單細(xì)胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求，首先針對下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié)：單細(xì)胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列，不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果，存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征，即堿基測序結(jié)果的錯誤率在1%/0.1%以下的比例。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后第一步的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性，為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定準(zhǔn)確和功能分析打下堅實基礎(chǔ)。烈冰測序數(shù)據(jù)分析平臺，不依賴已有物種信息，可研究非模式物種，針對不同平臺的數(shù)據(jù)，制定多套流程。濟(jì)南scRNA單細(xì)胞多組學(xué)平臺
烈冰與國內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作，服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu)，1000+客戶和5000+重要科研項目，助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學(xué)術(shù)期刊（不完全統(tǒng)計），在單細(xì)胞領(lǐng)域，烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇，總IF＞300+，IF＞10+以上文章占比65%以上，包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國際主流學(xué)術(shù)期刊，已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制，免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。武漢BD單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)分析可視化單一的轉(zhuǎn)錄本研究不能體現(xiàn)生命進(jìn)程的變化，因此多組學(xué)聯(lián)合分析成為解析生命進(jìn)程的有力工具。
分子檢測型單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)中也有一些集中于探究單細(xì)胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關(guān)聯(lián)。功能研究型單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù),結(jié)合了強(qiáng)大的CRISPR基因編輯技術(shù),從而可以深度挖掘基因表達(dá)調(diào)控與細(xì)胞功能以及命運(yùn)決定之間的因果關(guān)系。在未來,為了更系統(tǒng)地研究多層組學(xué)之間的互動關(guān)系對細(xì)胞命運(yùn)的影響,一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)的策略會繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結(jié)合其他多個組學(xué)的三組學(xué)甚至四組學(xué)方向發(fā)展.另一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)會轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測序分析和功能驗證同時進(jìn)行的方法,這種探究因果關(guān)系的策略對于揭示發(fā)育和疾病發(fā)展中的關(guān)鍵因子和分子網(wǎng)絡(luò)模塊十分重要。
FluidigmC1平臺基于富魯達(dá)（Fluidigm®）的微流控技術(shù)應(yīng)用于單細(xì)胞測序（SingleCellRNASequencing）領(lǐng)域的商業(yè)化中，該技術(shù)大約在幾個小時中可以捕獲96個左右的細(xì)胞，進(jìn)行各類的Single-Cell測序建庫。當(dāng)然，通量還是比較小。但不可否認(rèn)的是，現(xiàn)在很多非RNA類SingleCell測序，仍然在采用這樣的技術(shù)，如SingleCellDNA-Seq，SingleCellATAC-Seq等，都是采用此技術(shù)進(jìn)行單細(xì)胞分選后再分別用不同試劑盒建庫。所以可以說，至少在10XGenomics、BD或者其他企業(yè)推出有效的SingleDNA測序技術(shù)之前，C1仍然會是市場上的重要組成部分。隨著單細(xì)胞多組學(xué)的不斷進(jìn)步, 研究者將有機(jī)會在單細(xì)胞分辨率下進(jìn)一步理解個體發(fā)育以及疾病發(fā)展機(jī)制。
BD的技術(shù)不再采用利用微流控孔道射出細(xì)胞和射出的磁珠碰撞的過程，進(jìn)行單細(xì)胞捕獲的技術(shù)，轉(zhuǎn)而采用CytoSeq特有的蜂窩板技術(shù)。該技術(shù)用20萬+的微孔（該數(shù)量級遠(yuǎn)大于Input細(xì)胞數(shù)量），保證單孔中的單細(xì)胞捕獲。同時避免了10X中存在的概率碰撞影響捕獲效率的問題，采用微孔捕獲相對會有更好的捕獲效率（來自兩家企業(yè)商業(yè)宣傳資料比對），保證Input細(xì)胞的高效使用。對于Input細(xì)胞的量更少的情況，可以基于百萬級別的細(xì)胞總量開始進(jìn)行前期處理以及后期捕獲操作。而在細(xì)胞捕獲完成后，進(jìn)行細(xì)胞裂解后，同樣的也進(jìn)行細(xì)胞中RNApolyA序列的抓取工作。單細(xì)胞多組學(xué)突破了以往單細(xì)胞檢測的單一性,可更多樣化。濟(jì)南烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)分析可視化
單細(xì)胞測序手段有力地解決了組織內(nèi)高度異質(zhì)性對于低豐度信號影響的問題。濟(jì)南scRNA單細(xì)胞多組學(xué)平臺
高通量測序技術(shù)（High-throughputsequencing）又稱“下一代”測序技術(shù)（“Next-generation”sequencing），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定和一般讀長較短等為標(biāo)志。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定，因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變，同時高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗，已助力Nature，immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。濟(jì)南scRNA單細(xì)胞多組學(xué)平臺
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