上海地區(qū)宏全基因組高通量測序技術(shù)

來源: 發(fā)布時間:2022-10-18

如果你的樣品是質(zhì)?;蛘呤蔷?,那為什么不試試我們的KBSeq呢?準(zhǔn)確、迅速,可以說是KBSeq的代名詞了,關(guān)鍵是還可以省錢,估計這是很多小伙伴們一定會說,你這個服務(wù)單價可比Sanger貴多了,怎么可能會省錢呢?Sanger測序的價格:常規(guī)的一代測序基本上要每800 bp就測一個反應(yīng),那我們來算一下14000/800=17.5,那基本上就要測18個反應(yīng)了,按照現(xiàn)在生工官方的價格區(qū)間,這個屬于反應(yīng)數(shù)在10-49個反應(yīng)之間的,那每個反應(yīng)的價格為26元,這樣算下來18*26=468元,還要加上引物合成的費用,實驗周期的話大概率是要超過15天的。KBSeq全質(zhì)粒測序的價格:序列長度屬于6-15 kb之間,159元,實驗的周期大概在5-7天左右。如果是水體樣品,建議采用濾膜過濾后,將濾膜寄送來生工。上海地區(qū)宏全基因組高通量測序技術(shù)

AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一種小分子染料,可以通過完整的細(xì)胞膜,嵌入所有細(xì)胞(活細(xì)胞和死細(xì)胞)的細(xì)胞核,呈現(xiàn)綠色熒光;碘化丙啶(PI)只能通過不完整的細(xì)胞膜,即死細(xì)胞的細(xì)胞膜,嵌入所有死細(xì)胞的細(xì)胞核,呈現(xiàn)紅色熒光,通過標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細(xì)胞和死細(xì)胞,這種特異性染色的方法也可以排除無核細(xì)胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。熒光細(xì)胞計數(shù)儀檢測結(jié)果可以讓我們直觀的看到:細(xì)胞濃度(總細(xì)胞,活細(xì)胞,死細(xì)胞)、細(xì)胞存活率(臺盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色)、細(xì)胞平均直徑、細(xì)胞聚團(tuán)率、細(xì)胞直徑分布等結(jié)果的展示。轉(zhuǎn)錄組高通量測序原理寄送RNA樣品請置于1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Parafilm封口。

為什么要用單細(xì)胞測序技術(shù)?細(xì)胞是生物體結(jié)構(gòu)和功能的基本單位,在生物體生長發(fā)育的過程中,因細(xì)胞類型、外界環(huán)境以及內(nèi)部調(diào)節(jié)因素的不同,其轉(zhuǎn)錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程,以及在細(xì)胞分裂和分化過程中出現(xiàn)的誤差造成來自同一細(xì)胞系或個體的細(xì)胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細(xì)胞異質(zhì)性。細(xì)胞異質(zhì)性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測序檢測的是一個細(xì)胞群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組的信息,如培養(yǎng)的大量細(xì)胞、動植物組織甚至是整個生物體。在過去的20多年中,人們對轉(zhuǎn)錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),卻無法揭示細(xì)胞的異質(zhì)性。傳統(tǒng)方法得到的是細(xì)胞群的平均基因組,而單細(xì)胞測序測量的是細(xì)胞群中單個細(xì)胞的基因組[7]?,F(xiàn)在也有學(xué)者為了區(qū)分傳統(tǒng)測序和單細(xì)胞測序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱為批量測序。

轉(zhuǎn)錄組測序,項目介紹:RNA-Seq,是基于新一代測序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法:首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的 RNA 并進(jìn)行 mRNA 富集,然后反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后進(jìn)行新一代高通量測序,在此基礎(chǔ)上進(jìn)行短片段拼接組裝,從而獲得一個個單獨轉(zhuǎn)錄本,進(jìn)而可以對該生物樣品當(dāng)前狀態(tài)的基因表達(dá)狀況有全局了解。對不同階段或部位生物樣品的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行 比較分析,則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達(dá)水平的變化,針對關(guān)鍵基因則可以進(jìn)行代謝通路(Pathway)的構(gòu)建。RNA樣品建議用足量干冰運輸。

樣本寄送時,請將填寫完整的紙質(zhì)版《高通量測序送樣表》密封于塑料袋內(nèi),隨樣本一起寄出,紙質(zhì)版的樣本信息單用于樣本接收人員在收到樣本后及時并正確的保存并錄入樣本,如無紙質(zhì)版的樣本信息單可能會延誤項目周期;樣本管壁或管蓋上標(biāo)明的樣本名稱需要與《高通量測序送樣表》里樣本名稱一致,這樣可以避免我們收到樣本后與您確認(rèn)樣本編號而耽誤樣本質(zhì)檢、提取實驗;如有特殊情況,請在《高通量測序送樣表》中注明;樣品編號請避免使用中文、羅馬數(shù)字、“-”以及特殊符號標(biāo)示,避免分析的時候系統(tǒng)無法識別,導(dǎo)致分析無法完成;我們分析人員建議編號可以采用英文字母與阿拉伯?dāng)?shù)字結(jié)合的形式,字符比較好不要過長,避免繪制部分分析圖的時候難以全部展示。生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗,日均處理樣品200余例。上海市l(wèi)ncRNA高通量測序NGS

請合理安排樣品寄送時間,避免樣本在周六、周日或法定節(jié)假日到達(dá)生工生物。上海地區(qū)宏全基因組高通量測序技術(shù)

生工人線粒體基因組測序(多重擴增法),項目介紹:生工生物高通量測序部采用多重擴增技術(shù),對人線粒體基因組進(jìn)行擴增捕獲,并進(jìn)一步采用Illumina測序平臺進(jìn)行高通量測序。該技術(shù)方案可以快速擴增到幾乎線粒體全長,并進(jìn)行高深度測序,下游提供常規(guī)比對篩查突變等生物信息分析??蛻籼峁悠奉愋停?.人來源DNA,濃度大于1ng/ul,總量大于20ng,以Qubit檢測結(jié)果為準(zhǔn)2.運輸條件:冰袋運輸。交付信息:1.測序原始數(shù)據(jù)交付實驗報告2.測序原始數(shù)據(jù)3.突變分析結(jié)果。上海地區(qū)宏全基因組高通量測序技術(shù)

生工生物工程(上海)股份有限公司是一家有著先進(jìn)的發(fā)展理念,先進(jìn)的管理經(jīng)驗,在發(fā)展過程中不斷完善自己,要求自己,不斷創(chuàng)新,時刻準(zhǔn)備著迎接更多挑戰(zhàn)的活力公司,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中匯聚了大量的人脈以及**,在業(yè)界也收獲了很多良好的評價,這些都源自于自身不努力和大家共同進(jìn)步的結(jié)果,這些評價對我們而言是比較好的前進(jìn)動力,也促使我們在以后的道路上保持奮發(fā)圖強、一往無前的進(jìn)取創(chuàng)新精神,努力把公司發(fā)展戰(zhàn)略推向一個新高度,在全體員工共同努力之下,全力拼搏將共同生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手走向更好的未來,創(chuàng)造更有價值的產(chǎn)品,我們將以更好的狀態(tài),更認(rèn)真的態(tài)度,更飽滿的精力去創(chuàng)造,去拼搏,去努力,讓我們一起更好更快的成長!

標(biāo)簽: 高通量測序