上海宏全基因組高通量測(cè)序服務(wù)

臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)不能透過(guò)活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜，故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高，可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。

通過(guò)顯微鏡使用血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果：明場(chǎng)（細(xì)胞未染色）：主要可以觀察懸液背景質(zhì)量（背景干凈，無(wú)雜質(zhì)碎片，無(wú)細(xì)胞團(tuán)塊）；臺(tái)盼藍(lán)場(chǎng)（細(xì)胞與臺(tái)盼藍(lán)染色后）：主要可以觀察活性（主要為活細(xì)胞，未染色藍(lán)色的為活細(xì)胞）；通過(guò)臺(tái)盼藍(lán)場(chǎng)計(jì)算活率：90%>80%；細(xì)胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來(lái)看，血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標(biāo)均符合上機(jī)標(biāo)準(zhǔn)，屬于高質(zhì)量單細(xì)胞懸液。 如果問(wèn)現(xiàn)在什么技術(shù)是測(cè)序?qū)玫膶檭?，那么單?xì)胞測(cè)序則是我們不得不提及的技術(shù)了。上海宏全基因組高通量測(cè)序服務(wù)

生工人線粒體基因組測(cè)序（多重?cái)U(kuò)增法），項(xiàng)目介紹：生工生物高通量測(cè)序部采用多重?cái)U(kuò)增技術(shù)，對(duì)人線粒體基因組進(jìn)行擴(kuò)增捕獲，并進(jìn)一步采用Illumina測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序。該技術(shù)方案可以快速擴(kuò)增到幾乎線粒體全長(zhǎng)，并進(jìn)行高深度測(cè)序，下游提供常規(guī)比對(duì)篩查突變等生物信息分析。客戶提供樣品類(lèi)型：1.人來(lái)源DNA，濃度大于1ng/ul，總量大于20ng，以Qubit檢測(cè)結(jié)果為準(zhǔn)2.運(yùn)輸條件：冰袋運(yùn)輸。交付信息：1.測(cè)序原始數(shù)據(jù)交付實(shí)驗(yàn)報(bào)告2.測(cè)序原始數(shù)據(jù)3.突變分析結(jié)果。上海宏全基因組高通量測(cè)序服務(wù)為什么要用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)？

高通量測(cè)序技術(shù)是可以平行對(duì)數(shù)百萬(wàn)甚至數(shù)十億條序列測(cè)序的技術(shù)。在基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、宏基因組測(cè)序、表觀遺傳測(cè)序、外顯子捕獲測(cè)序、靶區(qū)域測(cè)序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測(cè)領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運(yùn)用。生工生物工程（上海）股份有限公司自2011年成立高通量測(cè)序部以來(lái)，逐步引進(jìn)了Illumina，Life，PacBio等二代/三代測(cè)序平臺(tái)。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室（通過(guò)了國(guó)家ISO認(rèn)證）以及10PB級(jí)運(yùn)算能力的服務(wù)器集群，能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時(shí)，生工高通量測(cè)序團(tuán)隊(duì)建設(shè)也在不斷完善中，目前有50余專職員工，其中高級(jí)技術(shù)人員以及高級(jí)生物信息工程師占比50%以上，5年來(lái)，通過(guò)生工高通量測(cè)序結(jié)果發(fā)表的文章累計(jì)影響因子超過(guò)1000分以上。

2021年11月1日，在這個(gè)平凡而又特殊的日子里，生工生物高通量測(cè)序部迎來(lái)了一位新成員——10xGenomics Chromium X！不要看我們個(gè)頭小，我們可是百萬(wàn)級(jí)單細(xì)胞捕獲神器吆。X是如何實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行有這么高的吞吐量呢？多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個(gè)通道（Controller為8通道），每個(gè)通道比較多捕獲20000個(gè)細(xì)胞（Controller為10000個(gè)細(xì)胞）。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)，每個(gè)通道比較多可捕獲60,000個(gè)細(xì)胞，去除雙細(xì)胞率后，每張芯片比較多可捕獲750,000個(gè)單細(xì)胞。請(qǐng)注意選擇無(wú)RNA酶的容器盛放樣本，盡量避免RNA降解。

對(duì)于微生物樣品，請(qǐng)客戶如實(shí)聲明所屬物種；對(duì)于可能致病的微生物，生工將拒收。以固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品，需將樣品從培養(yǎng)基上刮取下來(lái)，用干冰寄送；以液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品，需離心后棄培養(yǎng)液收集樣品，用RNA組織保存液（例如RNA-Be-Locker A）保存，以干冰或冰袋寄送；沒(méi)有RNA組織保存液的情況下，也可用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C 冰箱，埋于足量干冰寄送。***樣品送樣量需至少達(dá)到100 mg/樣；細(xì)菌樣品送樣量需至少達(dá)到107（10的7次方）數(shù)量級(jí)，同時(shí)，在與樣本一同寄送的送樣表上，標(biāo)明屬于革蘭氏陽(yáng)性菌（G+）還是革蘭氏陰性菌（G-）。寄送 RNA 樣品請(qǐng)置于 1.5 ml 離心管中，管上注明樣品名稱、濃度以及制備時(shí)間，管口使用 Parafilm 封口。上海市SNP高通量測(cè)序產(chǎn)品

RNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好，并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類(lèi)似容器里，并旋緊蓋子。上海宏全基因組高通量測(cè)序服務(wù)

small RNA測(cè)序，項(xiàng)目簡(jiǎn)介：Small RNA是一類(lèi)重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子，長(zhǎng)度在18-30 nt之間，主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導(dǎo)基因沉默，參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控，從而調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)、分化，以及個(gè)體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過(guò)程。高通量測(cè)序技術(shù)可以對(duì)樣本中所有small RNA家族進(jìn)行測(cè)序和表達(dá)定量，從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應(yīng)靶序列。測(cè)序使用Illumina Xten平臺(tái)，測(cè)序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后，進(jìn)行Clean reads 長(zhǎng)度分布統(tǒng)計(jì)，small RNA注釋，已知 miRNA 注釋，已知piRNA注釋，ncRNA分析，新 miRNA 預(yù)測(cè)（有參考基因組），差異基因可視化分析，miRNA 家族分析，差異表達(dá) miRNA 聚類(lèi)分析，miRNA靶基因預(yù)測(cè)，靶基因GO、KEGG富集分析。上海宏全基因組高通量測(cè)序服務(wù)

生工生物工程（上海）股份有限公司匯集了大量的優(yōu)秀人才，集企業(yè)奇思，創(chuàng)經(jīng)濟(jì)奇跡，一群有夢(mèng)想有朝氣的團(tuán)隊(duì)不斷在前進(jìn)的道路上開(kāi)創(chuàng)新天地，繪畫(huà)新藍(lán)圖，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的信譽(yù)，信奉著“爭(zhēng)取每一個(gè)客戶不容易，失去每一個(gè)用戶很簡(jiǎn)單”的理念，市場(chǎng)是企業(yè)的方向，質(zhì)量是企業(yè)的生命，在公司有效方針的領(lǐng)導(dǎo)下，全體上下，團(tuán)結(jié)一致，共同進(jìn)退，**協(xié)力把各方面工作做得更好，努力開(kāi)創(chuàng)工作的新局面，公司的新高度，未來(lái)生工生物工程供應(yīng)和您一起奔向更美好的未來(lái)，即使現(xiàn)在有一點(diǎn)小小的成績(jī)，也不足以驕傲，過(guò)去的種種都已成為昨日我們只有總結(jié)經(jīng)驗(yàn)，才能繼續(xù)上路，讓我們一起點(diǎn)燃新的希望，放飛新的夢(mèng)想！