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genvois的OpeRATOR 是一種內(nèi)切蛋白酶,可催化直接靠近 O-聚糖的天然粘蛋白型 O-糖基化蛋白的肽鍵的水解。內(nèi)切蛋白酶具有高特異性,可消化絲氨酸或蘇氨酸殘基的O-聚糖N端的蛋白質(zhì)。 OpeRATOR 活性需要粘蛋白型的 O-聚糖,并且該酶不會(huì)用 N-連接聚糖消化糖蛋白。該酶對(duì)具有亞洲化he心1 O-聚糖的位點(diǎn)z活躍。它還消化唾液酸化的he心 1 和he心 3,但程度要低得多。為了獲得z佳性能,需要去除唾液酸,因此,SialEXO凍干(唾液酸酶混合物)包含在購(gòu)買中。 PNGase F酶在大腸桿菌中表達(dá),該重組基因來(lái)源于伊麗莎白金氏腦膜敗血癥。安徽固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物藥物開(kāi)發(fā)
Genovis的GlycOCATCH?是一種親和樹脂,可特異性結(jié)合O-糖基化(粘蛋白型)蛋白和肽,從而實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)單的工作流程,以富集和純化攜帶O-聚糖的蛋白質(zhì)和肽。洗滌離心柱,并用8M尿素洗脫結(jié)合的蛋白質(zhì)。對(duì)洗脫材料的分析表明,由于洗脫O-糖基化蛋白,并且樹脂與非糖基化蛋白和N-糖基化蛋白的結(jié)合可以忽略不計(jì)。選擇性結(jié)合 O-糖蛋白:為了測(cè)試選擇性,將一系列 O-糖基化、N-糖基化和非糖基化蛋白與Genovis的GlycOCATCH 一起孵育。為了在肽水平上研究Genvois的GlycOCATCH的O-糖特異性,將O-glcyosyled肽(糖蛋白)與一系列未修飾的肽混合。云南固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶GalactEXO由兩種半乳糖苷酶組成,均帶有His標(biāo)簽,組分的分子量為87 kDa和109 kDa。
Genovis的PNGase F(肽 N-糖苷酶 F)是一種糖酰胺酶,可水解多肽天冬酰胺與所有哺乳動(dòng)物天冬酰胺連接復(fù)合物、雜交或高甘露糖寡糖的內(nèi)層 GlcNAc 之間的酰胺鍵。該酶用于MS分析前的樣品制備,以降低蛋白質(zhì)異質(zhì)性并實(shí)現(xiàn)游離的聚糖分析,并研究N-聚糖的功能作用。1. 對(duì)所有哺乳動(dòng)物N-聚糖的高效水解;2.對(duì)多種糖蛋白具有活性;3.可固定在即用型離心柱產(chǎn)品形式;4. 自動(dòng)化友好型,96孔板,用于高通量 N-糖去除。Genovis的ImpaRATOR 是一種 O-糖依賴性蛋白酶,可消化攜帶粘蛋白型。O-聚糖的蛋白質(zhì),包括唾液酸化物質(zhì)、糖基化絲氨酸和 Thr 殘基的 N-末端。該酶產(chǎn)生攜帶 O-糖的糖肽,從而實(shí)現(xiàn) O-糖譜分析、位點(diǎn)占用測(cè)定和 O-糖肽圖譜以及使用 LC-MS 分析的中級(jí)方法。1. 特異性廣 - 接受多種 O-聚糖變體,包括唾液酸化物種;2. 可靠O-聚糖特異性蛋白酶 – 消化絲氨酸/蘇氨酸糖基化位點(diǎn)的 N 末端;3. 穩(wěn)健的消化,增強(qiáng)復(fù)雜生物制藥的表征。
使用Genovis的GalNAcEXO 對(duì) O-糖基化生物制藥進(jìn)行 Tn 抗原表征:未成熟的截短O-聚糖導(dǎo)致了復(fù)雜生物制藥的異質(zhì)性,使其分析更具挑戰(zhàn)性。 O-聚糖的he心由n-α-GalNAc殘基組成,通過(guò)糖苷鍵與絲氨酸或蘇氨酸連接,稱為Tn抗原。 現(xiàn)在,使用GalNAcEXO可以采用合適的酶策略來(lái)去除這些GalNAc并簡(jiǎn)化生物制藥的表征。在質(zhì)譜圖中可以觀察到重復(fù)峰的模式。其次,在與GalNAcEXO酶孵育后,剩余的GalNAc殘基被完全去除,留下一個(gè)峰。因此,該工作流程確認(rèn)了 O-糖基化生物制藥上存在 Tn 抗原,并允許定量he心 GalNAc 水平。這種工作流程的另一個(gè)好處是減少了剩余的異質(zhì)性,這有助于確認(rèn)蛋白質(zhì)的完整質(zhì)量,并揭示截短的片段。GalactEXO微離心柱經(jīng)過(guò)格式化,可在30-60分鐘內(nèi)水解0.5mg糖蛋白中的半乳糖。
Genovis的FucosEXO 是 α-巖藻糖苷酶的混合物,用于有效水解天然 N-和 O-糖基化蛋白或游離寡糖上的 α1-2、α1-3 和 α1-4-連接巖藻糖殘基。它是 N-和 O-糖蛋白的聚糖結(jié)構(gòu)分析以及寡糖的外切糖苷酶陣列的寶貴工具。1. 高效α-巖藻糖苷酶混合物 – 快速去除 α1-2、α1-3 和 α1-4-連接的巖藻糖;2. 可靠的酶解增加了對(duì)外切糖苷酶陣列的信心;3. 可固定在即用型離心柱中。用于糖蛋白去氟糖基化的凍干酶。Genovis的FucosEXO凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在2000單位的小瓶中,用于2mg糖蛋白的去碳基化。PNGase F 固定化微離心柱含有與瓊脂糖珠共價(jià)偶聯(lián)的 PNGase F 酶,用于在z終樣品中酶峰減少的糖蛋白上水解 N-糖。浙江PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究
PNGase F是一種非常成熟的工具。O-糖的去除可能更具挑戰(zhàn)性,現(xiàn)有的O-糖釋放化學(xué)方法不太適合下游分析。安徽固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物藥物開(kāi)發(fā)
當(dāng)在完整狀態(tài)下進(jìn)行分析時(shí),EPO的聚糖異質(zhì)性導(dǎo)致了非常復(fù)雜的質(zhì)譜圖。通過(guò)在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小時(shí),可以有效地去除 N 糖(含有PNGase F酶)和 O-糖,如對(duì)應(yīng)于未修飾蛋白質(zhì)的單個(gè)峰所示。EPO上殘留了少量用乙酰化唾液酸修飾的O-聚糖,因?yàn)镺mniGLYZOR對(duì)這種結(jié)構(gòu)的水解效率低下。根據(jù)制造商Genvois的建議(在37°C下進(jìn)行O/N孵育),兩種底物蛋白也用另一種市售的去糖基化產(chǎn)物處理,并顯示數(shù)據(jù)以供比較。另一方面,N-聚糖在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中翻譯地連接到未折疊的蛋白質(zhì)上。這導(dǎo)致某些 N-糖基化位點(diǎn)難以被 Genovis的PNGase F 接近,或者一旦底物蛋白折疊成其天然狀態(tài),就根本無(wú)法接近。因此,這種N-聚糖的水解需要底物蛋白以與酶活性相容的方式變性。安徽固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物藥物開(kāi)發(fā)