上海市靶向捕獲高通量測(cè)序高通量

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-09-05

生工外顯子測(cè)序,項(xiàng)目介紹:已知人類基因組上有180000個(gè)外顯子,占整個(gè)基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負(fù)責(zé)編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復(fù)雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測(cè) 序,全外顯子捕獲測(cè)序有測(cè)序深度高、價(jià)格便宜的優(yōu)勢(shì),性價(jià)比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行深度測(cè)序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測(cè),形成完整的分析報(bào)告。特別申明:不能采用過(guò)柱離心的方法提取總RNA。上海市靶向捕獲高通量測(cè)序高通量

懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細(xì)胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運(yùn)作的呢?單細(xì)胞懸液質(zhì)控要求:?細(xì)胞濃度:700-1200cells/μl;?細(xì)胞活率>80%(當(dāng)細(xì)胞懸液活率低于70%時(shí)建議進(jìn)行去除死細(xì)胞處理);細(xì)胞團(tuán)及碎片雜質(zhì)<5%(無(wú)細(xì)胞粘連,無(wú)明顯的細(xì)胞碎片和細(xì)胞團(tuán),并保證細(xì)胞的完整性);?細(xì)胞狀態(tài):細(xì)胞直徑在7-40um之間(細(xì)胞直徑過(guò)大則建議進(jìn)行抽核處理);?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細(xì)胞的核酸分子。上海宏基因組高通量測(cè)序高通量小RNA測(cè)測(cè)序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒。

高通量測(cè)序技術(shù)是可以平行對(duì)數(shù)百萬(wàn)甚至數(shù)十億條序列測(cè)序的技術(shù)。在基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、宏基因組測(cè)序、表觀遺傳測(cè)序、外顯子捕獲測(cè)序、靶區(qū)域測(cè)序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測(cè)領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運(yùn)用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量測(cè)序部以來(lái),逐步引進(jìn)了Illumina,Life,PacBio等二代/三代測(cè)序平臺(tái)。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室(通過(guò)了國(guó)家ISO認(rèn)證)以及10PB級(jí)運(yùn)算能力的服務(wù)器集群,能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時(shí),生工高通量測(cè)序團(tuán)隊(duì)建設(shè)也在不斷完善中,目前有50余專職員工,其中高級(jí)技術(shù)人員以及高級(jí)生物信息工程師占比50%以上,5年來(lái),通過(guò)生工高通量測(cè)序結(jié)果發(fā)表的文章累計(jì)影響因子超過(guò)1000分以上。

對(duì)于微生物樣品,請(qǐng)客戶如實(shí)聲明所屬物種;對(duì)于可能致病的微生物,生工將拒收。以固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需將樣品從培養(yǎng)基上刮取下來(lái),用干冰寄送;以液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需離心后棄培養(yǎng)液收集樣品,用RNA組織保存液(例如RNA-Be-Locker A)保存,以干冰或冰袋寄送;沒(méi)有RNA組織保存液的情況下,也可用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量干冰寄送。***樣品送樣量需至少達(dá)到100 mg/樣;細(xì)菌樣品送樣量需至少達(dá)到107(10的7次方)數(shù)量級(jí),同時(shí),在與樣本一同寄送的送樣表上,標(biāo)明屬于革蘭氏陽(yáng)性菌(G+)還是革蘭氏陰性菌(G-)。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序指在單細(xì)胞水平上對(duì) mRNA 進(jìn)行高通量測(cè)序和分析的技術(shù)。

長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)測(cè)序(只限有參考基因組物種),項(xiàng)目介紹:長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一類轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度大于200 nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各種生物體內(nèi)。哺乳動(dòng)物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是LncRNA(相應(yīng)的蛋白編碼RNA比例是1%)。近年來(lái)研究表明,LncRNA參與了多種重要的調(diào)控過(guò)程,如X染色體沉默、基因組印記及染色質(zhì)修飾等。通過(guò)LncRNA測(cè)序,可以快速獲得與其生物學(xué)過(guò)程或者疾病相關(guān)的LncRNA的表達(dá)變化,從而促進(jìn)LncRNA的深入研究。DNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子。上海市靶向捕獲高通量測(cè)序高通量

ChIP項(xiàng)目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0檢測(cè)為準(zhǔn)。其余具體咨詢生工高通量測(cè)序部。上海市靶向捕獲高通量測(cè)序高通量

生工靶向捕獲測(cè)序,項(xiàng)目介紹:利用序列捕獲技術(shù)將基因組特定區(qū)域DNA捕捉并富集后進(jìn)行高通量測(cè)序的基因組分析方法。全外顯子測(cè)序即通過(guò)對(duì)某一基因組中的所有外顯子進(jìn)行測(cè)序從而獲得所有外顯子區(qū)域內(nèi)的突變信息。由于該技術(shù)在臨床上的潛力,被《科學(xué)》雜志評(píng)為2010年科學(xué)進(jìn)展之一。外顯子組測(cè)序可用于尋找單基因疾病、復(fù)雜疾?。ㄈ缣悄虿?、肥胖癥等代謝綜合癥)、甚至是cancer的致病基因或易感基因。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行深度測(cè)序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測(cè),形成完整的分析報(bào)告。上海市靶向捕獲高通量測(cè)序高通量

生工生物工程(上海)股份有限公司是一家有著雄厚實(shí)力背景、信譽(yù)可靠、勵(lì)精圖治、展望未來(lái)、有夢(mèng)想有目標(biāo),有組織有體系的公司,堅(jiān)持于帶領(lǐng)員工在未來(lái)的道路上大放光明,攜手共畫(huà)藍(lán)圖,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠(chéng)的客戶粉絲源,也收獲了良好的用戶口碑,為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ),也希望未來(lái)公司能成為*****,努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻(xiàn)出自己的一份力量,我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強(qiáng)不息,斗志昂揚(yáng)的的企業(yè)精神將**生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌,共創(chuàng)佳績(jī),一直以來(lái),公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠(chéng)實(shí)守信的方針,員工精誠(chéng)努力,協(xié)同奮取,以品質(zhì)、服務(wù)來(lái)贏得市場(chǎng),我們一直在路上!

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