長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)測(cè)序(只限有參考基因組物種),項(xiàng)目介紹:長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一類(lèi)轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度大于200 nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各種生物體內(nèi)。哺乳動(dòng)物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是LncRNA(相應(yīng)的蛋白編碼RNA比例是1%)。近年來(lái)研究表明,LncRNA參與了多種重要的調(diào)控過(guò)程,如X染色體沉默、基因組印記及染色質(zhì)修飾等。通過(guò)LncRNA測(cè)序,可以快速獲得與其生物學(xué)過(guò)程或者疾病相關(guān)的LncRNA的表達(dá)變化,從而促進(jìn)LncRNA的深入研究。RNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類(lèi)似容器里,并旋緊蓋子。上海地區(qū)全質(zhì)粒測(cè)序高通量測(cè)序高通量
使用顯微鏡進(jìn)行懸液質(zhì)檢操作時(shí)應(yīng)注意:1.使用血球計(jì)數(shù)板時(shí),可以提前鏡檢觀察每小格計(jì)數(shù)室內(nèi)是否潔凈無(wú)雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層,則需要多次清洗,直至計(jì)數(shù)室潔凈無(wú)瑕;2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴(kuò)口***頭吹打混勻;3.臺(tái)盼藍(lán)染色后需要盡快完成細(xì)胞計(jì)數(shù),一般建議不要超過(guò)10分鐘;4.如果方格中細(xì)胞數(shù)目過(guò)多,難以數(shù)清,應(yīng)當(dāng)對(duì)細(xì)胞懸液進(jìn)行稀釋以便于計(jì)數(shù);5.對(duì)于壓在方格界線上的細(xì)胞應(yīng)當(dāng)計(jì)數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細(xì)胞數(shù),一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線,數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理,另兩邊不計(jì)數(shù)。上海多重?cái)U(kuò)增高通量測(cè)序服務(wù)組織材料樣品(提取RNA用)建議將標(biāo)簽用膠帶貼到管壁,干冰運(yùn)輸。
通過(guò)顯微鏡使用血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果:明場(chǎng)(細(xì)胞未染色):主要可以觀察懸液背景質(zhì)量(背景干凈,無(wú)雜質(zhì)碎片,無(wú)細(xì)胞團(tuán)塊);臺(tái)盼藍(lán)場(chǎng)(細(xì)胞與臺(tái)盼藍(lán)染色后):主要可以觀察活性(主要為活細(xì)胞,未染色藍(lán)色的為活細(xì)胞);通過(guò)臺(tái)盼藍(lán)場(chǎng)計(jì)算活率:90%>80%;細(xì)胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來(lái)看,血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標(biāo)均符合上機(jī)標(biāo)準(zhǔn),屬于高質(zhì)量單細(xì)胞懸液。以上就是我們本次的單細(xì)胞懸液質(zhì)檢指南分享啦。
單細(xì)胞懸液質(zhì)檢方法,在進(jìn)行單細(xì)胞懸液質(zhì)檢時(shí),需要用到以下兩大質(zhì)檢利器的輔助:熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀(主要使用臺(tái)盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色法)進(jìn)行質(zhì)檢。首先我們先要了解一下細(xì)胞質(zhì)檢時(shí)染料染色的原理:臺(tái)盼藍(lán)染色原理:臺(tái)盼藍(lán)不能透過(guò)活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜,故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高,可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀檢測(cè)結(jié)果可以讓我們直觀的看到:細(xì)胞濃度(總細(xì)胞,活細(xì)胞,死細(xì)胞)、細(xì)胞存活率(臺(tái)盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色)、細(xì)胞平均直徑、細(xì)胞聚團(tuán)率、細(xì)胞直徑分布等結(jié)果的展示。如果是水體樣品,建議采用濾膜過(guò)濾后,將濾膜寄送來(lái)生工。
small RNA測(cè)序,項(xiàng)目簡(jiǎn)介:Small RNA是一類(lèi)重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,長(zhǎng)度在18-30 nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導(dǎo)基因沉默,參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)、分化,以及個(gè)體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過(guò)程。高通量測(cè)序技術(shù)可以對(duì)樣本中所有small RNA家族進(jìn)行測(cè)序和表達(dá)定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應(yīng)靶序列。測(cè)序使用Illumina Xten平臺(tái),測(cè)序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后,進(jìn)行Clean reads 長(zhǎng)度分布統(tǒng)計(jì),small RNA注釋?zhuān)阎?miRNA 注釋?zhuān)阎猵iRNA注釋?zhuān)琻cRNA分析,新 miRNA 預(yù)測(cè)(有參考基因組),差異基因可視化分析,miRNA 家族分析,差異表達(dá) miRNA 聚類(lèi)分析,miRNA靶基因預(yù)測(cè),靶基因GO、KEGG富集分析。關(guān)鍵是KBSeq還可以省錢(qián)。上海地區(qū)lncRNA高通量測(cè)序應(yīng)用
請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運(yùn)輸,不超過(guò)3天。上海地區(qū)全質(zhì)粒測(cè)序高通量測(cè)序高通量
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序技術(shù)可以檢測(cè)復(fù)雜組織中單個(gè)細(xì)胞不同的生物學(xué)特性,這可以極大的幫助我們進(jìn)一步了解細(xì)胞與細(xì)胞之間的差異。"這幾乎就像通過(guò)幾顆星星看到了整個(gè)宇宙。"哈佛大學(xué)分子和細(xì)胞生物學(xué)教授 Alexander Schier的這句話應(yīng)用在這里也是很合適了。這幅圖正是來(lái)自于在2018年4月 Science 雜志發(fā)表的三篇[8-10]來(lái)自哈佛醫(yī)學(xué)院和哈佛大學(xué)的研究人員關(guān)于單細(xì)胞基因測(cè)序文章中的一幅結(jié)果圖,Alexander Schier教授也是其中一篇文章的作者。這幾篇文章使用多種檢測(cè)技術(shù)組合,其中包括對(duì)數(shù)千個(gè)發(fā)育中的斑馬魚(yú)和青蛙胚胎單細(xì)胞測(cè)序,在胚胎發(fā)育建議初的24小時(shí)內(nèi)追蹤單個(gè)細(xì)胞的發(fā)育情況,可以揭示出胚胎細(xì)胞何時(shí)何地轉(zhuǎn)變?yōu)樾碌募?xì)胞狀態(tài)和類(lèi)型并向我們展示了組織和整個(gè)機(jī)體從單細(xì)胞發(fā)育的完整歷程。上海地區(qū)全質(zhì)粒測(cè)序高通量測(cè)序高通量
生工生物工程(上海)股份有限公司在同行業(yè)領(lǐng)域中,一直處在一個(gè)不斷銳意進(jìn)取,不斷制造創(chuàng)新的市場(chǎng)高度,多年以來(lái)致力于發(fā)展富有創(chuàng)新價(jià)值理念的產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn),在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的商業(yè)口碑,成績(jī)讓我們喜悅,但不會(huì)讓我們止步,殘酷的市場(chǎng)磨煉了我們堅(jiān)強(qiáng)不屈的意志,和諧溫馨的工作環(huán)境,富有營(yíng)養(yǎng)的公司土壤滋養(yǎng)著我們不斷開(kāi)拓創(chuàng)新,勇于進(jìn)取的無(wú)限潛力,生工生物工程供應(yīng)攜手大家一起走向共同輝煌的未來(lái),回首過(guò)去,我們不會(huì)因?yàn)槿〉昧艘稽c(diǎn)點(diǎn)成績(jī)而沾沾自喜,相反的是面對(duì)競(jìng)爭(zhēng)越來(lái)越激烈的市場(chǎng)氛圍,我們更要明確自己的不足,做好迎接新挑戰(zhàn)的準(zhǔn)備,要不畏困難,激流勇進(jìn),以一個(gè)更嶄新的精神面貌迎接大家,共同走向輝煌回來(lái)!