上海市靶向捕獲高通量測(cè)序平臺(tái)

臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)不能透過(guò)活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜，故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高，可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。

通過(guò)顯微鏡使用血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果：明場(chǎng)（細(xì)胞未染色）：主要可以觀察懸液背景質(zhì)量（背景干凈，無(wú)雜質(zhì)碎片，無(wú)細(xì)胞團(tuán)塊）；臺(tái)盼藍(lán)場(chǎng)（細(xì)胞與臺(tái)盼藍(lán)染色后）：主要可以觀察活性（主要為活細(xì)胞，未染色藍(lán)色的為活細(xì)胞）；通過(guò)臺(tái)盼藍(lán)場(chǎng)計(jì)算活率：90%>80%；細(xì)胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來(lái)看，血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標(biāo)均符合上機(jī)標(biāo)準(zhǔn)，屬于高質(zhì)量單細(xì)胞懸液。 使用足量的干冰運(yùn)輸，并且盡量選用較快的郵遞方式，以降低運(yùn)輸過(guò)程中樣品降解的可能性。上海市靶向捕獲高通量測(cè)序平臺(tái)

全基因組測(cè)序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測(cè)序，其研究主要包括3個(gè)方面：第一種為不參考任何現(xiàn)有序列從頭組裝測(cè)序，是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行基因組測(cè)序，并綜合利用不同測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)工具對(duì)研究物種進(jìn)行序列拼接和修正，進(jìn)而獲得該物種的基因組序列圖譜；第二種為常見(jiàn)的全基因組重測(cè)序，是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體或群體的測(cè)序研究，建立一個(gè)測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行單個(gè)個(gè)體或不同個(gè)體混合池測(cè)序，發(fā)現(xiàn)遺傳變異標(biāo)記，進(jìn)行后續(xù)的研究；第三種是在已有參考基因組序列圖譜的基礎(chǔ)上，對(duì)不同品種的具有代表性個(gè)體建立多個(gè)文庫(kù)進(jìn)行全基因組從頭組裝測(cè)序，此方法能夠進(jìn)一步的進(jìn)行參考基因組的修補(bǔ)和發(fā)現(xiàn)短序列比對(duì)難以發(fā)現(xiàn)的遺傳變異。生工生物擁有眾多生物信息分析人才，可進(jìn)行專(zhuān)業(yè)的項(xiàng)目分析，為客戶(hù)提供個(gè)性化服務(wù)。上海地區(qū)多重PCR高通量測(cè)序服務(wù)對(duì)于需要進(jìn)行RNA抽提的部分特殊樣品，可以將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送。

生工高通量測(cè)序樣品要求，環(huán)境樣品：如果是新鮮土壤/污泥樣品，可以以冰袋運(yùn)輸，不超過(guò)3天;如果是凍存過(guò)的樣品（-20°C或者-80°C冰箱保存），為避免反復(fù)凍融，建議用足量的干冰（根據(jù)經(jīng)驗(yàn)，在秋冬季節(jié)，如果打包合適，3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時(shí)）寄送;如果是水體樣品，建議采用濾膜過(guò)濾后，將濾膜寄送來(lái)生工。生工不負(fù)責(zé)過(guò)濾。要求濾膜3張，冰袋運(yùn)輸，不超過(guò)3天。其余特殊環(huán)境樣品，具體咨詢(xún)生工高通量測(cè)序部。

DNA樣品：請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖，濃度>20 ng/μl，總量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA，可冰袋運(yùn)輸，不超過(guò)3天。

核酸適配體測(cè)序，項(xiàng)目介紹：核酸適配體是一類(lèi)能夠特異性地和靶物質(zhì)結(jié)合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白質(zhì)、金屬離子、小分子化合物、細(xì)胞膜表面受體等靶標(biāo)。其結(jié)合能力可與抗體相當(dāng)甚至更強(qiáng)，同時(shí)具有低免疫原性、 穩(wěn)定性好等特點(diǎn)，并可結(jié)合各種藥物及載體構(gòu)建多元復(fù)合靶向給藥系統(tǒng)用于tumour靶向treat, 在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域有潛在高價(jià)值。生工生物針對(duì)核酸適配體特殊結(jié)構(gòu)，結(jié)合Illumina MiSeq測(cè)序平臺(tái)，可以快速對(duì)核酸適配體文庫(kù)進(jìn)行大規(guī)模高通量測(cè)序，省去克隆測(cè)序的麻煩，提高測(cè)序深度，快速計(jì)算適配體序列頻率，方便科研客戶(hù)快速評(píng)估序列富集程度。PacBio Sequel/RSII 該測(cè)序平臺(tái)讀長(zhǎng)超長(zhǎng)，平均可達(dá)10 kb以上。

為什么要用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)？細(xì)胞是生物體結(jié)構(gòu)和功能的基本單位，在生物體生長(zhǎng)發(fā)育的過(guò)程中，因細(xì)胞類(lèi)型、外界環(huán)境以及內(nèi)部調(diào)節(jié)因素的不同，其轉(zhuǎn)錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程，以及在細(xì)胞分裂和分化過(guò)程中出現(xiàn)的誤差造成來(lái)自同一細(xì)胞系或個(gè)體的細(xì)胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細(xì)胞異質(zhì)性。細(xì)胞異質(zhì)性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測(cè)序檢測(cè)的是一個(gè)細(xì)胞群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組的信息，如培養(yǎng)的大量細(xì)胞、動(dòng)植物組織甚至是整個(gè)生物體。在過(guò)去的20多年中，人們對(duì)轉(zhuǎn)錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，卻無(wú)法揭示細(xì)胞的異質(zhì)性。傳統(tǒng)方法得到的是細(xì)胞群的平均基因組，而單細(xì)胞測(cè)序測(cè)量的是細(xì)胞群中單個(gè)細(xì)胞的基因組[7]?，F(xiàn)在也有學(xué)者為了區(qū)分傳統(tǒng)測(cè)序和單細(xì)胞測(cè)序的區(qū)別，將傳統(tǒng)方法稱(chēng)為批量測(cè)序。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序?qū)τ跇颖镜牧?，要求的也比較少。上海地區(qū)轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序應(yīng)用

Illumina HiSeq2500/4000 可以運(yùn)行PE150/PE250模式。上海市靶向捕獲高通量測(cè)序平臺(tái)

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，項(xiàng)目介紹：RNA-Seq，是基于新一代測(cè)序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法：首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的 RNA 并進(jìn)行 mRNA 富集，然后反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后進(jìn)行新一代高通量測(cè)序，在此基礎(chǔ)上進(jìn)行短片段拼接組裝，從而獲得一個(gè)個(gè)單獨(dú)轉(zhuǎn)錄本，進(jìn)而可以對(duì)該生物樣品當(dāng)前狀態(tài)的基因表達(dá)狀況有全局了解。對(duì)不同階段或部位生物樣品的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行 比較分析，則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達(dá)水平的變化，針對(duì)關(guān)鍵基因則可以進(jìn)行代謝通路（Pathway）的構(gòu)建。上海市靶向捕獲高通量測(cè)序平臺(tái)

生工生物工程（上海）股份有限公司是一家有著雄厚實(shí)力背景、信譽(yù)可靠、勵(lì)精圖治、展望未來(lái)、有夢(mèng)想有目標(biāo)，有組織有體系的公司，堅(jiān)持于帶領(lǐng)員工在未來(lái)的道路上大放光明，攜手共畫(huà)藍(lán)圖，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠(chéng)的客戶(hù)粉絲源，也收獲了良好的用戶(hù)口碑，為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ)，也希望未來(lái)公司能成為*****，努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻(xiàn)出自己的一份力量，我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強(qiáng)不息，斗志昂揚(yáng)的的企業(yè)精神將**生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌，共創(chuàng)佳績(jī)，一直以來(lái)，公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠(chéng)實(shí)守信的方針，員工精誠(chéng)努力，協(xié)同奮取，以品質(zhì)、服務(wù)來(lái)贏得市場(chǎng)，我們一直在路上！