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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:PCR引物設(shè)計(jì):PCR反應(yīng)中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設(shè)計(jì)引物時(shí)以一條DNA單鏈為基準(zhǔn)(常以信息鏈為基準(zhǔn)),5′端引物與位于待擴(kuò)增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴(kuò)增片段3′端的一小段DNA序列互補(bǔ)。引物設(shè)計(jì)的基本原則:引物長(zhǎng)度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C 過(guò)多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC很好隨機(jī)分布,避免5個(gè)以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。聚合酶鏈反應(yīng)可用于產(chǎn)生突變基因,突變由科學(xué)家隨意選擇。南通骨頭定量PCR原理
現(xiàn)在有些PCR因?yàn)閿U(kuò)增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時(shí)間內(nèi)復(fù)制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時(shí)在60℃-65℃間進(jìn)行,以減少一次升降溫過(guò)程,提高了反應(yīng)速度。檢測(cè):PCR反應(yīng)擴(kuò)增出了高的拷貝數(shù),下一步檢測(cè)就成了關(guān)鍵。熒光素(溴化乙錠,EB)染色凝膠電泳是很常用的檢測(cè)手段。電泳法檢測(cè)特異性是不太高的,因此引物兩聚體等非特異性的雜交體很容易引起誤判。但因?yàn)槠浜?jiǎn)捷易行,成為了主流檢測(cè)方法。近年來(lái)以熒光探針為的檢測(cè)方法,有逐漸取代電泳法的趨勢(shì)。溫州微量PCR檢測(cè)技術(shù)服務(wù)聚合酶鏈反應(yīng)非常敏感,有可能產(chǎn)生數(shù)百萬(wàn)到數(shù)十億份特定產(chǎn)品的拷貝,用于測(cè)序、克隆和分析。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的試驗(yàn)污染:實(shí)驗(yàn)室中克隆質(zhì)粒的污染:在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室及某些用克隆質(zhì)粒做陽(yáng)性對(duì)照的檢驗(yàn)室,這個(gè)問(wèn)題也比較常見(jiàn)。因?yàn)榭寺≠|(zhì)粒在單位容積內(nèi)含量相當(dāng)高,另外在純化過(guò)程中需用較多的用具及試劑,而且在活細(xì)胞內(nèi)的質(zhì)粒,由于活細(xì)胞的生長(zhǎng)繁殖的簡(jiǎn)便性及具有很強(qiáng)的生命力。其污染可能性也很大。污染的監(jiān)測(cè):一個(gè)好的實(shí)驗(yàn)室,要時(shí)刻注意污染的監(jiān)測(cè),考慮有無(wú)污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染。重復(fù)性試驗(yàn)。選擇不同區(qū)域的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
聚合酶鏈反應(yīng):嵌套聚合酶鏈反應(yīng):通過(guò)減少DNA非特異性擴(kuò)增的背景,提高DNA擴(kuò)增的特異性。兩組引物用于兩個(gè)連續(xù)的PCR。在個(gè)反應(yīng)中,一對(duì)引物用于產(chǎn)生DNA產(chǎn)物,除了預(yù)期的靶之外,該產(chǎn)物可能仍然由非特異性擴(kuò)增的DN段組成。然后用一組引物將產(chǎn)物用于第二次聚合酶鏈反應(yīng),所述引物的結(jié)合位點(diǎn)完全或部分不同于次反應(yīng)中使用的每個(gè)引物,并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴(kuò)增長(zhǎng)DN段方面通常比傳統(tǒng)PCR更成功,但它需要更詳細(xì)的目標(biāo)序列知識(shí)。重疊延伸聚合酶鏈反應(yīng)或者通過(guò)重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個(gè)或多個(gè)含有互補(bǔ)序列的DN段拼接在一起的基因工程技術(shù)。它用于連接含有基因、調(diào)節(jié)序列或突變的DN段;這項(xiàng)技術(shù)可以創(chuàng)造特定的長(zhǎng)DNA構(gòu)建體。它還可以將缺失、插入或點(diǎn)突變引入DNA序列。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的模板的取材主要依據(jù)PCR的擴(kuò)增對(duì)象,可以是病原體標(biāo)本如病毒、細(xì)菌、菌類(lèi)等。
序列標(biāo)簽站點(diǎn)是一個(gè)過(guò)程,其中PCR被用作基因組的特定片段存在于特定克隆中的指示物。人類(lèi)基因組計(jì)劃發(fā)現(xiàn)這一應(yīng)用對(duì)于繪制他們測(cè)序的粘??寺∫约皡f(xié)調(diào)不同實(shí)驗(yàn)室的結(jié)果至關(guān)重要。聚合酶鏈反應(yīng)的一個(gè)令人興奮的應(yīng)用是對(duì)來(lái)自遠(yuǎn)古來(lái)源的DNA進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,例如在尼安德特人的復(fù)原骨骼中、從猛犸的冷凍組織中或從埃及木乃伊的大腦中發(fā)現(xiàn)的DNA已經(jīng)被放大和測(cè)序。]在某些情況下,這些來(lái)源的高度降解的DNA可能在擴(kuò)增的早期階段重新組裝。聚合酶鏈反應(yīng)的一個(gè)常見(jiàn)應(yīng)用是對(duì)以下基因表達(dá)模式的研究。組織(甚至單個(gè)細(xì)胞)可以在不同階段進(jìn)行分析,以了解哪些基因變得活躍,哪些基因被關(guān)閉。該應(yīng)用還可以使用定量聚合酶鏈反應(yīng)來(lái)定量表達(dá)的實(shí)際水平。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)中要確保反應(yīng)緩沖液融化完全并徹底混勻。南通骨頭定量PCR原理
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)中的DMSO、甘油等,主要用來(lái)保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結(jié)構(gòu)。南通骨頭定量PCR原理
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):1976年,中國(guó)科學(xué)家,發(fā)現(xiàn)了穩(wěn)定的Taq DNA聚合酶,為PCR技術(shù)發(fā)展也做出了基礎(chǔ)性貢獻(xiàn)。PCR是利用DNA在體外攝氏95°高溫時(shí)變性會(huì)變成單鏈,低溫(經(jīng)常是60°C左右)時(shí)引物與單鏈按堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則結(jié)合,標(biāo)本核酸模板在提取過(guò)程中,由于吸樣污染導(dǎo)致標(biāo)本間污染;有些微生物標(biāo)本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴(kuò)散再調(diào)溫度至DNA聚合酶很適反應(yīng)溫度(72°C左右),DNA聚合酶沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互補(bǔ)鏈?;诰酆厦钢圃斓腜CR儀實(shí)際就是一個(gè)溫控設(shè)備,能在變性溫度,復(fù)性溫度,延伸溫度之間很好地進(jìn)行控制。南通骨頭定量PCR原理