上海small RNA高通量測序技術(shù)

來源: 發(fā)布時間:2022-08-22

簡化基因組測序,項目介紹:通過限制性內(nèi)切酶對基因組DNA進(jìn)行酶切,并對酶切片段進(jìn)行高通量測序,這種通過酶切降低基因組的復(fù)雜度的測序技術(shù)統(tǒng)稱為簡化基因 組測序技術(shù)。利用生物信息學(xué)方法,進(jìn)行SNP單體型圖譜繪制,全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),連鎖分析和QTL定位分析,種群進(jìn)化,主成分分析等。比較有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因組測序,項目介紹:宏基因組指特定環(huán)境樣品內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和。直接提取環(huán)境樣品內(nèi)全部基因組DNA,隨后進(jìn)行大規(guī)模高通量測序(shotgun 策 略)。測到數(shù)據(jù)后,先進(jìn)行必要的數(shù)據(jù)質(zhì)控,而后進(jìn)行基因組拼接、注釋(物種、基因功能),使得我們可以獲取環(huán)境樣品內(nèi)菌群分布、系統(tǒng)進(jìn)化、功能代謝等信息。該方法已經(jīng)得到普遍的運用。請寄送樣本(尤其是細(xì)胞樣本)之前鑒定樣本所屬物種。上海small RNA高通量測序技術(shù)

生工其他PCR產(chǎn)物測序,項目介紹:隨著基因編輯技術(shù)(尤其是CRISPR-cas9技術(shù))的發(fā)展,科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測序無法快速有效鑒定基因編輯效率。但是,通過對靶基因區(qū)域附近設(shè)計引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行高通量測序,可以快速高效的獲得目標(biāo)區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對低頻突變的檢測效果遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于一代測序,性價比極高??侱NA 或者包裝完好的原始樣品(如土壤、糞便、 水體和口腔物);樣品名稱清晰,冷藏運輸。如有對照與實驗樣品的區(qū)分,標(biāo)明正常樣品與實驗樣品,如有分組,詳細(xì)描述分組分析信息,以及分組比較的分析需求信息。上海全質(zhì)粒測序高通量測序產(chǎn)品于微生物樣品,請客戶如實聲明所屬物種,對于可能致病的微生物,生工保留拒收的權(quán)利。

通過顯微鏡使用血球計數(shù)板質(zhì)檢能觀察到懸液背景質(zhì)量和細(xì)胞數(shù)目及活性的評估。讓我們再來回顧一下臺盼藍(lán)染色原理:臺盼藍(lán)染色原理:臺盼藍(lán)不能透過活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜,故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高,可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。怎樣通過血球計數(shù)板進(jìn)行質(zhì)檢操作呢?將血球計數(shù)板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計數(shù)板上;將細(xì)胞懸液混勻(或10μl臺盼藍(lán)+10μl細(xì)胞懸液),吸出10μl懸液至計數(shù)板上蓋玻片的一側(cè)使細(xì)胞核懸液鋪滿蓋玻片和計數(shù)板之間;在顯微鏡下分別對V1/V2/V3/V4四個計數(shù)區(qū)域進(jìn)行計數(shù);按細(xì)胞計數(shù)公式進(jìn)行計算,計算公式:細(xì)胞總數(shù)={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*懸液體積*稀釋倍數(shù),V1/V2/V3/V4為各個計數(shù)區(qū)的細(xì)胞數(shù)目,細(xì)胞活率=活細(xì)胞數(shù)目/總細(xì)胞數(shù)目*100%。

small RNA測序,項目簡介:Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,長度在18-30 nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導(dǎo)基因沉默,參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞生長、分化,以及個體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過程。高通量測序技術(shù)可以對樣本中所有small RNA家族進(jìn)行測序和表達(dá)定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應(yīng)靶序列。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后,進(jìn)行Clean reads 長度分布統(tǒng)計,small RNA注釋,已知 miRNA 注釋,已知piRNA注釋,ncRNA分析,新 miRNA 預(yù)測(有參考基因組),差異基因可視化分析,miRNA 家族分析,差異表達(dá) miRNA 聚類分析,miRNA靶基因預(yù)測,靶基因GO、KEGG富集分析。PacBio Sequel/RSII 該測序平臺讀長超長,平均可達(dá)10 kb以上。

生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗,日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細(xì)胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。生物信息分析經(jīng)驗豐富,可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報告模板為準(zhǔn)),全部free。生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目,一站式解決問題。同時生工生物單細(xì)胞團(tuán)隊目前已同時擁有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX雙平臺,可為您提供超高通量和低通量單細(xì)胞樣本雙重。一臺10xGenomics Chromium X儀器能夠在單次運行中分析數(shù)百至數(shù)十萬個細(xì)胞,讓百萬級的細(xì)胞研究變得常規(guī)。上海地區(qū)生工高通量測序應(yīng)用

請合理安排樣品寄送時間,避免樣本在周六、周日或法定節(jié)假日到達(dá)生工生物。上海small RNA高通量測序技術(shù)

對于用RNA組織保存液寄送的樣品,請按照RNA組織保存液說明保存和寄送。請注意:1)樣品浸入組織保存液之前,對于動物組織樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.5cm的碎塊;對于植物樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.3cm的碎塊。2)鼠肝、腎和脾等小organ樣品和沒有蠟質(zhì)保護(hù)層的植物樣品可不剪切直接放入保存液中保存,有蠟質(zhì)保護(hù)層的植物樣品需要先將蠟表皮破壞。3)確保將樣品完全浸泡在保存液中,不讓其粘貼在管壁和蓋上。上海small RNA高通量測序技術(shù)

生工生物工程(上海)股份有限公司位于香閔路698號。公司業(yè)務(wù)分為生化試劑,實驗耗材,實驗試劑,研發(fā)等,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司從事醫(yī)藥健康多年,有著創(chuàng)新的設(shè)計、強大的技術(shù),還有一批專業(yè)化的隊伍,確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務(wù)。生工生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實”的經(jīng)營理念,全力打造公司的重點競爭力。

標(biāo)簽: 高通量測序