上海地區(qū)全質(zhì)粒測序高通量測序測序

來源: 發(fā)布時間:2022-08-12

IlluminaHiSeq2500/4000可以運行PE150/PE250模式,可以承擔(dān)轉(zhuǎn)錄組測序、人基因組重測序、外顯子捕獲測序、宏基因組測序、微生物分類測序等服務(wù);IlluminaMiSeq運行PE300模式,可以承擔(dān)細(xì)菌基因組重測序/Denovo測序、微生物分類測序、擴增子測序、核酸適配體測序等服務(wù);LifeIontorrentPGM運行314、316、318芯片,可以承接擴增子測序、靶區(qū)域測序、基因組重測序服務(wù);PacBioSequel/RSII該測序平臺讀長超長,平均可達10kb以上,主要承接細(xì)菌基因組完成圖測序、***基因組精細(xì)圖測序、全長轉(zhuǎn)錄本測序等服務(wù);ChIP項目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0檢測為準(zhǔn)。其余具體咨詢生工高通量測序部。上海地區(qū)全質(zhì)粒測序高通量測序測序

高通量測序技術(shù)是可以平行對數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術(shù)。在基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、宏基因組測序、表觀遺傳測序、外顯子捕獲測序、靶區(qū)域測序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量測序部以來,逐步引進了Illumina,Life,PacBio等二代/三代測序平臺。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實驗室(通過了國家ISO認(rèn)證)以及10PB級運算能力的服務(wù)器集群,能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時,生工高通量測序團隊建設(shè)也在不斷完善中,目前有50余專職員工,其中高級技術(shù)人員以及高級生物信息工程師占比50%以上,5年來,通過生工高通量測序結(jié)果發(fā)表的文章累計影響因子超過1000分以上。高通量測序公司一臺10xGenomics Chromium X儀器能夠在單次運行中分析數(shù)百至數(shù)十萬個細(xì)胞,讓百萬級的細(xì)胞研究變得常規(guī)。

small RNA測序,項目簡介:Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,長度在18-30 nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導(dǎo)基因沉默,參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞生長、分化,以及個體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過程。高通量測序技術(shù)可以對樣本中所有small RNA家族進行測序和表達定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應(yīng)靶序列。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后,進行Clean reads 長度分布統(tǒng)計,small RNA注釋,已知 miRNA 注釋,已知piRNA注釋,ncRNA分析,新 miRNA 預(yù)測(有參考基因組),差異基因可視化分析,miRNA 家族分析,差異表達 miRNA 聚類分析,miRNA靶基因預(yù)測,靶基因GO、KEGG富集分析。

2021年11月1日,在這個平凡而又特殊的日子里,生工生物高通量測序部迎來了一位新成員——10xGenomics Chromium X!不要看我們個頭小,我們可是百萬級單細(xì)胞捕獲神器吆。X是如何實現(xiàn)單次運行有這么高的吞吐量呢?多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個通道(Controller為8通道),每個通道比較多捕獲20000個細(xì)胞(Controller為10000個細(xì)胞)。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù),每個通道比較多可捕獲60,000個細(xì)胞,去除雙細(xì)胞率后,每張芯片比較多可捕獲750,000個單細(xì)胞。小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒。

細(xì)胞質(zhì)檢時染料染色的原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜,故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高,可使染料進入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍色。AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一種小分子染料,可以通過完整的細(xì)胞膜,嵌入所有細(xì)胞(活細(xì)胞和死細(xì)胞)的細(xì)胞核,呈現(xiàn)綠色熒光;碘化丙啶(PI)只能通過不完整的細(xì)胞膜,即死細(xì)胞的細(xì)胞膜,嵌入所有死細(xì)胞的細(xì)胞核,呈現(xiàn)紅色熒光,通過標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細(xì)胞和死細(xì)胞,這種特異性染色的方法也可以排除無核細(xì)胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。生工生物已開展10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-seq)服務(wù),如果正好您有需要,那就快快來call我們吧!上海地區(qū)ITS高通量測序測序

請注意選擇無RNA酶的容器盛放樣本,盡量避免RNA降解。上海地區(qū)全質(zhì)粒測序高通量測序測序

生工優(yōu)勢:1.生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗,日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細(xì)胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。2.生物信息分析經(jīng)驗豐富,可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報告模板為準(zhǔn)),全部無費用。3.生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目。一站式解決問題。上海地區(qū)全質(zhì)粒測序高通量測序測序

生工生物工程(上海)股份有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家生產(chǎn)型公司。生工生物致力于為客戶提供良好的生化試劑,實驗耗材,實驗試劑,研發(fā),一切以用戶需求為中心,深受廣大客戶的歡迎。公司秉持誠信為本的經(jīng)營理念,在醫(yī)藥健康深耕多年,以技術(shù)為先導(dǎo),以自主產(chǎn)品為重點,發(fā)揮人才優(yōu)勢,打造醫(yī)藥健康良好品牌。生工生物立足于全國市場,依托強大的研發(fā)實力,融合前沿的技術(shù)理念,及時響應(yīng)客戶的需求。

標(biāo)簽: 高通量測序