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通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)分析檢測(cè)了經(jīng)M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs,在0、24和48小時(shí)各種基因的表達(dá)增加(圖2A)。此外,熱圖分析揭示了不同表達(dá)的功能基因,包括與炎癥、細(xì)胞增殖、免疫調(diào)節(jié)和血管生成相關(guān)的因素(圖2B-E)。時(shí)序分析表明,HBMECs中標(biāo)記基因的上調(diào)與炎癥因子IL3RA有關(guān),增殖相關(guān)蛋白CD40和免疫調(diào)節(jié)因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進(jìn)人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的血管生成能力,因此初步驗(yàn)證了M-Exos***后血管生成相關(guān)基因的表達(dá)。蛋白質(zhì)印跡結(jié)果顯示血管生成相關(guān)基因FlK1和ANGPT1的表達(dá)明顯增強(qiáng)(圖2I)。綜上所述,結(jié)果證實(shí)了M-Exos誘導(dǎo)了人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的功能改變。一站式服務(wù),蛋白組學(xué)研究不同生物體在不同時(shí)刻/狀態(tài)下蛋白質(zhì)表達(dá)的變化。北京蛋白組學(xué)檢測(cè)技術(shù)
采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析,研究了AC和AL對(duì)db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中,2837個(gè)(約16.9%)在正常組和對(duì)照組之間有***差異,表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對(duì)照組相比,共有3749個(gè)基因因攝入AC而發(fā)生***改變(2201個(gè)下調(diào),1548個(gè)上調(diào)),560個(gè)基因(430個(gè)下調(diào),130個(gè)上調(diào))因攝入AL而發(fā)生***改變(圖3B)。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對(duì)照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(gè)(約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%)DEPs,AC處理有230個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(109個(gè)上調(diào),121個(gè)下調(diào)),AL處理有211個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(116個(gè)上調(diào),95個(gè)下調(diào))。北京外泌體蛋白組學(xué)檢測(cè)單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué),極微量樣本檢測(cè)。
并通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)和時(shí)間序列分析在血管生成中發(fā)揮著關(guān)鍵作用(圖3E)。時(shí)間序列分析表明,外出刺激后ICAM1表達(dá)增加(圖3F)。此外,當(dāng)ICAM1在HBMECs中時(shí),血管形成容量***降低(圖3I/j)。這些結(jié)果表明M-Exos通過(guò)增加HBMECs中的ICAM1的表達(dá)來(lái)調(diào)節(jié)血管生成。蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)的差異表達(dá)蛋白與多種神經(jīng)退行性疾病相關(guān),包括帕金森病、阿爾茨海默病和亨廷頓病(圖6B)。本研究運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué),蛋白質(zhì)印跡,免疫熒光、免疫組化等分析了源自MSCs的外泌體可以使人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞(HBMECs)保持活躍狀態(tài),有利于血管生成。應(yīng)用PD小鼠模型發(fā)現(xiàn)MSCs的外泌體可以促進(jìn)PD的恢復(fù)。結(jié)果可以為MSCs衍生的外泌體在PD***方面提供可能性。
定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究:2022年2月,上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《FrontiersinMicrobiology》期刊發(fā)表的題為“OxidativeStressandAutophagyAreImportantProcessesinPostRipenessandBrownFilmFormationinMyceliumofLentinulaedodes”的研究成果,通過(guò)iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)等技術(shù)對(duì)香菇菌絲進(jìn)行定量蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)氧化應(yīng)激和自噬是香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色重要過(guò)程,并對(duì)其在蛋白質(zhì)組和代謝組水平上的分子機(jī)制有了新的認(rèn)識(shí)。涉及的歐易/鹿明生物服務(wù)產(chǎn)品:iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)基本策略 研究基礎(chǔ) 研究?jī)?nèi)容 研究意義背景。
作者通過(guò)泛素化蛋白組學(xué)分析鑒定了茶樹(shù)作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標(biāo)題:氮調(diào)節(jié)茶樹(shù)根中茶氨酸和黃酮類(lèi)化合物的生物合成:多組學(xué)分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對(duì)象:茶樹(shù)根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時(shí)間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):TMT蛋白質(zhì)組學(xué)、泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)(其中部分?jǐn)?shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹(shù)根部的茶氨酸和黃酮類(lèi)代謝,通過(guò)蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機(jī)制。本文的多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。研究機(jī)構(gòu),提供蛋白組學(xué)聯(lián)合分析,技術(shù)咨詢(xún)服務(wù)。遼寧itraq定量蛋白組學(xué)技術(shù)
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iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法:2021年4月,南京林業(yè)大學(xué)喻方圓教授(一作:吳岐奎)課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)+iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法,分析東京野茉莉種子發(fā)育過(guò)程中脂肪酸生物合成相關(guān)基因的表達(dá)趨勢(shì),確定油脂積累的主要影響因子并構(gòu)建其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為野茉莉?qū)僦参锓N子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎(chǔ)。北京蛋白組學(xué)檢測(cè)技術(shù)
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