RNA樣品:1.請務(wù)必提供每個樣品具體的濃度、體積、制備時間以及物種來源。比較好附上電泳膠圖或者 Agilent Bioanalyzer 儀器檢測數(shù)據(jù)等;2.對于普通轉(zhuǎn)錄組樣品,請?zhí)峁舛取?00 ng/μl、總量≥2 μg 的總 RNA 樣品,樣品請去蛋白并進(jìn)行 DNase處理;一般情況下,普通轉(zhuǎn)錄組測序需要 RNA 樣品的 OD260/OD280為 2.0~2.2,Agilent Bioanalyzer 2100 器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥8;對于全長轉(zhuǎn)錄組測序樣品(ISO-seq),請?zhí)峁舛却笥?00 ng/ul,總量大于5 μg的總RNA樣品。樣品請去蛋白并進(jìn)行 DNase 處理;全長轉(zhuǎn)錄組測序需要 RNA 樣品的 OD260/OD280 為 2.0~2.2,2.3Agilent Bioanalyzer 2100 器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥8.5;生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗,日均處理樣品200余例。上海SNP高通量測序應(yīng)用
生工人、大、小鼠全基因組測序,項目介紹:人或者大、小鼠全部基因組重測序,研究其突變信息(包括SNP/InDel/CNV/SV),并注釋突變位點(diǎn)信息。該技術(shù)可同時獲取編碼區(qū)及非編碼區(qū)突變信息,被廣泛應(yīng)用于遺傳病、tumour及其它其它疾病研究中。測序平臺:HiSeq XTen平臺進(jìn)行PE150測序。生工微生物基因組測序,項目介紹:微生物基因組重測序(有參)目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術(shù),對有參考基因組微生物進(jìn)行多個體的基因組重測序,精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。有參轉(zhuǎn)錄組高通量測序服務(wù)10xGenomics Chromium X多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。
轉(zhuǎn)錄組測序,項目介紹:RNA-Seq,是基于新一代測序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法:首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的 RNA 并進(jìn)行 mRNA 富集,然后反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后進(jìn)行新一代高通量測序,在此基礎(chǔ)上進(jìn)行短片段拼接組裝,從而獲得一個個單獨(dú)轉(zhuǎn)錄本,進(jìn)而可以對該生物樣品當(dāng)前狀態(tài)的基因表達(dá)狀況有全局了解。對不同階段或部位生物樣品的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行 比較分析,則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達(dá)水平的變化,針對關(guān)鍵基因則可以進(jìn)行代謝通路(Pathway)的構(gòu)建。
RNA類高通量測序樣品要求:對于需要進(jìn)行 RNA 抽提的樣品,請使用新鮮取樣的實(shí)驗材料,當(dāng)場分成小塊(動物樣品厚度需小于0.5 cm,植物樣品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗,在秋冬季節(jié),如果打包合適,5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時,而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些)中用保溫箱寄送。一般組織樣品,送樣量至少200 mg/樣;如果樣品屬于孢子,送樣量至少500 mg/樣。生物信息分析經(jīng)驗豐富,可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。
生工外顯子測序,項目介紹:已知人類基因組上有180000個外顯子,占整個基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負(fù)責(zé)編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復(fù)雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測 序,全外顯子捕獲測序有測序深度高、價格便宜的優(yōu)勢,性價比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測序平臺進(jìn)行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測,形成完整的分析報告。生工生物已開展10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-seq)服務(wù),如果正好您有需要,那就快快來call我們吧!上海轉(zhuǎn)錄組高通量測序項目
RNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子。上海SNP高通量測序應(yīng)用
真核/原核有參mRNA-Seq,項目介紹:轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)廣義上指某一生理條件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的gather,狹義上指所有mRNA的gather。轉(zhuǎn)錄組是研究基因表達(dá)的主要手段,是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是生物體重要的調(diào)控方式,通過轉(zhuǎn)錄組測序分析轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控,是目前運(yùn)用較多的研究方式。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)控后,mapping至參考基因組序列,對mapping到基因上的reads進(jìn)行計數(shù),計算基因的表達(dá)量后,進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對于多個樣本,可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外,依據(jù)參考基因組,可進(jìn)行諸如基因覆蓋度、測序飽和度等驗證性分析;可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析等分析。另外,還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析,深入研究基因功能,進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息,為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。上海SNP高通量測序應(yīng)用
生工生物工程(上海)股份有限公司是一家研發(fā)、生產(chǎn)化學(xué)試劑、生化試劑、生物試劑、耗材、小型儀器及生物工程相關(guān)產(chǎn)品(以上經(jīng)營涉及位險化學(xué)品的只有分裝業(yè)務(wù)),銷售公司自產(chǎn)產(chǎn)品并提供售后技術(shù)服務(wù);從事上述產(chǎn)品的同類商品(危險化學(xué)品限許可證規(guī)定范圍)的進(jìn)出口、批發(fā)、傭金代理(拍實(shí)除外)及相關(guān)配套服務(wù);提供生物工程技術(shù)服務(wù)、技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢。:提供倉儲業(yè)務(wù)。 【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目。經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的公司,是一家集研發(fā)、設(shè)計、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。生工生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)?,為客戶提供高質(zhì)量的生化試劑,實(shí)驗耗材,實(shí)驗試劑,研發(fā)。生工生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心,為用戶帶來良好體驗。生工生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實(shí)現(xiàn)與客戶的成長共贏。