ITS高通量測(cè)序NGS

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-15

生工高通量測(cè)序樣品要求,環(huán)境樣品:如果是新鮮土壤/污泥樣品,可以以冰袋運(yùn)輸,不超過(guò)3天;如果是凍存過(guò)的樣品(-20°C或者-80°C冰箱保存),為避免反復(fù)凍融,建議用足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗(yàn),在秋冬季節(jié),如果打包合適,3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時(shí))寄送;如果是水體樣品,建議采用濾膜過(guò)濾后,將濾膜寄送來(lái)生工。生工不負(fù)責(zé)過(guò)濾。要求濾膜3張,冰袋運(yùn)輸,不超過(guò)3天。其余特殊環(huán)境樣品,具體咨詢生工高通量測(cè)序部。

DNA樣品:請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運(yùn)輸,不超過(guò)3天。 準(zhǔn)確、迅速,可以說(shuō)是KBSeq的代名詞了。ITS高通量測(cè)序NGS

生工人、大、小鼠全基因組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:人或者大、小鼠全部基因組重測(cè)序,研究其突變信息(包括SNP/InDel/CNV/SV),并注釋突變位點(diǎn)信息。該技術(shù)可同時(shí)獲取編碼區(qū)及非編碼區(qū)突變信息,被廣泛應(yīng)用于遺傳病、tumour及其它其它疾病研究中。測(cè)序平臺(tái):HiSeq XTen平臺(tái)進(jìn)行PE150測(cè)序。生工微生物基因組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:微生物基因組重測(cè)序(有參)目前越來(lái)越多的微生物基因組被解析出來(lái)了。從而使得科研工作者們可以對(duì)某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)有參考基因組微生物進(jìn)行多個(gè)體的基因組重測(cè)序,精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。上海SNP高通量測(cè)序高通量關(guān)鍵是KBSeq還可以省錢。

真核/原核有參mRNA-Seq,項(xiàng)目介紹:轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)廣義上指某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的gather,狹義上指所有mRNA的gather。轉(zhuǎn)錄組是研究基因表達(dá)的主要手段,是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是生物體重要的調(diào)控方式,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控,是目前運(yùn)用較多的研究方式。測(cè)序使用Illumina Xten平臺(tái),測(cè)序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)質(zhì)控后,mapping至參考基因組序列,對(duì)mapping到基因上的reads進(jìn)行計(jì)數(shù),計(jì)算基因的表達(dá)量后,進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對(duì)于多個(gè)樣本,可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外,依據(jù)參考基因組,可進(jìn)行諸如基因覆蓋度、測(cè)序飽和度等驗(yàn)證性分析;可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析等分析。另外,還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析,深入研究基因功能,進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息,為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。

長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)測(cè)序(只限有參考基因組物種),項(xiàng)目介紹:長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一類轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度大于200 nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各種生物體內(nèi)。哺乳動(dòng)物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是LncRNA(相應(yīng)的蛋白編碼RNA比例是1%)。近年來(lái)研究表明,LncRNA參與了多種重要的調(diào)控過(guò)程,如X染色體沉默、基因組印記及染色質(zhì)修飾等。通過(guò)LncRNA測(cè)序,可以快速獲得與其生物學(xué)過(guò)程或者疾病相關(guān)的LncRNA的表達(dá)變化,從而促進(jìn)LncRNA的深入研究。生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報(bào)告模板為準(zhǔn)),全部無(wú)費(fèi)用。

核酸適配體測(cè)序,項(xiàng)目介紹:核酸適配體是一類能夠特異性地和靶物質(zhì)結(jié)合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白質(zhì)、金屬離子、小分子化合物、細(xì)胞膜表面受體等靶標(biāo)。其結(jié)合能力可與抗體相當(dāng)甚至更強(qiáng),同時(shí)具有低免疫原性、 穩(wěn)定性好等特點(diǎn),并可結(jié)合各種藥物及載體構(gòu)建多元復(fù)合靶向給藥系統(tǒng)用于tumour靶向treat, 在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域有潛在高價(jià)值。生工生物針對(duì)核酸適配體特殊結(jié)構(gòu),結(jié)合Illumina MiSeq測(cè)序平臺(tái),可以快速對(duì)核酸適配體文庫(kù)進(jìn)行大規(guī)模高通量測(cè)序,省去克隆測(cè)序的麻煩,提高測(cè)序深度,快速計(jì)算適配體序列頻率,方便科研客戶快速評(píng)估序列富集程度。DNA樣品建議用藍(lán)冰運(yùn)輸。上海SNP高通量測(cè)序高通量

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序指在單細(xì)胞水平上對(duì) mRNA 進(jìn)行高通量測(cè)序和分析的技術(shù)。ITS高通量測(cè)序NGS

對(duì)于用RNA組織保存液寄送的樣品,請(qǐng)按照RNA組織保存液說(shuō)明保存和寄送。請(qǐng)注意:1)樣品浸入組織保存液之前,對(duì)于動(dòng)物組織樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.5cm的碎塊;對(duì)于植物樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.3cm的碎塊。2)鼠肝、腎和脾等小organ樣品和沒(méi)有蠟質(zhì)保護(hù)層的植物樣品可不剪切直接放入保存液中保存,有蠟質(zhì)保護(hù)層的植物樣品需要先將蠟表皮破壞。3)確保將樣品完全浸泡在保存液中,不讓其粘貼在管壁和蓋上。ITS高通量測(cè)序NGS

生工生物工程(上海)股份有限公司致力于醫(yī)藥健康,以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)高質(zhì)量管理的追求。公司自創(chuàng)立以來(lái),投身于生化試劑,實(shí)驗(yàn)耗材,實(shí)驗(yàn)試劑,研發(fā),是醫(yī)藥健康的主力軍。生工生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對(duì)用戶產(chǎn)品上的貼心,為用戶帶來(lái)良好體驗(yàn)。生工生物創(chuàng)始人王啟松,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠(chéng)為客戶提供良好的服務(wù)。

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