2021年11月1日,在這個(gè)平凡而又特殊的日子里,生工生物高通量測(cè)序部迎來了一位新成員——10xGenomics Chromium X!不要看我們個(gè)頭小,我們可是百萬級(jí)單細(xì)胞捕獲神器吆。X是如何實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行有這么高的吞吐量呢?多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個(gè)通道(Controller為8通道),每個(gè)通道比較多捕獲20000個(gè)細(xì)胞(Controller為10000個(gè)細(xì)胞)。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù),每個(gè)通道比較多可捕獲60,000個(gè)細(xì)胞,去除雙細(xì)胞率后,每張芯片比較多可捕獲750,000個(gè)單細(xì)胞。準(zhǔn)確、迅速,可以說是KBSeq的代名詞了。上海市高通量測(cè)序高通量
生工人、大、小鼠全基因組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:人或者大、小鼠全部基因組重測(cè)序,研究其突變信息(包括SNP/InDel/CNV/SV),并注釋突變位點(diǎn)信息。該技術(shù)可同時(shí)獲取編碼區(qū)及非編碼區(qū)突變信息,被廣泛應(yīng)用于遺傳病、tumour及其它其它疾病研究中。測(cè)序平臺(tái):HiSeq XTen平臺(tái)進(jìn)行PE150測(cè)序。生工微生物基因組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:微生物基因組重測(cè)序(有參)目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對(duì)某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)有參考基因組微生物進(jìn)行多個(gè)體的基因組重測(cè)序,精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。上海地區(qū)18s高通量測(cè)序高通量如果問現(xiàn)在什么技術(shù)是測(cè)序?qū)玫膶檭?,那么單?xì)胞測(cè)序則是我們不得不提及的技術(shù)了。
樣本寄送時(shí),請(qǐng)將填寫完整的紙質(zhì)版《高通量測(cè)序送樣表》密封于塑料袋內(nèi),隨樣本一起寄出,紙質(zhì)版的樣本信息單用于樣本接收人員在收到樣本后及時(shí)并正確的保存并錄入樣本,如無紙質(zhì)版的樣本信息單可能會(huì)延誤項(xiàng)目周期;樣本管壁或管蓋上標(biāo)明的樣本名稱需要與《高通量測(cè)序送樣表》里樣本名稱一致,這樣可以避免我們收到樣本后與您確認(rèn)樣本編號(hào)而耽誤樣本質(zhì)檢、提取實(shí)驗(yàn);如有特殊情況,請(qǐng)?jiān)凇陡咄繙y(cè)序送樣表》中注明;樣品編號(hào)請(qǐng)避免使用中文、羅馬數(shù)字、“-”以及特殊符號(hào)標(biāo)示,避免分析的時(shí)候系統(tǒng)無法識(shí)別,導(dǎo)致分析無法完成;我們分析人員建議編號(hào)可以采用英文字母與阿拉伯?dāng)?shù)字結(jié)合的形式,字符比較好不要過長,避免繪制部分分析圖的時(shí)候難以全部展示。
生工CHIP-Seq,項(xiàng)目介紹:CHIP-SEQ 技術(shù),即染色質(zhì)免疫共沉淀與高通量測(cè)序相結(jié)合的技術(shù)。它是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA 相互作用的有力工具,還可以用來研究轉(zhuǎn)錄因子與基因表達(dá)的關(guān)系。通過高通量測(cè)序,可以一次性得到目的蛋白在整個(gè)基因組上的結(jié)合分布,得到目的蛋白精確的結(jié)合位點(diǎn)以及結(jié)合基序等信息。ChIP-Seq 的原理:首先通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP)特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA 的所屬片段,并對(duì)其進(jìn)行純化與文庫構(gòu)建;然后對(duì)富集得到的DNA的片段進(jìn)行高通量測(cè)序,將獲得的數(shù)百萬條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA 區(qū)段信息。特別申明:不能采用過柱離心的方法提取總RNA。
通過顯微鏡使用血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果:明場(細(xì)胞未染色):主要可以觀察懸液背景質(zhì)量(背景干凈,無雜質(zhì)碎片,無細(xì)胞團(tuán)塊);臺(tái)盼藍(lán)場(細(xì)胞與臺(tái)盼藍(lán)染色后):主要可以觀察活性(主要為活細(xì)胞,未染色藍(lán)色的為活細(xì)胞);通過臺(tái)盼藍(lán)場計(jì)算活率:90%>80%;細(xì)胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來看,血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標(biāo)均符合上機(jī)標(biāo)準(zhǔn),屬于高質(zhì)量單細(xì)胞懸液。以上就是我們本次的單細(xì)胞懸液質(zhì)檢指南分享啦。小RNA測(cè)測(cè)序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒。上海市生工生物 高通量測(cè)序NGS
PacBio Sequel/RSII 該測(cè)序平臺(tái)主要承接細(xì)菌基因組完成圖測(cè)序、fungus基因組精細(xì)圖測(cè)序、全長轉(zhuǎn)錄本測(cè)序服務(wù)。上海市高通量測(cè)序高通量
高通量測(cè)序技術(shù)是可以平行對(duì)數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測(cè)序的技術(shù)。在基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、宏基因組測(cè)序、表觀遺傳測(cè)序、外顯子捕獲測(cè)序、靶區(qū)域測(cè)序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測(cè)領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運(yùn)用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量測(cè)序部以來,逐步引進(jìn)了Illumina,Life,PacBio等二代/三代測(cè)序平臺(tái)。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室(通過了國家ISO認(rèn)證)以及10PB級(jí)運(yùn)算能力的服務(wù)器集群,能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時(shí),生工高通量測(cè)序團(tuán)隊(duì)建設(shè)也在不斷完善中,目前有50余專職員工,其中高級(jí)技術(shù)人員以及高級(jí)生物信息工程師占比50%以上,5年來,通過生工高通量測(cè)序結(jié)果發(fā)表的文章累計(jì)影響因子超過1000分以上。上海市高通量測(cè)序高通量
生工生物工程(上海)股份有限公司在同行業(yè)領(lǐng)域中,一直處在一個(gè)不斷銳意進(jìn)取,不斷制造創(chuàng)新的市場高度,多年以來致力于發(fā)展富有創(chuàng)新價(jià)值理念的產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn),在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的商業(yè)口碑,成績讓我們喜悅,但不會(huì)讓我們止步,殘酷的市場磨煉了我們堅(jiān)強(qiáng)不屈的意志,和諧溫馨的工作環(huán)境,富有營養(yǎng)的公司土壤滋養(yǎng)著我們不斷開拓創(chuàng)新,勇于進(jìn)取的無限潛力,生工生物工程供應(yīng)攜手大家一起走向共同輝煌的未來,回首過去,我們不會(huì)因?yàn)槿〉昧艘稽c(diǎn)點(diǎn)成績而沾沾自喜,相反的是面對(duì)競爭越來越激烈的市場氛圍,我們更要明確自己的不足,做好迎接新挑戰(zhàn)的準(zhǔn)備,要不畏困難,激流勇進(jìn),以一個(gè)更嶄新的精神面貌迎接大家,共同走向輝煌回來!