫等進行比較，確定整合位點的基因功能，評估是否與包括zheng在內(nèi)的任何疾病有關(guān)。如果受試者體內(nèi)出現(xiàn)載體陽性細胞的克隆性生長，或檢測發(fā)現(xiàn)基因整合位點在基因或相關(guān)基因附近，應(yīng)縮短檢測間隔至不超過3個月并密切監(jiān)測惡性liu征兆，直至檢測不到基因zhiliao載體。脫靶檢測方法，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結(jié)果準確率高。

由于設(shè)計的sgRNA會與非靶點DNA序列錯配，引入非預(yù)期的基因突變，即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性，這無疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此，研究者希望能開發(fā)有效的方法來檢測脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評估方法中，有一種方法為GUIDE-seq，其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸（dsODN）標記CRISPR/Cas誘導(dǎo)的脫靶斷裂，然后對標簽所在的基因組區(qū)域進行高通量測序，通過生物信息學(xué)分析從而確定脫靶位點。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測CRISPR脫靶效應(yīng)，從而改變了以往先預(yù)測假定脫靶位點再檢測的思路；與其他的評估方法相比，GUIDE-seq更精確、更靈敏。選擇潛在的脫靶位點，例如選擇gRNA預(yù)測網(wǎng)站上Top 5潛在脫靶位點，進行Sanger測序單克隆；廣州高精度脫靶檢測評估

基因編輯治療過程中安全性評價，即脫靶效應(yīng)的檢測。上海crispr脫靶檢測政策

對基于慢病毒/逆轉(zhuǎn)錄病毒載體的基因zhiliao產(chǎn)品，如出現(xiàn)與可復(fù)制xingbing毒可能相關(guān)的不良事件，還應(yīng)開展可復(fù)制xingbing毒（replicablecompetentlentivirus/retrovirus，RCL/RCR）的檢測。關(guān)于基因編輯產(chǎn)品的特殊考慮基因編輯產(chǎn)品除了適用基因zhiliao產(chǎn)品的一般考慮以及整合性載體的特殊考慮外，長期隨訪中還應(yīng)額外關(guān)注脫靶風險，量化評估脫靶活性和在靶活性之間的相關(guān)性，或利用在靶活性來預(yù)測脫靶活性的水平。如果基因zhiliao產(chǎn)品通過全身給yaofang式遞送，長期隨訪中的安全性監(jiān)測不僅包括靶qiguan或靶組織的脫靶活性，而且還應(yīng)包括可能發(fā)生在其他組織和qiguan中的脫靶活性。上海crispr脫靶檢測政策