上海地區(qū)多重PCR高通量測(cè)序高通量

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-10

為什么要用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)?細(xì)胞是生物體結(jié)構(gòu)和功能的基本單位,在生物體生長(zhǎng)發(fā)育的過(guò)程中,因細(xì)胞類型、外界環(huán)境以及內(nèi)部調(diào)節(jié)因素的不同,其轉(zhuǎn)錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程,以及在細(xì)胞分裂和分化過(guò)程中出現(xiàn)的誤差造成來(lái)自同一細(xì)胞系或個(gè)體的細(xì)胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細(xì)胞異質(zhì)性。細(xì)胞異質(zhì)性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測(cè)序檢測(cè)的是一個(gè)細(xì)胞群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組的信息,如培養(yǎng)的大量細(xì)胞、動(dòng)植物組織甚至是整個(gè)生物體。在過(guò)去的20多年中,人們對(duì)轉(zhuǎn)錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),卻無(wú)法揭示細(xì)胞的異質(zhì)性。傳統(tǒng)方法得到的是細(xì)胞群的平均基因組,而單細(xì)胞測(cè)序測(cè)量的是細(xì)胞群中單個(gè)細(xì)胞的基因組[7]?,F(xiàn)在也有學(xué)者為了區(qū)分傳統(tǒng)測(cè)序和單細(xì)胞測(cè)序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱為批量測(cè)序。ChIP項(xiàng)目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0檢測(cè)為準(zhǔn)。其余具體咨詢生工高通量測(cè)序部。上海地區(qū)多重PCR高通量測(cè)序高通量

全基因組測(cè)序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測(cè)序,其研究主要包括3個(gè)方面:第一種為不參考任何現(xiàn)有序列從頭組裝測(cè)序,是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行基因組測(cè)序,并綜合利用不同測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)工具對(duì)研究物種進(jìn)行序列拼接和修正,進(jìn)而獲得該物種的基因組序列圖譜;第二種為常見的全基因組重測(cè)序,是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體或群體的測(cè)序研究,建立一個(gè)測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行單個(gè)個(gè)體或不同個(gè)體混合池測(cè)序,發(fā)現(xiàn)遺傳變異標(biāo)記,進(jìn)行后續(xù)的研究;第三種是在已有參考基因組序列圖譜的基礎(chǔ)上,對(duì)不同品種的具有代表性個(gè)體建立多個(gè)文庫(kù)進(jìn)行全基因組從頭組裝測(cè)序,此方法能夠進(jìn)一步的進(jìn)行參考基因組的修補(bǔ)和發(fā)現(xiàn)短序列比對(duì)難以發(fā)現(xiàn)的遺傳變異。生工生物擁有眾多生物信息分析人才,可進(jìn)行專業(yè)的項(xiàng)目分析,為客戶提供個(gè)性化服務(wù)。上海單細(xì)胞測(cè)序高通量測(cè)序原理為什么要用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)?

高通量測(cè)序技術(shù)是可以平行對(duì)數(shù)百萬(wàn)甚至數(shù)十億條序列測(cè)序的技術(shù)。在基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、宏基因組測(cè)序、表觀遺傳測(cè)序、外顯子捕獲測(cè)序、靶區(qū)域測(cè)序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測(cè)領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運(yùn)用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量測(cè)序部以來(lái),逐步引進(jìn)了Illumina,Life,PacBio等二代/三代測(cè)序平臺(tái)。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室(通過(guò)了國(guó)家ISO認(rèn)證)以及10PB級(jí)運(yùn)算能力的服務(wù)器集群,能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時(shí),生工高通量測(cè)序團(tuán)隊(duì)建設(shè)也在不斷完善中,目前有50余專職員工,其中高級(jí)技術(shù)人員以及高級(jí)生物信息工程師占比50%以上,5年來(lái),通過(guò)生工高通量測(cè)序結(jié)果發(fā)表的文章累計(jì)影響因子超過(guò)1000分以上。

全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(Total RNA-Seq),項(xiàng)目介紹:全轉(zhuǎn)錄組是指特定細(xì)胞在特定狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA(non-coding RNA)。針對(duì)非編碼RNA的研究主要集中在具有調(diào)控作用的miRNA,lncRNA和circRNA?;诙鷾y(cè)序技術(shù)的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究,同時(shí)分析同一樣本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA,并且通過(guò)關(guān)聯(lián)分析,使研究?jī)?nèi)容更加系統(tǒng)化,致力于深入挖掘生命現(xiàn)象背后的轉(zhuǎn)錄調(diào)控問(wèn)題。組織樣品或者總 RNA, 樣品名稱清晰,干冰運(yùn)輸。使用足量的干冰運(yùn)輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運(yùn)輸過(guò)程中樣品降解的可能性。

如果你的樣品是質(zhì)?;蛘呤蔷海菫槭裁床辉囋囄覀兊腒BSeq呢?準(zhǔn)確、迅速,可以說(shuō)是KBSeq的代名詞了,關(guān)鍵是還可以省錢,估計(jì)這是很多小伙伴們一定會(huì)說(shuō),你這個(gè)服務(wù)單價(jià)可比Sanger貴多了,怎么可能會(huì)省錢呢?Sanger測(cè)序的價(jià)格:常規(guī)的一代測(cè)序基本上要每800 bp就測(cè)一個(gè)反應(yīng),那我們來(lái)算一下14000/800=17.5,那基本上就要測(cè)18個(gè)反應(yīng)了,按照現(xiàn)在生工官方的價(jià)格區(qū)間,這個(gè)屬于反應(yīng)數(shù)在10-49個(gè)反應(yīng)之間的,那每個(gè)反應(yīng)的價(jià)格為26元,這樣算下來(lái)18*26=468元,還要加上引物合成的費(fèi)用,實(shí)驗(yàn)周期的話大概率是要超過(guò)15天的。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序的價(jià)格:序列長(zhǎng)度屬于6-15 kb之間,159元,實(shí)驗(yàn)的周期大概在5-7天左右。于微生物樣品,請(qǐng)客戶如實(shí)聲明所屬物種,對(duì)于可能致病的微生物,生工保留拒收的權(quán)利。上海市靶向捕獲高通量測(cè)序技術(shù)

Life Ion torrentPGM 運(yùn)行314、316、318芯片,可以承接擴(kuò)增子測(cè)序、靶區(qū)域測(cè)序、基因組重測(cè)序服務(wù)。上海地區(qū)多重PCR高通量測(cè)序高通量

2021年11月1日,在這個(gè)平凡而又特殊的日子里,生工生物高通量測(cè)序部迎來(lái)了一位新成員——10xGenomics Chromium X!不要看我們個(gè)頭小,我們可是百萬(wàn)級(jí)單細(xì)胞捕獲神器吆。X是如何實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行有這么高的吞吐量呢?多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個(gè)通道(Controller為8通道),每個(gè)通道比較多捕獲20000個(gè)細(xì)胞(Controller為10000個(gè)細(xì)胞)。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù),每個(gè)通道比較多可捕獲60,000個(gè)細(xì)胞,去除雙細(xì)胞率后,每張芯片比較多可捕獲750,000個(gè)單細(xì)胞。上海地區(qū)多重PCR高通量測(cè)序高通量

生工生物工程(上海)股份有限公司是一家研發(fā)、生產(chǎn)化學(xué)試劑、生化試劑、生物試劑、耗材、小型儀器及生物工程相關(guān)產(chǎn)品(以上經(jīng)營(yíng)涉及位險(xiǎn)化學(xué)品的只有分裝業(yè)務(wù)),銷售公司自產(chǎn)產(chǎn)品并提供售后技術(shù)服務(wù);從事上述產(chǎn)品的同類商品(危險(xiǎn)化學(xué)品限許可證規(guī)定范圍)的進(jìn)出口、批發(fā)、傭金代理(拍實(shí)除外)及相關(guān)配套服務(wù);提供生物工程技術(shù)服務(wù)、技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢。:提供倉(cāng)儲(chǔ)業(yè)務(wù)。 【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目。經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠(chéng)實(shí)可信的企業(yè)。生工生物作為醫(yī)藥健康的企業(yè)之一,為客戶提供良好的生化試劑,實(shí)驗(yàn)耗材,實(shí)驗(yàn)試劑,研發(fā)。生工生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長(zhǎng),又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。生工生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場(chǎng)需求,提高產(chǎn)品價(jià)值,是我們前行的力量。

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