上海定量蛋白組學(xué)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-09-20

通過(guò)磷酸化蛋白質(zhì)組定量鑒定了1244個(gè)磷酸化蛋白質(zhì),其中474個(gè)(38%)在**組織中***增加,183個(gè)(15%)***下降。三種蛋白亞型中磷酸化蛋白組學(xué)的比較結(jié)果揭示了亞型特異性的活性激酶。進(jìn)一步對(duì)差異改變的磷酸化位點(diǎn)的研究顯示,在S-I中觀察到參與黏附的底物升高和參與RNA轉(zhuǎn)運(yùn)的底物減少。而基于timsTOF Pro離子淌度4D蛋白質(zhì)組技術(shù),是對(duì)蛋白組學(xué)+磷酸化組學(xué)的雙重升級(jí),可實(shí)現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性,**臨床蛋白質(zhì)組學(xué)在定性數(shù)量更多、定量更準(zhǔn)確、位點(diǎn)鑒定更精確、樣本需求量更低、檢測(cè)周期更短等性能上***提升,從蛋白質(zhì)表達(dá)和修飾雙重角度更好地發(fā)揮發(fā)掘分子調(diào)控機(jī)制、發(fā)現(xiàn)疾病分子分型以及發(fā)掘生物標(biāo)志物等多重作用。蛋白組學(xué)技術(shù)對(duì)腎錯(cuò)構(gòu)瘤尿液差異蛋白的研究。上海定量蛋白組學(xué)

iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)研究實(shí)用案例:2021年8月,浙江大學(xué)藥學(xué)院何俏軍、羅沛華團(tuán)隊(duì)在Autophagy期刊發(fā)表了題為“Autophagic degradation of CCN2 (cellular communication network factor 2) causes cardiotoxicity of sunitinib”的研究成果,通過(guò)動(dòng)物模型、功能實(shí)驗(yàn)、iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)了舒尼替尼誘導(dǎo)的自噬導(dǎo)致心肌細(xì)胞凋亡和心臟功能障礙,探究了舒尼替尼誘導(dǎo)的適應(yīng)不良自噬通過(guò)TOLLIP介導(dǎo)的內(nèi)體相關(guān)通路選擇性降解心肌細(xì)胞存活介質(zhì)CCN2的機(jī)理,揭示了調(diào)節(jié)心肌細(xì)胞死亡的自噬降解新靶標(biāo)蛋白。為提高基于舒尼替尼的*****安全性提供了方法及理論依據(jù)。中文標(biāo)題:CCN2的自噬降解導(dǎo)致舒尼替尼的心臟毒性研究對(duì)象:小鼠發(fā)表期刊:Autophagy影響因子:16.016發(fā)表時(shí)間:2021年8月合作單位:浙江大學(xué)藥學(xué)院運(yùn)用生物技術(shù):iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)天津蛋白組學(xué) 微生物蛋白組學(xué),研究方法,高通量定性定量研究,有。

3篇經(jīng)典的蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)在水產(chǎn)動(dòng)物中的研究。水產(chǎn)動(dòng)物的研究不僅是保障我國(guó)海水養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展,同時(shí)可為良種創(chuàng)制、海洋環(huán)境研究、生態(tài)研究等提供重要理論基礎(chǔ)和技術(shù)支撐~因此在水產(chǎn)生物研究方面蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)在其中起到什么作用呢?期望這3篇經(jīng)典文章能給您思路~中文標(biāo)題:CO2誘導(dǎo)的海洋酸化損害了太平洋牡蠣對(duì)金氏弧菌的免疫功能:細(xì)胞和蛋白質(zhì)組學(xué)的綜合研究研究對(duì)象:牡蠣發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:6.551合作單位:中國(guó)科學(xué)院海岸帶研究所運(yùn)用歐易/鹿明生物技術(shù):iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)

在本研究中,利用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)方法對(duì)東京野茉莉種子發(fā)育的4個(gè)時(shí)間點(diǎn)采樣進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析。獲得了2338個(gè)蛋白和1473個(gè)DEPs。Mfuzz聚類(lèi)分析顯示,在種子發(fā)育過(guò)程中,轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)組之間存在相當(dāng)大的時(shí)序一致性。在四個(gè)發(fā)育時(shí)期中,花后70天(種子發(fā)育活躍期)是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關(guān)鍵時(shí)期:在該階段與脂肪酸生物合成相關(guān)的功能基因和酶蛋白均達(dá)到表達(dá)峰值,同時(shí)種仁內(nèi)部大部分營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)開(kāi)始迅速積累。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個(gè)酶體系處于中心位置,在脂肪酸的合成過(guò)程中具有主導(dǎo)作用。歐易生物鹿明生物蛋白組學(xué)聯(lián)合分析。

本文為中國(guó)科學(xué)院海岸帶研究所趙建民課題組在ScienceoftheTotalEnvironment期刊發(fā)表了的文章,通過(guò)iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究弧菌***加劇了海洋酸化造成的牡蠣免疫抑制效應(yīng)。海洋酸化可能增加海洋軟體動(dòng)物疾病加劇的風(fēng)險(xiǎn)。從而將產(chǎn)生重大的經(jīng)濟(jì)和生態(tài)影響,因此本研究結(jié)果具有重要的指導(dǎo)意義。在本研究中,研究者將太平洋牡蠣暴露于酸化海水(約2000ppm)中28天,然后用金氏弧菌進(jìn)行***處理,以此研究海洋酸化是否會(huì)影響牡蠣對(duì)病原菌***的免疫反應(yīng)。此外,利用基于iTRAQ的定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法,對(duì)牡蠣鰓這一潛在的造血部位進(jìn)行了研究,以分析對(duì)OA和金氏弧菌共同作用較敏感的生理過(guò)程。蛋白質(zhì)組學(xué)基本策略 研究基礎(chǔ) 研究?jī)?nèi)容 研究意義背景。天津蛋白組學(xué)測(cè)試價(jià)格

單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)。上海定量蛋白組學(xué)

采用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)三個(gè)脫水特殊階段(21、27和40DAP)的新鮮蓮種胎進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定了5,477個(gè)蛋白質(zhì)。對(duì)測(cè)試樣本進(jìn)行了PCA分析,結(jié)果顯示,不同組間樣品具有很好的區(qū)分,每組的三個(gè)重復(fù)樣本被聚集在一起。PCA的前兩個(gè)成分占總方差的70%以上(圖2A)。三個(gè)試驗(yàn)組之間共有815個(gè)差異表達(dá)蛋白。其中,198個(gè)(32%)和198個(gè)(26%)蛋白質(zhì)豐度增加,而420個(gè)(68%)和558個(gè)(74%)蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降(圖2B)。只有30個(gè)蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化(圖2C)。上海定量蛋白組學(xué)

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