江蘇蛋白組學(xué) tmt

通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法，發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻?；诟闻K**發(fā)生中發(fā)揮重要作用，揭示了NMT1的N-豆蔻?；种瓶?*發(fā)生的NDP，并通過(guò)干擾泛素化來(lái)刺激促**發(fā)生的NUP機(jī)制。為靶向N-豆蔻?；蚇MT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題：NMT1依賴于POTEE發(fā)生N-豆蔻?；⑼ㄟ^(guò)差異調(diào)節(jié)靶標(biāo)的泛素化來(lái)刺激肝臟**的發(fā)生研究對(duì)象：細(xì)胞、小鼠、人**組織發(fā)表期刊：FrontiersinOncology影響因子：6.244發(fā)表時(shí)間：2021年5月合作單位：上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心運(yùn)用生物技術(shù)：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、PRM靶向驗(yàn)證、質(zhì)譜鑒定、qRT-PCR、IHC、WB、IP文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù) 。江蘇蛋白組學(xué) tmt

采用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)三個(gè)脫水特殊階段（21、27和40DAP）的新鮮蓮種胎進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析，共鑒定了5,477個(gè)蛋白質(zhì)。對(duì)測(cè)試樣本進(jìn)行了PCA分析，結(jié)果顯示，不同組間樣品具有很好的區(qū)分，每組的三個(gè)重復(fù)樣本被聚集在一起。PCA的前兩個(gè)成分占總方差的70％以上（圖2A）。三個(gè)試驗(yàn)組之間共有815個(gè)差異表達(dá)蛋白。其中，198個(gè)（32%）和198個(gè)（26%）蛋白質(zhì)豐度增加，而420個(gè)（68%）和558個(gè)（74%）蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降（圖2B）。只有30個(gè)蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化（圖2C）。江西液相色譜質(zhì)譜分析蛋白組學(xué)TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué) 差異表達(dá)蛋白質(zhì)組分析研究。

蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質(zhì)（ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK）。此外，AC顯示出抑制脂肪生成酶（ACC，F(xiàn)ASN和SCD1）表達(dá)的趨勢(shì)，同時(shí)***上調(diào)了GLUT2。與對(duì)照組相比，AC***增加了PEPCK的表達(dá)，兩種化學(xué)物質(zhì)對(duì)G6Pase均無(wú)***影響（圖4A）。PRM蛋白靶向驗(yàn)證測(cè)定結(jié)果與蛋白質(zhì)組變化相一致，這進(jìn)一步證實(shí)了蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)中蛋白質(zhì)的表達(dá)（圖4B）。轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析結(jié)果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示，處理組的氧化磷酸化（OXPHOS）通路***上調(diào)，AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。

蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要執(zhí)行者，而蛋白質(zhì)磷酸化修飾是生物體內(nèi)**重要的共價(jià)修飾方式之一，真核生物體內(nèi)有超過(guò)三分之一的蛋白可以發(fā)生磷酸化修飾。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過(guò)程調(diào)節(jié)著包括細(xì)胞增殖、發(fā)育、分化、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)活動(dòng)、肌肉收縮及**發(fā)生等過(guò)程在內(nèi)的所有生命活動(dòng)。單一的磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)只能解釋蛋白磷酸化水平發(fā)生的變化，而[黃金搭檔]——蛋白質(zhì)組與磷酸化蛋白質(zhì)組聯(lián)合分析，則在揭示疾病相關(guān)特性、篩選疾病生物標(biāo)志物、尋找藥物靶點(diǎn)等方面發(fā)揮了更加重要的作用。4D-蛋白組+代謝組雙平臺(tái)知識(shí)干貨帶您。

TMTpro-16plex等標(biāo)記試劑已經(jīng)發(fā)布一年，廣受科研工作者喜愛(ài)。但是，對(duì)于6組3重復(fù)、3組6重復(fù)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)，16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組會(huì)是更好的選擇方式。其中基于質(zhì)譜儀平臺(tái)的蛋白組學(xué)近年來(lái)備受青睞，穩(wěn)定同位素標(biāo)記策略也被廣泛應(yīng)用于多重定量蛋白質(zhì)組學(xué)中。鹿明生物推出Thermo Scientific? TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組，18個(gè)樣本以內(nèi)，可實(shí)現(xiàn)一次標(biāo)記和分級(jí)，避免了多批次標(biāo)記引入的批次效應(yīng)，能***提升樣本的數(shù)據(jù)質(zhì)量。同時(shí)對(duì)更多蛋白質(zhì)鑒定和定量，提供了樣本的多通路處理水平。這個(gè)技術(shù)可謂是2021年的又一創(chuàng)新技術(shù)。蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析。山東轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白組學(xué)

蛋白質(zhì)組學(xué),Label Free/iTRAQ/dia/MRM/PRM。江蘇蛋白組學(xué) tmt

隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展，特別是離子淌度的引入，增加了一個(gè)新的分離維度，將蛋白質(zhì)組研究推進(jìn)到全新的“4D蛋白質(zhì)組”層面，打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的瓶頸，大幅度的提高掃描速度和檢測(cè)靈敏度，帶來(lái)蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測(cè)周期、定量準(zhǔn)確性等性能的***提升，可以更好的解決大隊(duì)列、復(fù)雜體系以及微量樣本的檢測(cè)。相比于timsTOF Pro，timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器，離子容量可提高三倍。經(jīng)過(guò)簡(jiǎn)化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度，為4D-多組學(xué)建立了新的標(biāo)準(zhǔn)。CCS 值的加入讓組學(xué)結(jié)果更精細(xì)，也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠?qū)崿F(xiàn)少量細(xì)胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析，在短梯度下實(shí)現(xiàn)蛋白深度覆蓋。江蘇蛋白組學(xué) tmt

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