南京血液數(shù)字PCR方案

聚合酶鏈反應也可以用作以下敏感試驗的一部分組織分型，對移植至關重要。截至2008年，甚至有人提議用聚合酶鏈反應檢測取代傳統(tǒng)的血型抗體檢測。許多形式的病癥涉及致病基因的改變。通過使用基于聚合酶鏈反應的測試來研究這些突變，醫(yī)治方案有時可以根據患者的不同而不同。聚合酶鏈反應可以早期診斷惡性疾病，如白血病和淋巴瘤，這是目前病癥研究中發(fā)展很快的，并且已經被常規(guī)使用。PCR檢測可以直接在基因組DNA樣品上進行，以檢測易位特異性惡性細胞，其靈敏度至少是其他方法的10，000倍。聚合酶鏈反應在醫(yī)學領域非常有用，因為它允許分離和擴增病癥抑制劑。例如，定量PCR可以用于量化和分析單細胞，以及識別DNA、mRNA和蛋白質的確認和組合。聚合酶鏈式反應準備：引物內部不應出現(xiàn)互補序列。南京血液數(shù)字PCR方案

聚合酶鏈式反應的特點：靈敏度高：PCR產物的生成量是以指數(shù)方式增加的，能將皮克(pg=10-12）量級的起始待測模板擴增到微克（μg=-6）水平。能從100萬個細胞中檢出一個靶細胞；在病毒的檢測中，PCR的靈敏度可達3個RFU(空斑形成單位）；在細菌學中很小檢出率為3個細菌。簡便、快速：PCR反應用耐高溫的Taq DNA聚合酶，一次性地將反應液加好后，即在DNA擴增液和水浴鍋上進行變性-退火-延伸反應，一般在2～4 小時完成擴增反應。擴增產物一般用電泳分析，不一定要用同位素，無放射性污染、易推廣。純度要求低：不需要分離病毒或細菌及培養(yǎng)細胞，DNA 粗制品及RNA均可作為擴增模板。可直接用臨床標本如血液、體腔液、洗嗽液、毛發(fā)、細胞、活組織等DNA擴增檢測。南京血液數(shù)字PCR方案嵌套聚合酶鏈反應的兩組引物用于兩個連續(xù)的PCR。

聚合酶鏈式反應的循環(huán)參數(shù)：預變性，模板DNA完全變性與PCR酶的完全對PCR能否成功至關重要，建議加熱時間參考試劑說明書，一般未修飾的Taq酶時間為兩分鐘。變性步驟，循環(huán)中一般95℃，30秒足以使各種靶DNA序列完全變性，可能的情況下可縮短該步驟時間。變性時間過長損害酶活性，過短靶序列變性不徹底，易造成擴增失敗。引物退火，退火溫度需要從多方面去決定，一般根據引物的Tm值為參考，根據擴增的長度適當下調作為退火溫度。然后在此次實驗基礎上做出預估。退火溫度對PCR的特異性有較大影響。引物延伸，引物延伸一般在72℃進行（Taq酶很適溫度）。但在擴增長度較短且退火溫度較高時，本步驟可省略延伸時間隨擴增片段長短而定，一般推薦在1000bp以上，含Pfu及其衍生物的衍生設定為1min/kbp。循環(huán)數(shù)，大多數(shù)PCR含25-35循環(huán)，過多易產生非特異擴增。延伸，在一個循環(huán)后，反應在72℃維持10-30分鐘．使引物延伸完全，并使單鏈產物退火成雙鏈。

絕大多數(shù)聚合酶鏈反應方法依賴于熱循環(huán)。熱循環(huán)將反應物暴露于加熱和冷卻的重復循環(huán)中，以允許不同的溫度依賴性反應——具體地說，脫氧核糖核酸融化和酶-驅動DNA復制。聚合酶鏈反應使用兩種主要試劑-引物(引物是短的單鏈DN段，稱為寡核苷酸，是目標DNA區(qū)域的互補序列)和DNA聚合酶。在PCR反應的步，DNA雙螺旋結構的兩條鏈在高溫下物理分離，這個過程稱為脫氧核糖核酸變性。第二步，降低溫度，引物與互補的脫氧核糖核酸序列結合。這兩條DNA鏈就變成了模板，以酶促的方式從構成DNA的自由核苷酸中組裝出一條新的DNA鏈。隨著聚合酶鏈反應的進行，產生的DNA本身被用作復制的模板，啟動了一個連鎖反應，原始的DNA模板是以指數(shù)形式放大。聚合酶鏈反應五要素：參加PCR反應的物質主要有五種即：引物、酶、dNTP、模板和緩沖液。

聚合酶鏈式反應的試驗污染：實驗室中克隆質粒的污染：在分子生物學實驗室及某些用克隆質粒做陽性對照的檢驗室，這個問題也比較常見。因為克隆質粒在單位容積內含量相當高，另外在純化過程中需用較多的用具及試劑，而且在活細胞內的質粒，由于活細胞的生長繁殖的簡便性及具有很強的生命力。其污染可能性也很大。污染的監(jiān)測：一個好的實驗室，要時刻注意污染的監(jiān)測，考慮有無污染是什么原因造成的污染，以便采取措施，防止和消除污染。重復性試驗。選擇不同區(qū)域的引物進行PCR擴增。聚合酶鏈式反應的引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%。南京血液數(shù)字PCR方案

聚合酶鏈反應具有定量合成產物的優(yōu)點。南京血液數(shù)字PCR方案

聚合酶鏈反應：嵌套聚合酶鏈反應:通過減少DNA非特異性擴增的背景，提高DNA擴增的特異性。兩組引物用于兩個連續(xù)的PCR。在個反應中，一對引物用于產生DNA產物，除了預期的靶之外，該產物可能仍然由非特異性擴增的DN段組成。然后用一組引物將產物用于第二次聚合酶鏈反應，所述引物的結合位點完全或部分不同于次反應中使用的每個引物，并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴增長DN段方面通常比傳統(tǒng)PCR更成功，但它需要更詳細的目標序列知識。重疊延伸聚合酶鏈反應或者通過重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個或多個含有互補序列的DN段拼接在一起的基因工程技術。它用于連接含有基因、調節(jié)序列或突變的DN段；這項技術可以創(chuàng)造特定的長DNA構建體。它還可以將缺失、插入或點突變引入DNA序列。南京血液數(shù)字PCR方案

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