烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據，深入解讀數據分析結果，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！此外，烈冰生信團隊根據豐富的實戰(zhàn)經驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不僅可以將海量復雜的結果文件可視化，還可以實現分析結果的三維立體化的展示呈現。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您！單一的轉錄本研究不能體現生命進程的變化，因此多組學聯合分析成為解析生命進程的有力工具。北京scRNA單細胞多組學技術支持
機體為響應各種應激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當細胞在不同狀態(tài)之間轉變時，往往會經歷轉錄重組，導致一些基因被“沉默”，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況，構建細胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細胞與細胞之間的轉化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉化和變化進行描述。廣州single cell RNA單細胞多組學測序服務單細胞測序技術遍地開花，烈冰服務讓您的生物醫(yī)學研究如虎添翼。
基于橋式PCR技術的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍，保證過程中足夠的測序深度。測序時使用特殊標記的dNTP：1）堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團，用于區(qū)分ATCG；2）3端使用疊氮基團封閉，保證一次循環(huán)只上一個dNTP。每一輪循環(huán)結束時，會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像，再通入試劑除去熒光基團和疊氮基團，開啟下一循環(huán)。通過分析讀取同一位點的熒光，實時獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學反應并不可控，隨著循環(huán)數的增大會出現不同步的情況，因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右。
當下，單細胞測序已經廣泛應用于多種疾病發(fā)展過程中的關鍵過程和事件，如疾病從輕癥病變向惡性的轉化、惡性向轉移病變的發(fā)展，以及疾病對多種藥物的反應等等。單細胞測序技術作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液，或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核，進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結果的技術，其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉化么？免疫研究中，兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關系的細胞在組織切片上風馬牛不相及，這樣PDL1-PD1的關系會生效么？為了能深入分析和理解細胞狀態(tài)和命運決定的機制, 將單細胞各組學技術結合在一起的單細胞多組學技術產生。
烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿、整合添加多項國際期刊認可的空轉分析工具，構建一套完整的數據分析流程；精心研發(fā)空轉結果瀏覽器，可同步展示空間轉錄組與單細胞測序分析結果，詳細深入地解析空間轉錄組數據。完成從Rawdata（原始數據）到Spot-Gene的具有定位信息的表達矩陣的過程后，就進入了空轉的第二步，去進行Spot的Cluster的過程，熟悉單細胞測序的研究者知道，Cluster在單細胞測序中往往表示為細胞的類型，也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細胞是一個Celltype（當然分情況也會有不同）。而在空轉中，也正是由于前面提到了細胞的非單一性，導致了這里的分群并不是單純的同一細胞類型，而應該認為是具有相同細胞組成的點陣區(qū)域，或者說是近似的組織結構區(qū)域。烈冰生物為您提供一站式全流程單細胞測序服務。廈門上海烈冰生物單細胞多組學數據分析可視化
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空間轉錄組測序與單細胞測序的結果不同，這里存在一個概念叫做NumberofSpotsundertissue，即，空間轉錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點。這個有效Spot的篩選標準是有UMI以及有序列表達。那么這個時候，貼片的質量就成為了制約空間轉錄組有效區(qū)域的要點了。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉片上，那么容易出現雖然有HE染色有組織片子，但是沒有基因表達，即無有效Spot位點。同樣的，另一個就是組織切片的大小，也就是說組織切片在整個玻片的覆蓋面積越小，分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個空間轉錄組分析結果的基礎質量。北京scRNA單細胞多組學技術支持
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