上海地區(qū)基因組高通量測(cè)序產(chǎn)品

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-26

RNA類高通量測(cè)序樣品要求:對(duì)于需要進(jìn)行 RNA 抽提的樣品,請(qǐng)使用新鮮取樣的實(shí)驗(yàn)材料,當(dāng)場(chǎng)分成小塊(動(dòng)物樣品厚度需小于0.5 cm,植物樣品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗(yàn),在秋冬季節(jié),如果打包合適,5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時(shí),而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些)中用保溫箱寄送。一般組織樣品,送樣量至少200 mg/樣;如果樣品屬于孢子,送樣量至少500 mg/樣。高通量測(cè)序技術(shù)是可以平行對(duì)數(shù)百萬(wàn)甚至數(shù)十億條序列測(cè)序的技術(shù)。上海地區(qū)基因組高通量測(cè)序產(chǎn)品

生工高通量測(cè)序樣品要求,RNA樣品:請(qǐng)?zhí)峁舛取?50 ng/μl、總量≥2μg的總RNA樣品,樣品請(qǐng)去蛋白并進(jìn)行DNase處理;請(qǐng)務(wù)必提供每個(gè)樣品具體的濃度、體積、制備時(shí)間以及物種來(lái)源。比較好附上QC數(shù)據(jù),可以是電泳膠圖、分光光度值、Nanodrop儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)或者Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)等;一般情況下,轉(zhuǎn)錄組測(cè)序需要Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥7;小RNA測(cè)測(cè)序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒,可選擇傳統(tǒng)總RNA提取法(如乙醇沉淀、異丙醇沉淀等)或者選用專門(mén)的小RNA提取試劑盒;寄送RNA樣品請(qǐng)置于1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時(shí)間,管口使用Parafilm封口。在運(yùn)輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中,再將50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰運(yùn)輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運(yùn)輸過(guò)程中樣品降解的可能性。上海市全質(zhì)粒測(cè)序高通量測(cè)序高通量DNA樣品請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運(yùn)輸,不超過(guò)3天。

簡(jiǎn)化基因組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:通過(guò)限制性內(nèi)切酶對(duì)基因組DNA進(jìn)行酶切,并對(duì)酶切片段進(jìn)行高通量測(cè)序,這種通過(guò)酶切降低基因組的復(fù)雜度的測(cè)序技術(shù)統(tǒng)稱為簡(jiǎn)化基因 組測(cè)序技術(shù)。利用生物信息學(xué)方法,進(jìn)行SNP單體型圖譜繪制,全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),連鎖分析和QTL定位分析,種群進(jìn)化,主成分分析等。比較有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:宏基因組指特定環(huán)境樣品內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和。直接提取環(huán)境樣品內(nèi)全部基因組DNA,隨后進(jìn)行大規(guī)模高通量測(cè)序(shotgun 策 略)。測(cè)到數(shù)據(jù)后,先進(jìn)行必要的數(shù)據(jù)質(zhì)控,而后進(jìn)行基因組拼接、注釋(物種、基因功能),使得我們可以獲取環(huán)境樣品內(nèi)菌群分布、系統(tǒng)進(jìn)化、功能代謝等信息。該方法已經(jīng)得到普遍的運(yùn)用。

長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)測(cè)序(只限有參考基因組物種),項(xiàng)目介紹:長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一類轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度大于200 nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各種生物體內(nèi)。哺乳動(dòng)物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是LncRNA(相應(yīng)的蛋白編碼RNA比例是1%)。近年來(lái)研究表明,LncRNA參與了多種重要的調(diào)控過(guò)程,如X染色體沉默、基因組印記及染色質(zhì)修飾等。通過(guò)LncRNA測(cè)序,可以快速獲得與其生物學(xué)過(guò)程或者疾病相關(guān)的LncRNA的表達(dá)變化,從而促進(jìn)LncRNA的深入研究。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序指在單細(xì)胞水平上對(duì) mRNA 進(jìn)行高通量測(cè)序和分析的技術(shù)。

對(duì)于細(xì)胞樣品,送樣量需達(dá)到 5 × 106(5乘10的6次方)數(shù)量級(jí)。富集后置于 2 ml Ep管中,用 1 ml TRIzol 重懸,注意取樣后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰中用保溫箱寄送。強(qiáng)烈建議細(xì)胞樣品先做細(xì)胞鑒定及支原體/衣原體污染之后,再送出來(lái)。對(duì)于血液樣本,只接收未凍存過(guò)的抗凝血新鮮樣本??鼓齽┎豢墒褂酶嗡剽c,可用EDTA或ACD抗凝劑,取血后以冰袋保存,切記不能使血液凍結(jié),從取血之時(shí)開(kāi)始計(jì)算,須在48小時(shí)之內(nèi)送達(dá)生工上??偛扛咄繙y(cè)序部。如果不能提供新鮮樣本,則請(qǐng)?zhí)峁难褐刑崛〉目俁NA樣本。備樣要求詳見(jiàn)B、RNA 樣品?,F(xiàn)在也有學(xué)者為了區(qū)分傳統(tǒng)測(cè)序和單細(xì)胞測(cè)序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱為批量測(cè)序。單細(xì)胞測(cè)序高通量測(cè)序公司

KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序?qū)τ跇颖镜牧?,要求的也比較少。上海地區(qū)基因組高通量測(cè)序產(chǎn)品

如果你的樣品是質(zhì)?;蛘呤蔷?,那為什么不試試我們的KBSeq呢?準(zhǔn)確、迅速,可以說(shuō)是KBSeq的代名詞了,關(guān)鍵是還可以省錢,估計(jì)這是很多小伙伴們一定會(huì)說(shuō),你這個(gè)服務(wù)單價(jià)可比Sanger貴多了,怎么可能會(huì)省錢呢?Sanger測(cè)序的價(jià)格:常規(guī)的一代測(cè)序基本上要每800 bp就測(cè)一個(gè)反應(yīng),那我們來(lái)算一下14000/800=17.5,那基本上就要測(cè)18個(gè)反應(yīng)了,按照現(xiàn)在生工官方的價(jià)格區(qū)間,這個(gè)屬于反應(yīng)數(shù)在10-49個(gè)反應(yīng)之間的,那每個(gè)反應(yīng)的價(jià)格為26元,這樣算下來(lái)18*26=468元,還要加上引物合成的費(fèi)用,實(shí)驗(yàn)周期的話大概率是要超過(guò)15天的。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序的價(jià)格:序列長(zhǎng)度屬于6-15 kb之間,159元,實(shí)驗(yàn)的周期大概在5-7天左右。上海地區(qū)基因組高通量測(cè)序產(chǎn)品

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標(biāo)簽: 高通量測(cè)序