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PCR反應(yīng)的比較大特點(diǎn)是具有較大擴(kuò)增能力與極高的靈敏性,但令人頭疼的問(wèn)題是易污染,極其微量的污染即可造成假陽(yáng)性的產(chǎn)生。主要原因有:1、標(biāo)本間交叉污染;2、PCR試劑的污染;3、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染;4、實(shí)驗(yàn)室中克隆質(zhì)粒的污染。一個(gè)好的實(shí)驗(yàn)室,要時(shí)刻注意污染的監(jiān)測(cè),考慮有無(wú)污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染。1、陽(yáng)性對(duì)照:在建立PCR反應(yīng)實(shí)驗(yàn)室及一般的檢驗(yàn)單位都應(yīng)設(shè)有PCR陽(yáng)性對(duì)照,它是PCR反應(yīng)是否成功、產(chǎn)物條帶位置及大小是否合乎理論要求的一個(gè)重要的參考標(biāo)志。2、陰性對(duì)照:每次PCR實(shí)驗(yàn)務(wù)必做陰性對(duì)照。它包括:(1)標(biāo)本對(duì)照:被檢的標(biāo)本是血清就用鑒定后的正常血清作對(duì)照;被檢的標(biāo)本是組織細(xì)胞就用相應(yīng)的組織細(xì)胞作對(duì)照。(2)試劑對(duì)照:在PCR試劑中不加模板DNA或RNA,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以監(jiān)測(cè)試劑是否污染。3、重復(fù)性試驗(yàn)。4、選擇不同區(qū)域的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。如何挑選pcr檢測(cè)試劑盒?山西高質(zhì)量pcr實(shí)驗(yàn)室
PCR原理:PCR是在試管中進(jìn)行的DNA復(fù)制反應(yīng),基本原理是依據(jù)細(xì)胞內(nèi)DNA半保留復(fù)制的機(jī)理,以及體外DNA分子于不同溫度下雙鏈和單鏈可以互相轉(zhuǎn)變的性質(zhì),人為地控制體外合成系統(tǒng)的溫度,以促使雙鏈DNA變成單鏈,單鏈DNA與人工合成的引物退火,然后耐熱DNA聚合酶以dNTP為原料使引物沿著單鏈模板延伸為雙鏈DNA。PCR全過(guò)程每一步的轉(zhuǎn)換是通過(guò)溫度的改變來(lái)控制的。需要重復(fù)進(jìn)行DNA模板解鏈、引物與模板DNA結(jié)合、DNA聚合酶催化新生DNA的合成,即高溫變性、低溫退火、中溫延伸3個(gè)步驟構(gòu)成PCR反應(yīng)的一個(gè)循環(huán),此循環(huán)的反復(fù)進(jìn)行,就可使目的DNA得以迅速擴(kuò)增。DNA模板變性:模板雙鏈DNA?單鏈DNA,94℃。退火:引物+單鏈DNA?雜交鏈,引物的Tm值。引物的延伸:溫度至70℃左右,TaqDNA聚合酶以4種dNTP為原料,以目的DNA為模板,催化以引物3’末端為起點(diǎn)的5’→3’DNA鏈延伸反應(yīng),形成新生DNA鏈。新合成的引物延伸鏈經(jīng)過(guò)變性后又可作為下一輪循環(huán)反應(yīng)的模板PCR,就是如此反復(fù)循環(huán),使目的DNA得到高效快速擴(kuò)增。江蘇什么是pcr實(shí)驗(yàn)室pcr檢測(cè)有哪些操作步驟?
PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的反向PCR(InversePCR)介紹:反向PCR起初設(shè)計(jì)用于確定臨近未知區(qū)域的序列。反向PCR有助于研究一個(gè)基因的啟動(dòng)子序列;致*染色體重排如基因融合、異位或轉(zhuǎn)移;及病毒基因的整合。之所以稱為反向PCR,是因?yàn)橐镌O(shè)計(jì)用于向兩邊延伸而不像常規(guī)PCR中朝著彼此延伸。如今,反向PCR常用于定點(diǎn)突變,復(fù)制一個(gè)具有預(yù)期突變的目的質(zhì)粒。在研究基因組DNA未知序列的傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)流程中,限制性內(nèi)切酶消化和連接先于反向PCR,接著對(duì)PCR擴(kuò)增子進(jìn)行測(cè)序。對(duì)于gDNA消化,需選擇一種限制性內(nèi)切酶進(jìn)行酶切以獲得合適長(zhǎng)度可自連的片段。同時(shí),所選擇的內(nèi)切酶不應(yīng)該切割已知序列,所以連接發(fā)生于側(cè)翼的未知序列之間。使用低濃度的酶切DNA的片段以助于片段自連而非多個(gè)片段連接。片段自連完成后,通過(guò)反向PCR擴(kuò)增DNA的位置區(qū)域。獲得的擴(kuò)增子兩端包含一部分已知序列。之后通過(guò)測(cè)序以鑒定臨近已知序列的未知區(qū)域。
PCR出現(xiàn)假陽(yáng)性的原因分析。引物設(shè)計(jì)不合適:選擇的擴(kuò)增序列與非目的擴(kuò)增序列有同源性,因而在進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí),擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現(xiàn)假陽(yáng)性。需重新設(shè)計(jì)引物。靶序列或擴(kuò)增產(chǎn)物的交叉污染:這種污染有兩種原因:一是整個(gè)基因組或大片段的交叉污染,導(dǎo)致假陽(yáng)性。這種假陽(yáng)性可用以下方法解決:①操作時(shí)應(yīng)小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣器內(nèi)或?yàn)R出離心管外。②除了酶及其他不耐高溫的物質(zhì)外,所有試劑或器材均應(yīng)高壓消毒。所用離心管均應(yīng)一次性使用。③必要時(shí),在加標(biāo)本前,反應(yīng)管和試劑用紫外線照射,以破壞存在的核酸。二是空氣中的小片段核酸污染,這些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,與引物互補(bǔ)后,可擴(kuò)增出PCR產(chǎn)物,而導(dǎo)致假陽(yáng)性的產(chǎn)生,可用巢式PCR方法來(lái)減輕或消除。pcr內(nèi)標(biāo)不出來(lái)的原因是什么?
PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的熱啟動(dòng)PCR介紹:熱啟動(dòng)PCR是除了好的引物設(shè)計(jì)之外,提高PCR特異性的重要的方法之一。盡管TaqDNA聚合酶的比較好延伸溫度在72℃,聚合酶在室溫仍然有活性。因此,在進(jìn)行PCR反應(yīng)配制過(guò)程中,以及在熱循環(huán)剛開(kāi)始,保溫溫度低于退火溫度時(shí)會(huì)產(chǎn)生非特異性的產(chǎn)物。這些非特異性產(chǎn)物一旦形成,就會(huì)被有效擴(kuò)增。在用于引物設(shè)計(jì)的位點(diǎn)因?yàn)檫z傳元件的定位而受限時(shí),如site-directed突變、表達(dá)克隆或用于DNA工程的遺傳元件的構(gòu)建和操作,熱啟動(dòng)PCR尤為有效。熒光定量PCR檢測(cè)原理是什么?貴州有哪些pcr檢測(cè)
英瀚斯生物,分子平臺(tái)實(shí)驗(yàn)人員十年以上經(jīng)驗(yàn),專業(yè)pcr檢測(cè)。山西高質(zhì)量pcr實(shí)驗(yàn)室
pcr是一種在體外擴(kuò)增特定DNA序列的技術(shù)方法,通過(guò)與特定DNA區(qū)域兩端互補(bǔ)的寡核苷酸為引物(primer)在試管中DNA聚合酶選擇性地單獨(dú)復(fù)制合成介于兩引物直接的基因片段,如同DNA復(fù)制中的半保留復(fù)制一樣,新合成的基因片段與模板鏈形成新的DNA雙鏈,經(jīng)反復(fù)的變性(denature)引物退火(anerling)和引物延伸(extention)三步循環(huán),前一循環(huán)合成的DNA鏈成為下一循環(huán)引物結(jié)合的模板,每循環(huán)一次,反應(yīng)體系的DNA的量就增加一倍,20-30次反復(fù)循環(huán),即可由微量的DNA模板開(kāi)始獲得大量的DNA特異片段。近年來(lái),PCR迅速發(fā)展,已深入生命科學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域,技術(shù)方法不端完善,基本的PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)主要有經(jīng)典PCR技術(shù)、RT-PCR技術(shù)、免疫-PCR技術(shù)、PCR-SSCP技術(shù)等。山西高質(zhì)量pcr實(shí)驗(yàn)室
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