生工高通量測序樣品要求,RNA樣品:請?zhí)峁舛取?50 ng/μl、總量≥2μg的總RNA樣品,樣品請去蛋白并進(jìn)行DNase處理;請務(wù)必提供每個樣品具體的濃度、體積、制備時間以及物種來源。比較好附上QC數(shù)據(jù),可以是電泳膠圖、分光光度值、Nanodrop儀器檢測數(shù)據(jù)或者Agilent Bioanalyzer儀器檢測數(shù)據(jù)等;一般情況下,轉(zhuǎn)錄組測序需要Agilent Bioanalyzer儀器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥7;小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒,可選擇傳統(tǒng)總RNA提取法(如乙醇沉淀、異丙醇沉淀等)或者選用專門的小RNA提取試劑盒;寄送RNA樣品請置于1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Parafilm封口。在運輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中,再將50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰運輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。截止目前為止,生工生物可是為數(shù)不多的同時擁有ChromiumController和ChromiumX平臺的公司。上海地區(qū)16s高通量測序技術(shù)
單細(xì)胞測序是什么?單細(xì)胞測序是基于高通量測序(Next-generationsequencingtechnology,NGS)方法,檢測群體中單細(xì)胞基因組、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞表觀基因組及單細(xì)胞蛋白組,提供細(xì)胞間差異的高分辨率視圖,從分子水平揭示細(xì)胞奧秘。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序(Single-cellRNA-Sequencing,ScRNA-Seq)指在單細(xì)胞水平上對mRNA進(jìn)行高通量測序和分析的技術(shù)。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序能獲得單個細(xì)胞內(nèi)近萬個基因的表達(dá)信息,為辨別生物組織中各種細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組特征和全方面揭示細(xì)胞之間基因表達(dá)的異質(zhì)性提供了有力的工具[3]。說到細(xì)胞異質(zhì)性(Cellheterogeneity),就要說到我們?yōu)槭裁匆脝渭?xì)胞測序技術(shù)了。上海地區(qū)16s高通量測序技術(shù)生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗,日均處理樣品200余例。
單細(xì)胞懸液質(zhì)檢方法,在進(jìn)行單細(xì)胞懸液質(zhì)檢時,需要用到以下兩大質(zhì)檢利器的輔助:熒光細(xì)胞計數(shù)儀(主要使用臺盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色法)進(jìn)行質(zhì)檢。首先我們先要了解一下細(xì)胞質(zhì)檢時染料染色的原理:臺盼藍(lán)染色原理:臺盼藍(lán)不能透過活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜,故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高,可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。熒光細(xì)胞計數(shù)儀檢測結(jié)果可以讓我們直觀的看到:細(xì)胞濃度(總細(xì)胞,活細(xì)胞,死細(xì)胞)、細(xì)胞存活率(臺盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色)、細(xì)胞平均直徑、細(xì)胞聚團(tuán)率、細(xì)胞直徑分布等結(jié)果的展示。
高通量測序技術(shù)是可以平行對數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術(shù)。在基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、宏基因組測序、表觀遺傳測序、外顯子捕獲測序、靶區(qū)域測序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量測序部以來,逐步引進(jìn)了Illumina,Life,PacBio等二代/三代測序平臺。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實驗室(通過了國家ISO認(rèn)證)以及10PB級運算能力的服務(wù)器集群,能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時,生工高通量測序團(tuán)隊建設(shè)也在不斷完善中,目前有50余專職員工,其中高級技術(shù)人員以及高級生物信息工程師占比50%以上,5年來,通過生工高通量測序結(jié)果發(fā)表的文章累計影響因子超過1000分以上。請注意選擇無RNA酶的容器盛放樣本,盡量避免RNA降解。
微生物基因組重測序(有參):目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術(shù),對有參考基因組微生物進(jìn)行多個體的基因組重測序,精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。微生物基因組從頭測序(無參):對于不斷分離培養(yǎng)微生物的客戶來說,要確定一個菌株是否是新菌株或者新菌種,較快捷的辦法就是,直接進(jìn)行基因組測序。利用高通量測序技術(shù),對這些基因組進(jìn)行高深度測序,然后進(jìn)行基因組組裝,獲得基因組的框架圖或者精細(xì)圖甚至是完成圖。從而可以快速解析其基因組結(jié)構(gòu)、基因功能、進(jìn)化關(guān)系。特別申明:不能采用過柱離心的方法提取總RNA。上海16s高通量測序產(chǎn)品
PacBio Sequel/RSII 該測序平臺主要承接細(xì)菌基因組完成圖測序、fungus基因組精細(xì)圖測序、全長轉(zhuǎn)錄本測序服務(wù)。上海地區(qū)16s高通量測序技術(shù)
單細(xì)胞測序技術(shù)的應(yīng)用:單細(xì)胞測序技術(shù)可以檢測復(fù)雜組織中單個細(xì)胞不同的生物學(xué)特性,這可以極大的幫助我們進(jìn)一步了解細(xì)胞與細(xì)胞之間的差異。"這幾乎就像通過幾顆星星看到了整個宇宙。"哈佛大學(xué)分子和細(xì)胞生物學(xué)教授 Alexander Schier的這句話應(yīng)用在這里也是很合適了。這幅圖正是來自于在2018年4月 Science 雜志發(fā)表的三篇[8-10]來自哈佛醫(yī)學(xué)院和哈佛大學(xué)的研究人員關(guān)于單細(xì)胞基因測序文章中的一幅結(jié)果圖,Alexander Schier教授也是其中一篇文章的作者。這幾篇文章使用多種檢測技術(shù)組合,其中包括對數(shù)千個發(fā)育中的斑馬魚和青蛙胚胎單細(xì)胞測序,在胚胎發(fā)育建議初的24小時內(nèi)追蹤單個細(xì)胞的發(fā)育情況,可以揭示出胚胎細(xì)胞何時何地轉(zhuǎn)變?yōu)樾碌募?xì)胞狀態(tài)和類型并向我們展示了組織和整個機(jī)體從單細(xì)胞發(fā)育的完整歷程。上海地區(qū)16s高通量測序技術(shù)
生工生物工程(上海)股份有限公司總部位于香閔路698號,是一家研發(fā)、生產(chǎn)化學(xué)試劑、生化試劑、生物試劑、耗材、小型儀器及生物工程相關(guān)產(chǎn)品(以上經(jīng)營涉及位險化學(xué)品的只有分裝業(yè)務(wù)),銷售公司自產(chǎn)產(chǎn)品并提供售后技術(shù)服務(wù);從事上述產(chǎn)品的同類商品(危險化學(xué)品限許可證規(guī)定范圍)的進(jìn)出口、批發(fā)、傭金代理(拍實除外)及相關(guān)配套服務(wù);提供生物工程技術(shù)服務(wù)、技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢。:提供倉儲業(yè)務(wù)。 【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目。經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的公司。公司自創(chuàng)立以來,投身于生化試劑,實驗耗材,實驗試劑,研發(fā),是醫(yī)藥健康的主力軍。生工生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺,以應(yīng)用為重點,以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,提供更優(yōu)服務(wù)。生工生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場需求,提高產(chǎn)品價值,是我們前行的力量。