IlluminaHiSeq2500/4000可以運行PE150/PE250模式,可以承擔轉錄組測序、人基因組重測序、外顯子捕獲測序、宏基因組測序、微生物分類測序等服務;IlluminaMiSeq運行PE300模式,可以承擔細菌基因組重測序/Denovo測序、微生物分類測序、擴增子測序、核酸適配體測序等服務;LifeIontorrentPGM運行314、316、318芯片,可以承接擴增子測序、靶區(qū)域測序、基因組重測序服務;PacBioSequel/RSII該測序平臺讀長超長,平均可達10kb以上,主要承接細菌基因組完成圖測序、***基因組精細圖測序、全長轉錄本測序等服務;小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒。上海市轉錄組高通量測序平臺
單細胞測序是什么?單細胞測序是基于高通量測序(Next-generationsequencingtechnology,NGS)方法,檢測群體中單細胞基因組、單細胞轉錄組、單細胞表觀基因組及單細胞蛋白組,提供細胞間差異的高分辨率視圖,從分子水平揭示細胞奧秘。單細胞轉錄組測序(Single-cellRNA-Sequencing,ScRNA-Seq)指在單細胞水平上對mRNA進行高通量測序和分析的技術。單細胞轉錄組測序能獲得單個細胞內近萬個基因的表達信息,為辨別生物組織中各種細胞類型的轉錄組特征和全方面揭示細胞之間基因表達的異質性提供了有力的工具[3]。說到細胞異質性(Cellheterogeneity),就要說到我們?yōu)槭裁匆脝渭毎麥y序技術了。上海地區(qū)基因組高通量測序技術如果你的樣品是質?;蛘呤蔷?,那為什么不試試我們的KBSeq呢?
為什么要用單細胞測序技術?細胞是生物體結構和功能的基本單位,在生物體生長發(fā)育的過程中,因細胞類型、外界環(huán)境以及內部調節(jié)因素的不同,其轉錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程,以及在細胞分裂和分化過程中出現(xiàn)的誤差造成來自同一細胞系或個體的細胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細胞異質性。細胞異質性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測序檢測的是一個細胞群體的基因組、轉錄組的信息,如培養(yǎng)的大量細胞、動植物組織甚至是整個生物體。在過去的20多年中,人們對轉錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉錄組數(shù)據(jù),卻無法揭示細胞的異質性。傳統(tǒng)方法得到的是細胞群的平均基因組,而單細胞測序測量的是細胞群中單個細胞的基因組[7]?,F(xiàn)在也有學者為了區(qū)分傳統(tǒng)測序和單細胞測序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱為批量測序。
高通量測序技術是可以平行對數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術。在基因組測序、轉錄組測序、宏基因組測序、表觀遺傳測序、外顯子捕獲測序、靶區(qū)域測序等諸多科研及精細醫(yī)療檢測領域內有普遍的運用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量測序部以來,逐步引進了Illumina,Life,PacBio等二代/三代測序平臺。建立了2000m2高標準實驗室(通過了國家ISO認證)以及10PB級運算能力的服務器集群,能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時,生工高通量測序團隊建設也在不斷完善中,目前有50余專職員工,其中高級技術人員以及高級生物信息工程師占比50%以上,5年來,通過生工高通量測序結果發(fā)表的文章累計影響因子超過1000分以上。請注意選擇無RNA酶的容器盛放樣本,盡量避免RNA降解。
生工人、大、小鼠全基因組測序,項目介紹:人或者大、小鼠全部基因組重測序,研究其突變信息(包括SNP/InDel/CNV/SV),并注釋突變位點信息。該技術可同時獲取編碼區(qū)及非編碼區(qū)突變信息,被廣泛應用于遺傳病、tumour及其它其它疾病研究中。測序平臺:HiSeq XTen平臺進行PE150測序。生工微生物基因組測序,項目介紹:微生物基因組重測序(有參)目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進行進行物種進化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術,對有參考基因組微生物進行多個體的基因組重測序,精細分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。X儀器本身有16個通道(Controller為8通道),每個通道極限多捕獲20000個細胞(Controller為10000個細胞) 。上海宏全基因組高通量測序公司
近年來,隨著高通量測序技術的發(fā)展和普及,單細胞測序技術發(fā)展十分迅速。上海市轉錄組高通量測序平臺
真核/原核無參mRNA-Seq,項目介紹;測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)質控后進行拼接,并進一步對拼接所得轉錄本進行功能注釋、CDD、CDS分析,SNP分析,SSR標記開發(fā)等分析。在計算基因的表達量后,進行基因表達差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對于多個樣本,可進行重復相關性檢查、共表達分析、PCA主成分分析。另外,還可以進行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡互作等分析,深入研究基因功能,進一步揭示基因間互作網(wǎng)絡等信息,為研究網(wǎng)絡調控機理提供方向。 上海市轉錄組高通量測序平臺
生工生物工程(上海)股份有限公司是一家研發(fā)、生產化學試劑、生化試劑、生物試劑、耗材、小型儀器及生物工程相關產品(以上經營涉及位險化學品的只有分裝業(yè)務),銷售公司自產產品并提供售后技術服務;從事上述產品的同類商品(危險化學品限許可證規(guī)定范圍)的進出口、批發(fā)、傭金代理(拍實除外)及相關配套服務;提供生物工程技術服務、技術開發(fā)、技術咨詢。:提供倉儲業(yè)務。 【依法須經批準的項目。經相關部門批準后方可開展經營活動】的公司,是一家集研發(fā)、設計、生產和銷售為一體的專業(yè)化公司。生工生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向導,為客戶提供高質量的生化試劑,實驗耗材,實驗試劑,研發(fā)。生工生物致力于把技術上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產品上的貼心,為用戶帶來良好體驗。生工生物始終關注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實現(xiàn)與客戶的成長共贏。