RNA類高通量測(cè)序樣品要求:對(duì)于需要進(jìn)行 RNA 抽提的樣品,請(qǐng)使用新鮮取樣的實(shí)驗(yàn)材料,當(dāng)場(chǎng)分成小塊(動(dòng)物樣品厚度需小于0.5 cm,植物樣品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗(yàn),在秋冬季節(jié),如果打包合適,5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時(shí),而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些)中用保溫箱寄送。一般組織樣品,送樣量至少200 mg/樣;如果樣品屬于孢子,送樣量至少500 mg/樣。生工生物已開(kāi)展10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-seq)服務(wù),如果正好您有需要,那就快快來(lái)call我們吧!上海地區(qū)基因組高通量測(cè)序測(cè)序
全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(Total RNA-Seq),項(xiàng)目介紹:全轉(zhuǎn)錄組是指特定細(xì)胞在特定狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA(non-coding RNA)。針對(duì)非編碼RNA的研究主要集中在具有調(diào)控作用的miRNA,lncRNA和circRNA。基于二代測(cè)序技術(shù)的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究,同時(shí)分析同一樣本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA,并且通過(guò)關(guān)聯(lián)分析,使研究?jī)?nèi)容更加系統(tǒng)化,致力于深入挖掘生命現(xiàn)象背后的轉(zhuǎn)錄調(diào)控問(wèn)題。組織樣品或者總 RNA, 樣品名稱清晰,干冰運(yùn)輸。上海市SNP高通量測(cè)序NGS近年來(lái),隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展和普及,單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)發(fā)展十分迅速。
真核/原核有參mRNA-Seq,項(xiàng)目介紹:轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)廣義上指某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的gather,狹義上指所有mRNA的gather。轉(zhuǎn)錄組是研究基因表達(dá)的主要手段,是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是生物體重要的調(diào)控方式,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控,是目前運(yùn)用較多的研究方式。測(cè)序使用Illumina Xten平臺(tái),測(cè)序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)質(zhì)控后,mapping至參考基因組序列,對(duì)mapping到基因上的reads進(jìn)行計(jì)數(shù),計(jì)算基因的表達(dá)量后,進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對(duì)于多個(gè)樣本,可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外,依據(jù)參考基因組,可進(jìn)行諸如基因覆蓋度、測(cè)序飽和度等驗(yàn)證性分析;可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析等分析。另外,還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析,深入研究基因功能,進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息,為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。
生工CHIP-Seq,項(xiàng)目介紹:CHIP-SEQ 技術(shù),即染色質(zhì)免疫共沉淀與高通量測(cè)序相結(jié)合的技術(shù)。它是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA 相互作用的有力工具,還可以用來(lái)研究轉(zhuǎn)錄因子與基因表達(dá)的關(guān)系。通過(guò)高通量測(cè)序,可以一次性得到目的蛋白在整個(gè)基因組上的結(jié)合分布,得到目的蛋白精確的結(jié)合位點(diǎn)以及結(jié)合基序等信息。ChIP-Seq 的原理:首先通過(guò)染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP)特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA 的所屬片段,并對(duì)其進(jìn)行純化與文庫(kù)構(gòu)建;然后對(duì)富集得到的DNA的片段進(jìn)行高通量測(cè)序,將獲得的數(shù)百萬(wàn)條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA 區(qū)段信息。在運(yùn)輸前將所有樣品管集中放于大包裝中。
生工高通量測(cè)序樣品要求,RNA樣品:請(qǐng)?zhí)峁舛取?50 ng/μl、總量≥2μg的總RNA樣品,樣品請(qǐng)去蛋白并進(jìn)行DNase處理;請(qǐng)務(wù)必提供每個(gè)樣品具體的濃度、體積、制備時(shí)間以及物種來(lái)源。比較好附上QC數(shù)據(jù),可以是電泳膠圖、分光光度值、Nanodrop儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)或者Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)等;一般情況下,轉(zhuǎn)錄組測(cè)序需要Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥7;小RNA測(cè)測(cè)序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒,可選擇傳統(tǒng)總RNA提取法(如乙醇沉淀、異丙醇沉淀等)或者選用專門(mén)的小RNA提取試劑盒;寄送RNA樣品請(qǐng)置于1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時(shí)間,管口使用Parafilm封口。在運(yùn)輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中,再將50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰運(yùn)輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運(yùn)輸過(guò)程中樣品降解的可能性。10xGenomics Chromium X多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。上海市生工高通量測(cè)序高通量
使用足量的干冰運(yùn)輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運(yùn)輸過(guò)程中樣品降解的可能性。上海地區(qū)基因組高通量測(cè)序測(cè)序
生工人線粒體基因組測(cè)序(多重?cái)U(kuò)增法),項(xiàng)目介紹:生工生物高通量測(cè)序部采用多重?cái)U(kuò)增技術(shù),對(duì)人線粒體基因組進(jìn)行擴(kuò)增捕獲,并進(jìn)一步采用Illumina測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序。該技術(shù)方案可以快速擴(kuò)增到幾乎線粒體全長(zhǎng),并進(jìn)行高深度測(cè)序,下游提供常規(guī)比對(duì)篩查突變等生物信息分析??蛻籼峁悠奉愋停?.人來(lái)源DNA,濃度大于1ng/ul,總量大于20ng,以Qubit檢測(cè)結(jié)果為準(zhǔn)2.運(yùn)輸條件:冰袋運(yùn)輸。交付信息:1.測(cè)序原始數(shù)據(jù)交付實(shí)驗(yàn)報(bào)告2.測(cè)序原始數(shù)據(jù)3.突變分析結(jié)果。上海地區(qū)基因組高通量測(cè)序測(cè)序
生工生物工程(上海)股份有限公司是一家有著先進(jìn)的發(fā)展理念,先進(jìn)的管理經(jīng)驗(yàn),在發(fā)展過(guò)程中不斷完善自己,要求自己,不斷創(chuàng)新,時(shí)刻準(zhǔn)備著迎接更多挑戰(zhàn)的活力公司,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中匯聚了大量的人脈以及**,在業(yè)界也收獲了很多良好的評(píng)價(jià),這些都源自于自身不努力和大家共同進(jìn)步的結(jié)果,這些評(píng)價(jià)對(duì)我們而言是比較好的前進(jìn)動(dòng)力,也促使我們?cè)谝院蟮牡缆飞媳3謯^發(fā)圖強(qiáng)、一往無(wú)前的進(jìn)取創(chuàng)新精神,努力把公司發(fā)展戰(zhàn)略推向一個(gè)新高度,在全體員工共同努力之下,全力拼搏將共同生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手走向更好的未來(lái),創(chuàng)造更有價(jià)值的產(chǎn)品,我們將以更好的狀態(tài),更認(rèn)真的態(tài)度,更飽滿的精力去創(chuàng)造,去拼搏,去努力,讓我們一起更好更快的成長(zhǎng)!