云南高活性/無(wú)非特異酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究

Core 1型O-聚糖的水解：O-糖基化不僅難以研究，其自然異質(zhì)性也會(huì)導(dǎo)致其他分析出現(xiàn)問(wèn)題。例如，由于樣品中存在許多不同的糖型，因此對(duì)完整或中等水平的重糖基化蛋白質(zhì)進(jìn)行質(zhì)譜分析可能非常困難。酶法去除N-聚糖的解決方案已經(jīng)存在多年，Genvois的PNGase F是一種非常成熟的工具。O-糖的去除可能更具挑戰(zhàn)性，現(xiàn)有的O-糖釋放化學(xué)方法通常會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)發(fā)生重大修飾，因此不太適合下游分析。1. 用于方法開(kāi)發(fā)的靈活產(chǎn)品形式；2. 可以結(jié)合酶以提高效率；3. 適用于自動(dòng)化工作流程；4. 即用型 - 只需加水即可。現(xiàn)O-糖基化藥有Tn抗原，定量he心 GalNAc 水平，減少了異質(zhì)性。云南高活性/無(wú)非特異酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究

與PNGase F類(lèi)似，Genvois的OmniGLYZOR用于攜帶N-和簡(jiǎn)單O-糖的糖蛋白的去糖基化。 OmniGLYZOR 試劑盒包括：OmniGlyZOR 微離心柱；PNGase F 凍干；RapiGest?* SF表面活性劑。除非底物蛋白變性，否則某些 N-糖基化位點(diǎn)很難或無(wú)法被 PNGase F 接近。在OmniGLYZOR Microspin柱上孵育后剩余的N-糖可以在變性條件下使用試劑盒中包含的PNGase F凍干和RapiGest? SF表面活性劑通過(guò)額外的去糖基化步驟去除。使用Genovis的OpeRAT對(duì)EPO進(jìn)行O-糖位點(diǎn)特異性消化：對(duì)于jin攜帶一個(gè)或幾個(gè) O-糖基化位點(diǎn)的簡(jiǎn)單底物蛋白，OpeRATOR 也可用于繪制中間水平的 O-糖基化位點(diǎn)。 廣東用于自動(dòng)化系統(tǒng)的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶疾病機(jī)理研究ImpaRATOR 酶不會(huì)消化未修飾的絲氨酸或蘇氨酸殘基，也不會(huì)在糖蛋白的N-糖基化位點(diǎn)。

我們展示了使用兩種蛋白作為底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一種 Fc 融合蛋白，含有 TNFα 受體的胞外結(jié)構(gòu)域。該結(jié)構(gòu)域用 2 個(gè) N-糖和 8-11 個(gè) 1 個(gè)具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修飾。在 37°C 下將這種重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小時(shí)，可完全去除所有 N-和 O-糖，如中級(jí) LC-MS 分析所示。促紅xibao生成素 （EPO） 是一種攜帶 3 個(gè) N-聚糖和 1 個(gè)he心 1 個(gè) O-聚糖的小蛋白質(zhì)，其總質(zhì)量的近 40% 由聚糖組成。O-連接聚糖通常存在于蛋白質(zhì)的暴露位置，因?yàn)樗鼈冊(cè)诘鞍踪|(zhì)折疊發(fā)生后附著。只有負(fù)責(zé)其合成的糖基轉(zhuǎn)移酶才能接觸到這些暴露的位點(diǎn)。

生成攜帶 O-糖的糖肽，該酶可實(shí)現(xiàn) O-糖譜分析、O-糖肽圖譜和位點(diǎn)占用測(cè)定，以及使用 MS 分析的中級(jí)方法。1.可靠O-聚糖特異性蛋白酶 – 消化絲氨酸/蘇氨酸糖基化位點(diǎn)的 N 末端；2.穩(wěn)健的消化，增強(qiáng)復(fù)雜生物制藥的表征；3.高特異性 - 可靠的聚糖位點(diǎn)測(cè)定和定位。Genovis的OpeRATOR 是一種 O-聚糖特異性蛋白酶，可消化攜帶he心1 O-聚糖的蛋白質(zhì)，糖基化（he心 1）Ser 和 Thr 殘基的 N 端。OpeRATOR 來(lái)源于 Akkermansia muciniphila，并以 E 表達(dá)。大腸桿菌。該酶含有 His 標(biāo)簽，分子量為 42 kDa。SialEXO 來(lái)源于 Akkermansia muciniphila，并以 E 表達(dá)。大腸桿菌。SialEXO Lyophilized 中的酶也含有 His 標(biāo)簽，這些組分的分子量分別為 43 kDa 和 66 kDa。用于消化粘蛋白型O-糖蛋白和肽的凍干酶。Genovis的OpeRATOR 凍干劑以?xún)龈煞勰┑男问教峁b在 2000 個(gè)單位的小瓶中，用于消化 2 mg O-糖基化蛋白。OpeRATOR 來(lái)源于 Akkermansia muciniphila，并以 E 表達(dá)。大腸桿菌。該酶含有 His 標(biāo)簽，分子量為 42 kDa。

Genovis的ImpaRATOR? 和 OpeRATOR? - 兩種協(xié)同的作用：O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化區(qū)域O-聚糖位點(diǎn)的覆蓋率（圖3）。使用OpeRATOR鑒定對(duì)應(yīng)于所有13個(gè)O-聚糖位點(diǎn)的肽，而使用ImpaRATOR只能明確鑒定10個(gè)位點(diǎn)。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR （1） 具有更具選擇性的氨基酸序列偏好，此處由 S186 和 T245 位點(diǎn)缺乏消化來(lái)表明。此外，ImpaRATOR 在兩個(gè)相鄰的 O-糖基化氨基酸之間顯示出有限的裂解，如 S213 位點(diǎn)酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位點(diǎn)酶解肽的低強(qiáng)度所證明的那樣。在OpeRATOR酶解樣品（T184-S199和T200-H204;圖2b和d），而在ImpaRATOR消化的樣品中，具有漏裂的相應(yīng)肽（S184-H204）的強(qiáng)度更高。 雖然OpeRATOR顯示出更高的O-聚糖位點(diǎn)覆蓋率，但使用ImpaRATOR進(jìn)行消化可以表征O-聚糖結(jié)構(gòu)，包括唾液酸化物種。例如，條形圖插入顯示了兩種糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖種類(lèi)。這應(yīng)該與使用OpeRATOR的消化進(jìn)行比較，在OpeRATOR中，必須去除唾液酸才能產(chǎn)生酶活性，這意味著有關(guān)唾液酸化的信息丟失?？偠灾?，ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有關(guān)聚糖組成和 O-聚糖位點(diǎn)的完整信息。瑞典生物技術(shù)公司Genovis率先次提供IdeS工具酶等，用于mAb、ADC藥物的開(kāi)發(fā)、生產(chǎn)和質(zhì)量控制。云南高活性/無(wú)非特異酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究

倍篤生物代理多條產(chǎn)品線(xiàn)，用于聚糖分析用酶、ADC偶聯(lián)技術(shù)、QED抗體對(duì)、AAV中和抗體、IdeS蛋白酶等。云南高活性/無(wú)非特異酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究

從依那西普水解β1-3和β1-4半乳糖：Genovis的GalactEXO Immobilized 對(duì) β1-3 和 β1-4 連接的半乳糖均具有酶活性，這些半乳糖存在于裝飾有 N- 和 O-連接糖基化的生物制藥中，例如 Fc-融合蛋白依那西普。將依那西普與GalactEXO固定化孵育60分鐘，并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亞基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分別分析。與GalactEXO Immobilized孵育導(dǎo)致N-連接和O-連接聚糖上的半乳糖殘基水解，這在半乳糖基化物種中被視為信號(hào)丟失。對(duì)游離的N-聚糖分析證實(shí)了LC-MS數(shù)據(jù)。云南高活性/無(wú)非特異酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究