江蘇對(duì)于代謝組學(xué)結(jié)果的分析

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-09-27

GC-MS代謝組學(xué)結(jié)果:通過GC-MS代謝組學(xué)觀察到 92種化合物,其中,49種與數(shù)據(jù)庫(kù)中可用的化合物相匹配,包括重要的發(fā)酵代謝物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和幾種 (n=10) 初級(jí)氨基酸。NMR也觀察到了七種已鑒定的化合物。通過 GC-MS 測(cè)量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸濃度隨溫度處理而變化,隨著溫度的升高,通常趨向于更高的糖濃度和更低的游離氨基酸濃度(圖 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一個(gè)明顯的例外,在濃度與溫度處理中觀察到了積極的趨勢(shì)(圖 3)。此外,與植物應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羥基-3-甲氧基苯甲酸)隨溫度升高而增加(SI 附錄,圖 S5)。代謝組學(xué)分析價(jià)格-歐易生物特色研究-多項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)-自有實(shí)驗(yàn)室代謝組學(xué)。江蘇對(duì)于代謝組學(xué)結(jié)果的分析

本研究通過LC-MS和GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)研究方法,對(duì)92例樣品5個(gè)時(shí)間點(diǎn)的尿液樣品進(jìn)行分析,分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關(guān)的差異標(biāo)志物,結(jié)果揭示了年輕健康人在五個(gè)不同時(shí)間點(diǎn)的尿液代謝譜的動(dòng)態(tài)變化,采用KEGG通路富集分析和時(shí)間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關(guān)的幾種潛在代謝物生物標(biāo)志物,發(fā)現(xiàn)短期高濃度暴露于PM可能會(huì)導(dǎo)致代謝改變并降低應(yīng)激***水平,這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質(zhì)軸的***有關(guān);而生物氣溶膠劑則通過***系統(tǒng)對(duì)病理性成癮有重要作用。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標(biāo)志物;4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標(biāo)志物,可用于分別預(yù)測(cè)或診斷PM或生物氣溶膠相關(guān)疾病。江蘇腸道菌群代謝組學(xué)代謝組學(xué) 生物標(biāo)志物挖掘**-歐易生物。

GC-MS非靶向代謝組學(xué)yan'j2021年11月,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院馮麗萍教授課題組在Science of the Total Environment期刊發(fā)表了題為“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of  Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通過GC-MS非靶向代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了BPF暴露的腸道毒性的特征,探究了可能的發(fā)病機(jī)理。

中文標(biāo)題:轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)合代謝組學(xué)揭示了雙酚F(BPF)暴露對(duì)腸道炎癥的影響研究對(duì)象:人結(jié)腸粘膜上皮細(xì)胞系(NCM460)發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:7.963發(fā)表時(shí)間:2021年11月合作單位:上海交通大學(xué)附屬新華醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù):GC-MS非靶向代謝組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、qRT-PCR

非靶向和靶向代謝組學(xué)研究方法,2021年7月,廣州多家研究機(jī)構(gòu)科研人員在EuropeanRespiratoryJournal期刊發(fā)表了題為“Metabolomicanalysesrevealsnewstage-specificfeaturesoftheCOVID-19”的研究成果,該研究以****患者為研究對(duì)象,運(yùn)用非靶向和靶向代謝組學(xué)研究方法,提供了****患者所有階段循環(huán)代謝物特征的綜合視圖,并確定糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重新編程是****的潛在病理機(jī)制;提出以宿主代謝為靶點(diǎn)可能是在病程不同階段對(duì)抗****的一種可行的方法。代謝組學(xué)-歐易生物/鹿明生物 客戶好評(píng) 專注代謝組學(xué)研究。

尿液代謝組學(xué)研究案例,空氣中PM和生物氣溶膠共同暴露的尿液代謝組學(xué)特征采用LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)方法對(duì)尿液樣品進(jìn)行分析,其中GC-MS檢測(cè)102種代謝物,LC-MS檢測(cè)到1271種。作者通過使用亞組來分析差異代謝物是否具有性別或季節(jié)性,結(jié)果表明性別和季節(jié)對(duì)本研究的結(jié)果沒有明顯的混雜影響。差異分析表明,Pu1和Po1之間的差異代謝物數(shù)量大于Po1和C之間的差異,LC-MS分析比GC-MS分析檢測(cè)到更多的差異代謝物,體現(xiàn)出不同平臺(tái)的檢測(cè)特點(diǎn)。為了確定尿液中與空氣污染PM暴露相關(guān)的代謝生物標(biāo)志物,使用綜合分析獲得候選差異代謝物,其中C-Po1和Po1-Pu1比較中的重疊差異代謝物作為短期PM暴露相關(guān)標(biāo)志物,確定了33種與短期暴露于空氣污染相關(guān)的差異代謝物,包括8種脂質(zhì)、6種核酸、7種氨基酸及其衍生物、3種葡萄糖和9種其他代謝物。KEGG通路分析表明,***富集到5種代謝通路,與免疫、炎癥、人類的環(huán)境壓力、缺血和缺氧有關(guān)。代謝組學(xué)暨多元變量統(tǒng)計(jì)分析研究。北京代謝組學(xué)中主成分分析

代謝組學(xué)——尋找代謝物與生理病理變化的相對(duì)關(guān)系研究方式。江蘇對(duì)于代謝組學(xué)結(jié)果的分析

非靶向代謝組學(xué)研究:通過在三個(gè)成熟階段收獲兩個(gè)東方甜瓜品種的果實(shí)作者使用非靶代謝組學(xué)聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)發(fā)現(xiàn)可溶性糖和有機(jī)酸在轉(zhuǎn)錄組水平和代謝組水平的差異現(xiàn)象。這項(xiàng)研究運(yùn)用多組學(xué)技術(shù)聯(lián)合揭示了兩個(gè)品種成熟過程中關(guān)鍵的代謝和轉(zhuǎn)錄特征。在本研究中,通過代謝和轉(zhuǎn)錄組分析的綜合分析,研究了控制兩個(gè)東方甜瓜品種'甜寶'和'小翠瓜'中糖和有機(jī)酸代謝的基因網(wǎng)絡(luò)。篩選了與糖和有機(jī)酸代謝相關(guān)的關(guān)鍵代謝物和候選基因,并討論了甜瓜品種甜度不同的可能解釋。研究結(jié)果提高了對(duì)決定甜瓜發(fā)育和成熟過程中糖和有機(jī)酸積累和代謝的分子機(jī)制的理解。江蘇對(duì)于代謝組學(xué)結(jié)果的分析

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