2022年2月，亞特蘭大埃默里大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Erik C. B. Johnson課題組在Nature neuroscience發(fā)表了題為 “Large-scale deep multi-layer analysis of Alzheimer’s disease brain reveals strong proteomic disease-related changes not observed at the RNA level”的研究成果，通過(guò)基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)的研究方法，揭示了新的與AD相關(guān)的蛋白共表達(dá)模塊，部分模塊在RNA的網(wǎng)絡(luò)中不存在。這為開(kāi)發(fā)疾病***的潛在靶點(diǎn)提供依據(jù)，為臨床的蛋白質(zhì)組研究提供重要價(jià)值。蛋白質(zhì)組學(xué),修飾蛋白質(zhì)組,蛋白·修飾·代謝。遼寧itraq定量蛋白組學(xué)技術(shù)
蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法研究案例：2021年10月，中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所武愛(ài)波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果，通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法，探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇（DON）對(duì)成肌細(xì)胞分化的影響，發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細(xì)胞骨架蛋白和細(xì)胞外基質(zhì)蛋白表達(dá)下調(diào)，并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路的機(jī)理，為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。山東蛋白組學(xué)雜志4D-蛋白組+代謝組雙平臺(tái)知識(shí)干貨帶您。
4D蛋白組學(xué)：tims TOF Pro2依賴(lài)于雙捕集離子淌度（TIMS）和同步累積連續(xù)碎裂（PASEF）數(shù)據(jù)采集模式兩大創(chuàng)新技術(shù)，可實(shí)現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性。同時(shí)，其配備了***一代雙 TIMS 分析器，離子容量可提高三倍，比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度，讓蛋白質(zhì)組學(xué)分析再上一個(gè)新的臺(tái)階，鹿明生物同時(shí)配備了Evosep One高通量色譜使其在短梯度下也能實(shí)現(xiàn)蛋白深度覆蓋，結(jié)果更精細(xì)，也成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。更高掃描速度：助力臨床大隊(duì)列項(xiàng)目研究，更高覆蓋深度：助力蛋白組鑒定到更多的蛋白數(shù)量，超高靈敏度：助力微量樣本蛋白組分析，鑒定更可信：助力蛋白或化合物更高可信度的鑒定。
使用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析，與GFP-群體相比，在GFP+細(xì)胞中TM處理后，線(xiàn)粒體復(fù)合物IV的多個(gè)亞基被特異性下調(diào)，對(duì)下調(diào)的蛋白質(zhì)進(jìn)行基因本體 (GO)分析，顯示參與線(xiàn)粒體電子傳遞鏈 (ETC) 的通路富集。同時(shí)作者還分析了從人 LM2 細(xì)胞系中分選的 LM2 GFP+和 GFP- 細(xì)胞，在 TM 處理 48 小時(shí)后蛋白組學(xué)分析，揭示了GFP+細(xì)胞優(yōu)先富集，同時(shí)揭示了線(xiàn)粒體 ETC 相關(guān)的通路。因此，TM 處理特別影響具有更高細(xì)胞內(nèi)銅水平的 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞中的線(xiàn)粒體 ETC 通路。蛋白質(zhì)組學(xué)分析確定了富含線(xiàn)粒體功能的途徑。細(xì)胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一種線(xiàn)粒體金屬酶，是線(xiàn)粒體ETC的終末酶。蛋白組學(xué)方案為組學(xué)研究涉及的樣本獲取,前處理,數(shù)據(jù)采集到分析的各個(gè)環(huán)節(jié)提供自動(dòng)化。
通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法，發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻?；诟闻K**發(fā)生中發(fā)揮重要作用，揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**發(fā)生的NDP，并通過(guò)干擾泛素化來(lái)刺激促**發(fā)生的NUP機(jī)制。為靶向N-豆蔻酰化和NMT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題：NMT1依賴(lài)于POTEE發(fā)生N-豆蔻?；⑼ㄟ^(guò)差異調(diào)節(jié)靶標(biāo)的泛素化來(lái)刺激肝臟**的發(fā)生研究對(duì)象：細(xì)胞、小鼠、人**組織發(fā)表期刊：FrontiersinOncology影響因子：6.244發(fā)表時(shí)間：2021年5月合作單位：上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心運(yùn)用生物技術(shù)：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、PRM靶向驗(yàn)證、質(zhì)譜鑒定、qRT-PCR、IHC、WB、IP文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)序 蛋白組學(xué)技術(shù)缺點(diǎn)。山東蛋白組學(xué)雜志
蛋白組學(xué)檢測(cè)一個(gè)樣多少錢(qián)。遼寧itraq定量蛋白組學(xué)技術(shù)
在本研究中，利用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)方法對(duì)東京野茉莉種子發(fā)育的4個(gè)時(shí)間點(diǎn)采樣進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析。獲得了2338個(gè)蛋白和1473個(gè)DEPs。Mfuzz聚類(lèi)分析顯示，在種子發(fā)育過(guò)程中，轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)組之間存在相當(dāng)大的時(shí)序一致性。在四個(gè)發(fā)育時(shí)期中，花后70天（種子發(fā)育活躍期）是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關(guān)鍵時(shí)期：在該階段與脂肪酸生物合成相關(guān)的功能基因和酶蛋白均達(dá)到表達(dá)峰值，同時(shí)種仁內(nèi)部大部分營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)開(kāi)始迅速積累。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個(gè)酶體系處于中心位置，在脂肪酸的合成過(guò)程中具有主導(dǎo)作用。遼寧itraq定量蛋白組學(xué)技術(shù)
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