全轉錄組測序(Total RNA-Seq),項目介紹:全轉錄組是指特定細胞在特定狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA(non-coding RNA)。針對非編碼RNA的研究主要集中在具有調控作用的miRNA,lncRNA和circRNA?;诙鷾y序技術的全轉錄組測序研究,同時分析同一樣本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA,并且通過關聯(lián)分析,使研究內容更加系統(tǒng)化,致力于深入挖掘生命現象背后的轉錄調控問題。組織樣品或者總 RNA, 樣品名稱清晰,干冰運輸。寄送RNA樣品請置于1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Parafilm封口。上海市單細胞測序高通量測序平臺
懸液制備好后質檢結果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細胞懸液質檢關卡究竟是怎樣運作的呢?單細胞懸液質控要求:?細胞濃度:700-1200cells/μl;?細胞活率>80%(當細胞懸液活率低于70%時建議進行去除死細胞處理);細胞團及碎片雜質<5%(無細胞粘連,無明顯的細胞碎片和細胞團,并保證細胞的完整性);?細胞狀態(tài):細胞直徑在7-40um之間(細胞直徑過大則建議進行抽核處理);?不存在逆轉錄抑制劑和非細胞的核酸分子。上海單細胞測序高通量測序項目什么是KBSeq全質粒測序?
通過顯微鏡使用血球計數板質檢能觀察到懸液背景質量和細胞數目及活性的評估。讓我們再來回顧一下臺盼藍染色原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內而使死細胞染成淡藍色。怎樣通過血球計數板進行質檢操作呢?將血球計數板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計數板上;將細胞懸液混勻(或10μl臺盼藍+10μl細胞懸液),吸出10μl懸液至計數板上蓋玻片的一側使細胞核懸液鋪滿蓋玻片和計數板之間;在顯微鏡下分別對V1/V2/V3/V4四個計數區(qū)域進行計數;按細胞計數公式進行計算,計算公式:細胞總數={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*懸液體積*稀釋倍數,V1/V2/V3/V4為各個計數區(qū)的細胞數目,細胞活率=活細胞數目/總細胞數目*100%。
生工高通量測序樣品要求,RNA樣品:請?zhí)峁舛取?50 ng/μl、總量≥2μg的總RNA樣品,樣品請去蛋白并進行DNase處理;請務必提供每個樣品具體的濃度、體積、制備時間以及物種來源。比較好附上QC數據,可以是電泳膠圖、分光光度值、Nanodrop儀器檢測數據或者Agilent Bioanalyzer儀器檢測數據等;一般情況下,轉錄組測序需要Agilent Bioanalyzer儀器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥7;小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒,可選擇傳統(tǒng)總RNA提取法(如乙醇沉淀、異丙醇沉淀等)或者選用專門的小RNA提取試劑盒;寄送RNA樣品請置于1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Parafilm封口。在運輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中,再將50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰運輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。X儀器本身有16個通道(Controller為8通道),每個通道極限多捕獲20000個細胞(Controller為10000個細胞) 。
長鏈非編碼RNA(lncRNA)測序(只限有參考基因組物種),項目介紹:長鏈非編碼RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一類轉錄本長度大于200 nt且不編碼蛋白質的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各種生物體內。哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產生的轉錄本是LncRNA(相應的蛋白編碼RNA比例是1%)。近年來研究表明,LncRNA參與了多種重要的調控過程,如X染色體沉默、基因組印記及染色質修飾等。通過LncRNA測序,可以快速獲得與其生物學過程或者疾病相關的LncRNA的表達變化,從而促進LncRNA的深入研究。特別申明:不能采用過柱離心的方法提取總RNA。上海單細胞測序高通量測序項目
DNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內或其他類似容器里,并旋緊蓋子。上海市單細胞測序高通量測序平臺
微生物基因組重測序(有參):目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進行進行物種進化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術,對有參考基因組微生物進行多個體的基因組重測序,精細分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。微生物基因組從頭測序(無參):對于不斷分離培養(yǎng)微生物的客戶來說,要確定一個菌株是否是新菌株或者新菌種,較快捷的辦法就是,直接進行基因組測序。利用高通量測序技術,對這些基因組進行高深度測序,然后進行基因組組裝,獲得基因組的框架圖或者精細圖甚至是完成圖。從而可以快速解析其基因組結構、基因功能、進化關系。上海市單細胞測序高通量測序平臺
生工生物工程(上海)股份有限公司是一家有著雄厚實力背景、信譽可靠、勵精圖治、展望未來、有夢想有目標,有組織有體系的公司,堅持于帶領員工在未來的道路上大放光明,攜手共畫藍圖,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠的客戶粉絲源,也收獲了良好的用戶口碑,為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎,也希望未來公司能成為*****,努力為行業(yè)領域的發(fā)展奉獻出自己的一份力量,我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強不息,斗志昂揚的的企業(yè)精神將**生工生物工程供應和您一起攜手步入輝煌,共創(chuàng)佳績,一直以來,公司貫徹執(zhí)行科學管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠實守信的方針,員工精誠努力,協(xié)同奮取,以品質、服務來贏得市場,我們一直在路上!