牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)是一種來源于牛痘病毒的I型真核拓?fù)洚悩?gòu)酶,具有以下功能和應(yīng)用:1.**功能**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以催化雙鏈DNA分子中單鏈DNA特定序列位置的磷酸二酯鍵的斷開和連接。-具有解超螺旋的酶(DNARelaxingEnzyme)活性,能夠通過快速的酶切和連接使雙鏈共價(jià)閉合環(huán)狀的正或負(fù)超螺旋DNA發(fā)生解超螺旋,形成含有較少的正或負(fù)超螺旋的雙鏈環(huán)狀DNA分子。-能夠使雙鏈DNA形成繩結(jié)(knotting)或解開繩結(jié)(unknotting),聯(lián)結(jié)互補(bǔ)的單鏈環(huán)狀DNA成為雙鏈環(huán)狀DNA。2.**應(yīng)用**:-作為一種DNA重組連接的新型工具酶,用于DNA載體和重組片段的連接、缺刻修復(fù)、接頭連接等。-適用于TOPO克隆載體的制備、NGS建庫中的接頭連接等。-在TOPO克隆技術(shù)中,DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I同時(shí)具有限制酶和連接酶特性,其生物學(xué)功能是在復(fù)制期間切割并重新連接DNA。3.**使用方法**:-用于DNA快速酶切流程,包括配制體系反應(yīng)液、輕柔混勻、37℃孵育15分鐘等步驟。4.**儲(chǔ)存條件**:-建議在-25~-15℃保存,有效期為3年。5.**注意事項(xiàng)**:-避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止酶失活。牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I因其獨(dú)特的功能,在分子生物學(xué)研究和基因工程中扮演著重要的角色??梢岳矛F(xiàn)有的計(jì)算工具,如CRISPR design tools,預(yù)測(cè)gRNA的活性和特異性,以輔助實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì) 。Recombinant Human DcR1/TRAILR3 Protein,His Tag
BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中都是常用的酶,但它們之間存在一些關(guān)鍵的不同點(diǎn):1.**來源和熱穩(wěn)定性**:-**TaqDNA聚合酶**來源于嗜熱菌Thermusaquaticus,具有很好的耐熱性,能夠承受PCR的熱變性步驟。-**BstDNA聚合酶**來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),同樣具有較高的熱穩(wěn)定性,適用于等溫?cái)U(kuò)增,如LAMP技術(shù),無需PCR熱循環(huán)。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,但沒有3'-5'外切酶活性。這意味著它在DNA合成過程中可以校正一些錯(cuò)誤,但保真性相對(duì)較低。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和強(qiáng)鏈置換活性,但缺乏5'-3'外切酶活性。這使得它在等溫?cái)U(kuò)增中更為有效,尤其是在需要高保真度和快速擴(kuò)增的應(yīng)用中。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技術(shù),適用于各種DNA片段的擴(kuò)增,包括復(fù)雜模板和長片段的擴(kuò)增。-**BstDNA聚合酶**特別適用于等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),如LAMP,這些技術(shù)不需要溫度循環(huán),適用于快速、低成本的DNA擴(kuò)增。4.**擴(kuò)增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等溫?cái)U(kuò)增中顯示出比傳統(tǒng)TaqDNA聚合酶更快的擴(kuò)增速度和更高的產(chǎn)量,尤其是在優(yōu)化的LAMP反應(yīng)中。
pA-MNase(蛋白A-微球菌核酸酶)在以下實(shí)驗(yàn)中特別有用:1.**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:這是一種用于研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用的技術(shù),pA-MNase在此技術(shù)中用于在免疫沉淀后切割染色質(zhì)DNA,以分析特定蛋白質(zhì)與DNA的結(jié)合位點(diǎn)。2.**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:這是一種蛋白質(zhì)-基因組互作研究技術(shù),pA-MNase在此技術(shù)中用于在目標(biāo)蛋白質(zhì)被抗體識(shí)別后,通過核酸酶活性切割附近的DNA,從而釋放與目標(biāo)蛋白質(zhì)相互作用的DNA片段。CUT&RUN技術(shù)相比傳統(tǒng)的ChIP-Seq具有實(shí)驗(yàn)周期短、信噪比高、可重復(fù)性好以及細(xì)胞投入量低的優(yōu)勢(shì),尤其適用于早期胚胎發(fā)育、干細(xì)胞、**以及表觀遺傳學(xué)等研究領(lǐng)域。3.**染色質(zhì)免疫沉淀實(shí)驗(yàn)**:pA-MNase在染色質(zhì)免疫沉淀實(shí)驗(yàn)中用于染色質(zhì)片段化,它在核小體間DNAlinker上進(jìn)行切割保持了核小體的完整性,并且由于其溫和的酶解條件,消除了超聲功率的可變性和超聲過程中染色質(zhì)乳化所帶來的負(fù)面影響。4.**去除核酸污染**:pA-MNase也可用于去除細(xì)胞裂解液中的核酸,以減少樣品的粘度,這對(duì)于后續(xù)的蛋白質(zhì)分析實(shí)驗(yàn)尤為重要。
一、靈敏度與特異性該試劑采用 SYBR Green I 熒光染料,這種染料能夠特異性地結(jié)合到雙鏈 DNA 上,當(dāng) DNA 在 PCR 過程中被擴(kuò)增時(shí),熒光信號(hào)也隨之增強(qiáng)。其靈敏度極高,即使在樣本中目標(biāo)基因的初始拷貝數(shù)極低的情況下,也能準(zhǔn)確地檢測(cè)到其擴(kuò)增信號(hào)。同時(shí),通過優(yōu)化的反應(yīng)體系,有效減少了非特異性擴(kuò)增的產(chǎn)生,確保了實(shí)驗(yàn)結(jié)果的特異性。例如,在對(duì)微量的病毒核酸進(jìn)行檢測(cè)時(shí),SYBR Green qPCR Mix (2×, High ROX, UDG Plus) 能夠識(shí)別并擴(kuò)增目標(biāo)病毒基因,避免了其他非病毒核酸的干擾,為病原體的早期診斷提供了有力支持。二、高濃度 ROX 參考染料,穩(wěn)定可靠qPCR 實(shí)驗(yàn)中,ROX 參考染料的作用不容小覷。SYBR Green qPCR Mix (2×, High ROX, UDG Plus) 中的高濃度 ROX 參考染料,能夠有效校正孔間熒光信號(hào)的差異,提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重復(fù)性和穩(wěn)定性。在多孔板實(shí)驗(yàn)中,不同孔之間的熒光信號(hào)可能會(huì)因儀器的微小差異、加樣量的不均勻等因素而產(chǎn)生波動(dòng)。高濃度的 ROX 參考染料如同一把標(biāo)尺,對(duì)這些波動(dòng)進(jìn)行校正,使得實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)更加準(zhǔn)確可靠。無論是單次實(shí)驗(yàn)還是大規(guī)模的樣本檢測(cè),都能保證結(jié)果的一致性,為科研數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析提供了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。Multiplex Probe qPCR Mix 是一種濃縮預(yù)混液,含有抗體技術(shù)修飾的熱啟動(dòng)酶Hotstart Taq DNA聚合酶。
在PCR產(chǎn)物的克隆中,Lambda核酸外切酶(λExonuclease)有其特定的應(yīng)用和優(yōu)勢(shì),但它不能完全替代其他酶。以下是一些替代酶和它們的特點(diǎn):1.**ExonucleaseIII(ExoIII)**:-ExoIII具有3'→5'外切脫氧核糖核酸酶活性,尤其適合雙鏈DNA的平末端、5'-突出末端或切口,從DNA鏈的3'-端釋放5'-單磷酸核苷酸,產(chǎn)生單鏈DNA片段。-與Lambda核酸外切酶相比,ExoIII對(duì)具有3'-突出末端的DNA有活性,而Lambda核酸外切酶則對(duì)5'-磷酸化的雙鏈DNA有更高的活性。2.**TaqDNA聚合酶**:-在平端克隆中,可以使用TaqDNA聚合酶和dATP進(jìn)行“3'dA加尾”,以提高連接效率。-這種方法通過在PCR產(chǎn)物的3'端添加突出的腺嘌呤(dA),增加了與載體連接的可能性,從而提高克隆效率。3.**TOPO克隆載體**:-TOPO克隆載體含有共價(jià)連接的DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I,可同時(shí)作為限制性內(nèi)切酶和連接酶。-與傳統(tǒng)PCR克隆載體相比,TOPO克隆載體具有更短的連接反應(yīng)時(shí)間、更高的克隆效率以及更簡(jiǎn)單的分子克隆實(shí)驗(yàn)方案。綜上所述,雖然Lambda核酸外切酶在特定情況下非常有用,但它不能完全替代其他酶。每種酶都有其獨(dú)特的特性和應(yīng)用場(chǎng)景,選擇合適的酶取決于具體的克隆需求和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。Recombinant Biotinylated Human MAGE-A3 (HLA-A*24:02) Protein, His-Avi Tag 是一種通過重組DNA技術(shù)。Recombinant Human FLRT1 Protein,His Tag
T4 DNA 聚合酶具有 5’→3’聚合酶活性,在模板及引物存在的條件下,能夠在結(jié)合有引物的單鏈 DNA 模板上。Recombinant Human DcR1/TRAILR3 Protein,His Tag
核酸內(nèi)切酶VIII(EndonucleaseVIII)和核酸內(nèi)切酶III(EndonucleaseIII)都是DNA修復(fù)酶,但它們之間存在一些關(guān)鍵的區(qū)別:1.**活性類型**:-**核酸內(nèi)切酶VIII**:具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。N-糖基化酶活性可以釋放受損的嘧啶堿基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,產(chǎn)生一個(gè)脫嘌呤(Apurinic,AP)位點(diǎn);AP裂解酶活性可以切割A(yù)P位點(diǎn)的3'和5'端,產(chǎn)生一個(gè)具有3'和5'磷酸的堿基缺口(Gap)。-**核酸內(nèi)切酶III**:主要具有β裂解酶(β-lyase)活性,能夠切割DNA磷二酯骨架在AP位點(diǎn)處,但不具備δ裂解酶(δ-lyase)活性。2.**識(shí)別和切除的受損堿基**:-**核酸內(nèi)切酶VIII**:可以識(shí)別并切除包括尿素、5,6-二羥基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羥基-5-甲內(nèi)酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羥基-5,6-二氫胸腺嘧啶和甲基羥丙二酰脲在內(nèi)的多種受損堿基。-**核酸內(nèi)切酶III**:主要識(shí)別和切除氧化性損傷的嘌呤堿基,如8-氧鳥嘌呤。3.**裂解酶活性**:-**核酸內(nèi)切酶VIII**:具有β和δ裂解酶活性,而**核酸內(nèi)切酶III**具有β裂解酶活性。這些區(qū)別決定了它們?cè)贒NA損傷修復(fù)中的作用和應(yīng)用范圍。