蛋白質(zhì)片段互補(bǔ)分析(PCA,也稱(chēng)為雙分子熒光互補(bǔ))和雙雜交篩選允許檢測(cè)細(xì)胞中蛋白質(zhì)相互作用的形成/抑制。PCA將單個(gè)檢測(cè)蛋白(熒光素酶、GFP、GAL)分成兩部分,這些部分與感興趣的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用融合;如果伴侶結(jié)合,檢測(cè)蛋白會(huì)重新形成并檢測(cè)到信號(hào)。高內(nèi)涵成像平臺(tái)(HCS)由于其能夠提供出色的單細(xì)胞分析功能和短的數(shù)據(jù)采集時(shí)間獲得大家的青睞。一般的實(shí)驗(yàn)流程為設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)并使用自動(dòng)分液儀將細(xì)胞接種到96、384或1536孔板中;然后加入化合物,由于細(xì)胞在孵育過(guò)程中會(huì)對(duì)化合物做出反應(yīng),隨后對(duì)細(xì)胞進(jìn)行染色,并通過(guò)HCS成像系統(tǒng)獲取圖像,通過(guò)軟件分析獲取的圖像以確定化合物的劑量反應(yīng)。高內(nèi)涵高通量篩選系統(tǒng)。寧夏高通量篩選小分子庫(kù)
高通量篩選技術(shù),是目前藥物篩選領(lǐng)域研究的重要課題,近年來(lái),對(duì)它的研究應(yīng)用雖然已取得了長(zhǎng)足的發(fā)展,但仍然存在許多難題,如體外模型的篩選結(jié)果與整體藥理作用的關(guān)系;對(duì)高通量篩選模型的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)以及新的藥物作用靶點(diǎn)的研究和發(fā)現(xiàn)等。隨著醫(yī)藥學(xué)的進(jìn)步,高通量篩選技術(shù)在創(chuàng)新藥物的研發(fā)中,一定會(huì)開(kāi)拓出更廣闊的空間。我國(guó)進(jìn)行藥物高通量篩選的優(yōu)勢(shì)首先是化合物來(lái)源,且多為天然;其次是對(duì)化合物生物活性的篩選目的較明確,無(wú)目的合成的化合物較少;第三,我國(guó)傳統(tǒng)藥物為篩選研究提供了一個(gè)巨大的資源庫(kù),可從中藥中提取分離篩選新的化合物。這些優(yōu)勢(shì)為藥物的高通量篩選打下了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。北京高通量篩選技術(shù)命中率高通量篩選技術(shù)的靶點(diǎn)是。
時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)原理為具有長(zhǎng)壽命熒光(通常為100秒的毫秒至毫秒)的鑭系配合物用作FRET供體,熒光蛋白或有機(jī)熒光團(tuán)(例如,別藻藍(lán)素或Cy5)用作受體。普通熒光的半衰期為納秒級(jí),鑭系元素的半衰期為毫秒級(jí),有6個(gè)數(shù)量級(jí)的差別。所以在檢測(cè)時(shí),TR-FRET有一個(gè)時(shí)間延遲~100微秒,從而使反應(yīng)體系內(nèi)普通背景熒光信號(hào)消耗掉,因此TR-FRET的背景信號(hào)非常低,能夠反映樣品實(shí)際情況?;诩?xì)胞水平的篩選的關(guān)鍵特征之一是可以一次篩選多個(gè)靶標(biāo)?;诩?xì)胞的篩選常用于以下情況下:1)所需的分子靶標(biāo)未知,2)靶標(biāo)無(wú)法在生化測(cè)定中充分重組,3)所需的表型只存在于細(xì)胞環(huán)境中,例如從一種細(xì)胞類(lèi)型分化到另一種細(xì)胞類(lèi)型?;诩?xì)胞的檢測(cè)貫穿于藥物發(fā)現(xiàn)的所有階段:靶標(biāo)選擇和驗(yàn)證、初步篩選、先導(dǎo)化合物識(shí)別、先導(dǎo)化合物優(yōu)化以及安全和毒理學(xué)篩選。介紹一些細(xì)胞水平分析的方法:細(xì)胞活力、報(bào)告基因、第二信使和高內(nèi)涵成像等。
然而傳統(tǒng)的針對(duì)單一靶點(diǎn)的研究方法已經(jīng)難以適應(yīng)一些多基因疾病和病毒等相關(guān)藥物的研究。而基于細(xì)胞水平的高內(nèi)涵篩選(high content screening, HCS)技術(shù)實(shí)現(xiàn)了對(duì)化合物多靶點(diǎn)多參數(shù)的同時(shí)檢測(cè),從疾病相關(guān)基因調(diào)控通路和網(wǎng)絡(luò)水平上研究藥物的作用機(jī)制、代謝途徑和潛在毒性等,也使在細(xì)胞水平評(píng)價(jià)活性化合物的成成為可能。從篩選載體上看,HCS和HTS并沒(méi)有的區(qū)別,它的檢測(cè)體積并未因檢測(cè)指標(biāo)增加而增高,操作步驟同樣簡(jiǎn)單可行、可自動(dòng)化。故HCS在新藥研發(fā)中發(fā)揮越來(lái)越重要的作用。細(xì)胞高通量篩選技術(shù)。
高通量篩選的特色效用高通量篩選技術(shù)是將多種技術(shù)方法有機(jī)結(jié)合而形成的一種新技術(shù)體系,它以微板形式作為實(shí)驗(yàn)工具載體,以自動(dòng)化操作系統(tǒng)執(zhí)行實(shí)驗(yàn)過(guò)程,以靈敏快速的檢測(cè)儀器采集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),以計(jì)算機(jī)對(duì)數(shù)以千計(jì)的樣品數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理,從而得出科學(xué)準(zhǔn)確的實(shí)驗(yàn)結(jié)果和特色效用。英國(guó)學(xué)者AlanD研究提示,一個(gè)實(shí)驗(yàn)室采用傳統(tǒng)的方法,借助20余種藥物作用靶位,1年內(nèi)能篩選75000個(gè)樣品;1997年高通量篩選技術(shù)發(fā)展初期,采用100余種靶位,每年可篩選100萬(wàn)個(gè)樣品;1999年高通量篩選技術(shù)進(jìn)一步完善后,每天的篩選量就高達(dá)10萬(wàn)種化合物。近年來(lái),光學(xué)測(cè)定技術(shù)在美、英兩國(guó)研究人員在高通量篩選檢測(cè)中,努力進(jìn)行了光學(xué)測(cè)定方法的研究,建立了大量的非同位素標(biāo)記測(cè)定法,如用分光光度檢測(cè)法篩選蛋白酪氨酸激酶抑制劑、組織纖溶酶原劑等,均獲得成功。高通量篩選方法有哪些。寧夏高通量篩選小分子庫(kù)
組合化學(xué)高通量篩選。寧夏高通量篩選小分子庫(kù)
正如之前提到,在高通量篩選中Assay的檢出方法有很多,用于衡量酶活性多的當(dāng)屬于熒光檢出法和吸光度檢出法。這兩種方法都能非常便捷的與高通量進(jìn)行匹配。但是這兩種檢出方法也有不適用的場(chǎng)景,比如吸光度檢出法,在終點(diǎn)法測(cè)定(endpointassay)時(shí),如果化合物庫(kù)的吸收低于~410nm,實(shí)驗(yàn)的背景吸收會(huì)引入假陽(yáng)性(false-positive)和假陰性(false-negative)結(jié)果。雖然假陽(yáng)性結(jié)果可以通過(guò)動(dòng)力學(xué)Assay或者驗(yàn)證Assay來(lái)解決,但是由于微量定量板有位于340~410nm的強(qiáng)吸收,所以仍舊會(huì)導(dǎo)致Z因子降低,直接結(jié)果就是較弱活性的苗頭化合物將很難被篩選出來(lái)。而對(duì)于熒光檢出法而言,自發(fā)熒光化合物庫(kù)或者具有光敏特性的化合物庫(kù)同樣會(huì)遇到假陽(yáng)性和假陰性結(jié)果。在某種程度上,選擇合適的檢出方法可以減少甚至避免上述問(wèn)題,比如使用更長(zhǎng)波段的光源,對(duì)于熒光檢出來(lái)說(shuō),>500nm會(huì)是比較好的選擇。寧夏高通量篩選小分子庫(kù)